RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NLRP13Q86W25 1043 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLIN1O60240 522 aa23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERBINQ96RT1 1412 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UNC13BO14795 1591 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.32e-6■■■□□ 19.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP7AQ04656 1500 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZMYND15Q9H091 742 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POGKQ9P215 609 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLCN1P35523 988 aa23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEO1Q92859 1461 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GLI2P10070 1586 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BECN1Q14457 450 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIP2BQ9P265 1576 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP19O94966 1318 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAPGEF3O95398 923 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLA2R1Q13018 1463 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF3BO15066 747 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FSD2A1L4K1 749 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DEPDC5O75140 1603 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RGS3P49796 1198 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A2MP01023 1474 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NLRP1Q9C000 1473 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP10AO60312 1499 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KANK1Q14678 1352 aa22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCA6Q8N139 1617 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RICTORQ6R327 1708 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF521Q96K83 1311 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TET3O43151 1660 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSPOAP1O95153 1857 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRE11P49959 708 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RGL3Q3MIN7 710 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PANK2Q9BZ23 570 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPRTO14522 1441 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA2Q08379 1002 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZMYM3Q14202 1370 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MCM4P33991 863 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GGT6Q6P531 493 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SEC24BO95487 1268 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRPM2O94759 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TPM2P07951 284 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LAMC1P11047 1609 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ESPNB1AK53 854 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.75■■□□□ 1.23
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