RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.74■■■■□ 3.79
CDKN3-211ENST00000611205 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
CDKN3-211ENST00000611205 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
CDKN3-211ENST00000611205 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
CDKN3-211ENST00000611205 TSPY4P0CV99 314 aa38.71■■■■□ 3.79
CDKN3-211ENST00000611205 TSPY10P0CW01 314 aa38.71■■■■□ 3.79
CDKN3-211ENST00000611205 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.7■■■■□ 3.79
CDKN3-211ENST00000611205 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.68■■■■□ 3.78
CDKN3-211ENST00000611205 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
CDKN3-211ENST00000611205 TNRQ92752 1358 aa38.68■■■■□ 3.78
CDKN3-211ENST00000611205 PZPP20742 1482 aa38.67■■■■□ 3.78
CDKN3-211ENST00000611205 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
CDKN3-211ENST00000611205 DISP3Q9P2K9 1392 aa38.61■■■■□ 3.77
CDKN3-211ENST00000611205 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CDKN3-211ENST00000611205 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.6■■■■□ 3.77
CDKN3-211ENST00000611205 MAP3K1Q13233 1512 aa38.58■■■■□ 3.77
CDKN3-211ENST00000611205 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
CDKN3-211ENST00000611205 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.54■■■■□ 3.76
CDKN3-211ENST00000611205 NEURL4Q96JN8 1562 aa38.52■■■■□ 3.76
CDKN3-211ENST00000611205 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.51■■■■□ 3.76
CDKN3-211ENST00000611205 MIA2Q96PC5 1412 aa38.51■■■■□ 3.76
CDKN3-211ENST00000611205 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
CDKN3-211ENST00000611205 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CDKN3-211ENST00000611205 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.48■■■■□ 3.75
CDKN3-211ENST00000611205 NLRP1Q9C000 1473 aa38.47■■■■□ 3.75
CDKN3-211ENST00000611205 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.47■■■■□ 3.75
CDKN3-211ENST00000611205 ABCC3O15438 1527 aa38.47■■■■□ 3.75
CDKN3-211ENST00000611205 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.46■■■■□ 3.75
CDKN3-211ENST00000611205 CEP152O94986 1710 aa38.43■■■■□ 3.74
CDKN3-211ENST00000611205 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
CDKN3-211ENST00000611205 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
CDKN3-211ENST00000611205 ANKLE2Q86XL3 938 aa38.42■■■■□ 3.74
CDKN3-211ENST00000611205 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.4■■■■□ 3.74
CDKN3-211ENST00000611205 ILDR2Q71H61 639 aa38.39■■■■□ 3.74
CDKN3-211ENST00000611205 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.38■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.36■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 CPS1P31327 1500 aa38.36■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.35■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 DEPDC5O75140 1603 aa38.34■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 APLP2Q06481 763 aa38.34■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 ERVK-7P63135 1459 aa38.34■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.34■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
CDKN3-211ENST00000611205 IQGAP1P46940 1657 aa38.3■■■■□ 3.72
CDKN3-211ENST00000611205 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.29■■■■□ 3.72
CDKN3-211ENST00000611205 MED14O60244 1454 aa38.28■■■■□ 3.72
CDKN3-211ENST00000611205 KIF15Q9NS87 1388 aa38.28■■■■□ 3.72
CDKN3-211ENST00000611205 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
CDKN3-211ENST00000611205 ABCC5O15440 1437 aa38.26■■■■□ 3.72
CDKN3-211ENST00000611205 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.23■■■■□ 3.71
