RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W YJR115WP47152 169 aa6.55□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W ENV9Q08651 330 aa6.55□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W KIP2P28743 706 aa6.53□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.53□□□□□ -1.36not detected
PIR3YKL163W YDR444WQ04093 687 aa6.53□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W BPT1P14772 1559 aa6.52□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W LEU3P08638 886 aa6.51□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W IXR1P33417 597 aa6.5□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W AIM7Q12156 149 aa6.49□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W RSC30P38781 883 aa6.48□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W ITT1Q04638 464 aa6.48□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W UGA3P26370 528 aa6.47□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W ATG2P53855 1592 aa6.47□□□□□ -1.37
PIR3YKL163W CSN12P47130 423 aa6.45□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W ARG8P18544 423 aa6.44□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W VAC17P25591 423 aa6.44□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W YDL176WQ12027 708 aa6.44□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W SRF1Q12516 437 aa6.41□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W APP1P53933 587 aa6.4□□□□□ -1.38
PIR3YKL163W KIN1P13185 1064 aa6.39□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W OPT2Q06593 877 aa6.39□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W TAF2P23255 1407 aa6.39□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W RAD59Q12223 238 aa6.38□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W FIG4P42837 879 aa6.37□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W CAF120P53836 1060 aa6.36□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W YBL086CP38177 466 aa6.35□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W NUP85P46673 744 aa6.34□□□□□ -1.39
PIR3YKL163W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W SSK2P53599 1579 aa6.32□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W ACO2P39533 789 aa6.32□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W AAD14P42884 376 aa6.32□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W YLR346CQ06139 101 aa6.32□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W DLD1P32891 587 aa6.31□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W DMA2P53924 522 aa6.31□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W ARG82P07250 355 aa6.3□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W UFD4P33202 1483 aa6.29□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W MIP1P15801 1254 aa6.29□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W RTT106P40161 455 aa6.29□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W TEC1P18412 486 aa6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W YIR007WP40566 764 aa6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W SCW11P53189 542 aa6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W DFG5Q05031 458 aa6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W YPR084WQ06821 456 aa6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W TY1A-BLQ12266 440 aa6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W AIM44Q99299 758 aa6.28□□□□□ -1.4
PIR3YKL163W SIN3P22579 1536 aa6.27□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W MKS1P34072 584 aa6.27□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W LSC2P53312 427 aa6.27□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W RLF2Q12495 606 aa6.27□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W MET5P47169 1442 aa6.26□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W YJR098CP47139 656 aa6.26□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W LTE1P07866 1435 aa6.25□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W SSN2P38931 1420 aa6.25□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W TCB1Q12466 1186 aa6.25□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W UBP2Q01476 1272 aa6.22□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W CHD1P32657 1468 aa6.22□□□□□ -1.41
PIR3YKL163W GUT2P32191 649 aa6.21□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W BDS1Q08347 646 aa6.21□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W DNF1P32660 1571 aa6.2□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W FBP26P32604 452 aa6.2□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W HPF1Q05164 967 aa6.2□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W CDC25P04821 1589 aa6.19□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W ESP1Q03018 1630 aa6.19□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W YGR035CP53222 116 aa6.19□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W SCC2Q04002 1493 aa6.18□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W STE6P12866 1290 aa6.18□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W OSH7P38755 437 aa6.18□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W ATG20Q07528 640 aa6.18□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W PKC1P24583 1151 aa6.17□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W ISF1P32488 338 aa6.17□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W ROG3P43602 733 aa6.17□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W HPC2Q01448 625 aa6.17□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W TFB3Q03290 321 aa6.17□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W YPK9Q12697 1472 aa6.16□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W TRK2P28584 889 aa6.16□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W ISU1Q03020 165 aa6.16□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W FRA1Q07825 749 aa6.16□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W YBL036CP38197 257 aa6.15□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.15□□□□□ -1.42
PIR3YKL163W RPO31P04051 1460 aa6.15□□□□□ -1.43
PIR3YKL163W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PIR3YKL163W RKR1Q04781 1562 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.6 ms