RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635438.1

TUBBP5-204, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TUBBP5, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-204ENST00000635438 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.95■■■■□ 3.35
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.95■■■■□ 3.35
TUBBP5-204ENST00000635438 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.94■■■■□ 3.34
TUBBP5-204ENST00000635438 PTPRTO14522 1441 aa35.92■■■■□ 3.34
TUBBP5-204ENST00000635438 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.91■■■■□ 3.34
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCC5O15440 1437 aa35.91■■■■□ 3.34
TUBBP5-204ENST00000635438 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.91■■■■□ 3.34
TUBBP5-204ENST00000635438 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
TUBBP5-204ENST00000635438 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.87■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 PZPP20742 1482 aa35.86■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.86■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 TNRQ92752 1358 aa35.86■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 DAPK1P53355 1430 aa35.83■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF15Q9NS87 1388 aa35.83■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
TUBBP5-204ENST00000635438 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.82■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.81■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.8■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.8■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.79■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCC3O15438 1527 aa35.78■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 PLA2R1Q13018 1463 aa35.76■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 PKD2Q13563 968 aa35.76■■■■□ 3.32
TUBBP5-204ENST00000635438 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.75■■■■□ 3.31
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
TUBBP5-204ENST00000635438 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.31
TUBBP5-204ENST00000635438 ERBINQ96RT1 1412 aa35.69■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.68■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.67■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 CEP152O94986 1710 aa35.65■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 NLRP1Q9C000 1473 aa35.64■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
TUBBP5-204ENST00000635438 ERVK-7P63135 1459 aa35.61■■■■□ 3.29
TUBBP5-204ENST00000635438 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
TUBBP5-204ENST00000635438 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
TUBBP5-204ENST00000635438 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.59■■■■□ 3.29
TUBBP5-204ENST00000635438 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.59■■■■□ 3.29
TUBBP5-204ENST00000635438 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
TUBBP5-204ENST00000635438 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.56■■■■□ 3.28
TUBBP5-204ENST00000635438 KANK1Q14678 1352 aa35.53■■■■□ 3.28
TUBBP5-204ENST00000635438 DEPDC5O75140 1603 aa35.52■■■■□ 3.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ADGRL2O95490 1459 aa35.52■■■■□ 3.28
TUBBP5-204ENST00000635438 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
TUBBP5-204ENST00000635438 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.51■■■■□ 3.28
TUBBP5-204ENST00000635438 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.49■■■■□ 3.27
TUBBP5-204ENST00000635438 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
TUBBP5-204ENST00000635438 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.43■■■■□ 3.26
TUBBP5-204ENST00000635438 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
TUBBP5-204ENST00000635438 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.41■■■■□ 3.26
TUBBP5-204ENST00000635438 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.4■■■■□ 3.26
TUBBP5-204ENST00000635438 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.38■■■■□ 3.25
TUBBP5-204ENST00000635438 ITGAEP38570 1179 aa35.38■■■■□ 3.25
TUBBP5-204ENST00000635438 MED14O60244 1454 aa35.37■■■■□ 3.25
TUBBP5-204ENST00000635438 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.36■■■■□ 3.25
TUBBP5-204ENST00000635438 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.34■■■■□ 3.25
TUBBP5-204ENST00000635438 LTKP29376 864 aa35.3■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 IDI1Q13907 227 aa35.3■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.3■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.29■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.29■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 IQGAP1P46940 1657 aa35.28■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 PIK3C2BO00750 1634 aa35.28■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 ROCK1Q13464 1354 aa35.26■■■■□ 3.24
TUBBP5-204ENST00000635438 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 SYNMO15061 1565 aa35.25■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.24■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 CPS1P31327 1500 aa35.24■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 NOS1P29475 1434 aa35.23■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 SLIT1O75093 1534 aa35.23■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 EID1Q9Y6B2 187 aa35.22■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.2■■■■□ 3.23
TUBBP5-204ENST00000635438 UNC13BO14795 1591 aa35.15■■■■□ 3.22
TUBBP5-204ENST00000635438 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.14■■■■□ 3.22
TUBBP5-204ENST00000635438 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
TUBBP5-204ENST00000635438 TET3O43151 1660 aa35.13■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 PIP4K2BP78356 416 aa35.12■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.1■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 NUP155O75694 1391 aa35.09■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 ADGRB3O60242 1522 aa35.08■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 TOM1O60784 492 aa35.08■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
TUBBP5-204ENST00000635438 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
TUBBP5-204ENST00000635438 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.05■■■■□ 3.2
TUBBP5-204ENST00000635438 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
TUBBP5-204ENST00000635438 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.05■■■■□ 3.2
TUBBP5-204ENST00000635438 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.02■■■■□ 3.2
TUBBP5-204ENST00000635438 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.02■■■■□ 3.2
TUBBP5-204ENST00000635438 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
TUBBP5-204ENST00000635438 E9PCH4 1651 aa35.01■■■■□ 3.19
TUBBP5-204ENST00000635438 DISP3Q9P2K9 1392 aa35■■■■□ 3.19
TUBBP5-204ENST00000635438 BCANQ96GW7 911 aa34.98■■■■□ 3.19
TUBBP5-204ENST00000635438 HSPA1LP34931 641 aa34.95■■■■□ 3.19
TUBBP5-204ENST00000635438 ALKQ9UM73 1620 aa34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms