RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617172.4

TARDBP-218, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBP-218ENST00000617172 KANK1Q14678 1352 aa14.94□□□□□ -0.02
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TARDBP-218ENST00000617172 ADGRL2O95490 1459 aa14.87□□□□□ -0.03
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TARDBP-218ENST00000617172 NOS1P29475 1434 aa14.76□□□□□ -0.05
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TARDBP-218ENST00000617172 SLIT1O75093 1534 aa14.76□□□□□ -0.05
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TARDBP-218ENST00000617172 IQGAP1P46940 1657 aa14.72□□□□□ -0.05
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TARDBP-218ENST00000617172 BCANQ96GW7 911 aa14.66□□□□□ -0.06
TARDBP-218ENST00000617172 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.65□□□□□ -0.06
TARDBP-218ENST00000617172 ADGRB3O60242 1522 aa14.65□□□□□ -0.06
TARDBP-218ENST00000617172 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TARDBP-218ENST00000617172 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TARDBP-218ENST00000617172 HSPA1LP34931 641 aa14.63□□□□□ -0.07
TARDBP-218ENST00000617172 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.61□□□□□ -0.07
TARDBP-218ENST00000617172 ZFYVE9O95405 1425 aa14.61□□□□□ -0.07
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