CDKN3-211ENST00000611205 UBR1Q8IWV7 1749 aa38.23■■■■□ 3.71
CDKN3-211ENST00000611205 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
CDKN3-211ENST00000611205 ERBINQ96RT1 1412 aa38.21■■■■□ 3.71
CDKN3-211ENST00000611205 PIP4K2BP78356 416 aa38.21■■■■□ 3.71
CDKN3-211ENST00000611205 DAPK1P53355 1430 aa38.2■■■■□ 3.71
CDKN3-211ENST00000611205 TOM1O60784 492 aa38.19■■■■□ 3.7
CDKN3-211ENST00000611205 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.16■■■■□ 3.7
CDKN3-211ENST00000611205 SOCS7O14512 581 aa38.15■■■■□ 3.7
CDKN3-211ENST00000611205 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.7
CDKN3-211ENST00000611205 STRCP1A6NGW2 1772 aa38.15■■■■□ 3.7
CDKN3-211ENST00000611205 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.12■■■■□ 3.69
CDKN3-211ENST00000611205 HSPA1LP34931 641 aa38.09■■■■□ 3.69
CDKN3-211ENST00000611205 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.09■■■■□ 3.69
CDKN3-211ENST00000611205 KANK1Q14678 1352 aa38.07■■■■□ 3.69
CDKN3-211ENST00000611205 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
CDKN3-211ENST00000611205 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.05■■■■□ 3.68
CDKN3-211ENST00000611205 SYNMO15061 1565 aa38.04■■■■□ 3.68
CDKN3-211ENST00000611205 PIK3C2BO00750 1634 aa38.04■■■■□ 3.68
CDKN3-211ENST00000611205 SLIT1O75093 1534 aa38.02■■■■□ 3.68
CDKN3-211ENST00000611205 ARHGAP23Q9P227 1491 aa38.02■■■■□ 3.68
CDKN3-211ENST00000611205 LRRC7Q96NW7 1537 aa38.02■■■■□ 3.68
CDKN3-211ENST00000611205 ALKQ9UM73 1620 aa38.01■■■■□ 3.67
CDKN3-211ENST00000611205 TXNDC2Q86VQ3 553 aa38■■■■□ 3.67
CDKN3-211ENST00000611205 LTKP29376 864 aa37.99■■■■□ 3.67
CDKN3-211ENST00000611205 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.96■■■■□ 3.67
CDKN3-211ENST00000611205 EID1Q9Y6B2 187 aa37.95■■■■□ 3.67
CDKN3-211ENST00000611205 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.95■■■■□ 3.67
CDKN3-211ENST00000611205 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
CDKN3-211ENST00000611205 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CDKN3-211ENST00000611205 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
CDKN3-211ENST00000611205 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.88■■■■□ 3.65
CDKN3-211ENST00000611205 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.88■■■■□ 3.65
CDKN3-211ENST00000611205 ADGRL2O95490 1459 aa37.88■■■■□ 3.65
CDKN3-211ENST00000611205 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
CDKN3-211ENST00000611205 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
CDKN3-211ENST00000611205 IDI1Q13907 227 aa37.85■■■■□ 3.65
CDKN3-211ENST00000611205 NOS1P29475 1434 aa37.78■■■■□ 3.64
CDKN3-211ENST00000611205 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.77■■■■□ 3.64
CDKN3-211ENST00000611205 ADGRB3O60242 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
CDKN3-211ENST00000611205 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.71■■■■□ 3.63
CDKN3-211ENST00000611205 TET3O43151 1660 aa37.7■■■■□ 3.63
CDKN3-211ENST00000611205 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.69■■■■□ 3.62
CDKN3-211ENST00000611205 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
CDKN3-211ENST00000611205 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.69■■■■□ 3.62
CDKN3-211ENST00000611205 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
CDKN3-211ENST00000611205 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.66■■■■□ 3.62
CDKN3-211ENST00000611205 KCNA6P17658 529 aa37.64■■■■□ 3.62
CDKN3-211ENST00000611205 BCANQ96GW7 911 aa37.64■■■■□ 3.62
CDKN3-211ENST00000611205 TMEM94Q12767 1356 aa37.63■■■■□ 3.61
CDKN3-211ENST00000611205 UNC13BO14795 1591 aa37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms