RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Uggt2E9Q4X2 1504 aa29.91■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AnkarA2RT91 1465 aa29.9■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sall3Q62255 1320 aa29.89■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myo5cE9Q1F5 1742 aa29.89■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Esx1O88933 382 aa29.89■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa29.89■■■□□ 2.38
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa29.89■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam184bQ0KK56 942 aa29.88■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Igf1rQ60751 1373 aa29.87■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29.84■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ipo9Q91YE6 1041 aa29.84■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TnikP83510 1323 aa29.84■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kif3bQ61771 747 aa29.83■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ak9G3UYQ4 1894 aa29.83■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Os9Q8K2C7 672 aa29.83■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kif16bB1AVY7 1312 aa29.83■■■□□ 2.37
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa29.82■■■□□ 2.36
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm20521D3Z5F7 333 aa29.8■■■□□ 2.36
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfyve16Q80U44 1528 aa29.8■■■□□ 2.36
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc41Q692V3 1318 aa29.79■■■□□ 2.36
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atf7ipQ7TT18 1306 aa29.78■■■□□ 2.36
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nos1Q9Z0J4 1429 aa29.77■■■□□ 2.36
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc21bQ0HA38 1315 aa29.76■■■□□ 2.35
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fndc1E9Q043 1732 aa29.74■■■□□ 2.35
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa29.73■■■□□ 2.35
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stk24Q99KH8 431 aa29.72■■■□□ 2.35
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Iqgap3F8VQ29 1632 aa29.71■■■□□ 2.35
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abca6Q8K441 1624 aa29.71■■■□□ 2.35
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa29.7■■■□□ 2.35
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Col17a1Q07563 1470 aa29.7■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa29.7■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bcl11aQ9QYE3 773 aa29.7■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lemd3Q9WU40 921 aa29.7■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stard8Q8K031 1019 aa29.68■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kif7B7ZNG0 1348 aa29.68■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp40Q8BWR4 1235 aa29.67■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fan1Q69ZT1 1020 aa29.65■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plekhh1Q80TI1 1356 aa29.65■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myo3aQ8K3H5 1613 aa29.65■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abca8aQ8K442 1620 aa29.64■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rwdd1Q9CQK7 243 aa29.64■■■□□ 2.34
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nlrp6Q91WS2 869 aa29.63■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nphp4P59240 1425 aa29.62■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc27Q3V036 639 aa29.61■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rims1Q99NE5 1463 aa29.61■■■□□ 2.33
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttll13A4Q9F6 804 aa29.6■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arid3cA6PWV5 409 aa29.6■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa29.6■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AatkQ80YE4 1365 aa29.59■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa29.59■■■□□ 2.33
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prex1Q69ZK0 1650 aa29.56■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp19Q3UJD6 1360 aa29.55■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PtprtQ99M80 1454 aa29.55■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29.54■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa29.53■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa29.52■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa29.52■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc30Q8BVF4 654 aa29.51■■■□□ 2.32
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trpm1Q2TV84 1622 aa29.5■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DnmbpQ6TXD4 1580 aa29.5■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Neurod2Q62414 383 aa29.5■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Talpid3E9PV87 1520 aa29.49■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myom2Q14BI5 1463 aa29.48■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29.48■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Golga2Q921M4 999 aa29.48■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29.47■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Apbb1Q9QXJ1 710 aa29.47■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa29.46■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Uggt1Q6P5E4 1551 aa29.45■■■□□ 2.31
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Efcab6Q6P1E8 1516 aa29.44■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 OvosQ3UU35 1456 aa29.44■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Depdc5P61460 1591 aa29.44■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ChgaP26339 463 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29.43■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnga1P29974 684 aa29.42■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa29.42■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 EspnQ9ET47 871 aa29.42■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zmym3Q9JLM4 1370 aa29.39■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gli2Q0VGT2 1544 aa29.39■■■□□ 2.3
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Uspl1Q3ULM6 1089 aa29.38■■■□□ 2.29
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ralbp1Q62172 648 aa29.38■■■□□ 2.29
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dbr1Q923B1 550 aa29.37■■■□□ 2.29
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chmp5Q9D7S9 219 aa29.36■■■□□ 2.29
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stag3O70576 1240 aa29.34■■■□□ 2.29
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