RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601816.3

PNKP-216, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 682 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-216ENST00000601816 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.55■■■■■ 4.08
PNKP-216ENST00000601816 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.54■■■■■ 4.08
PNKP-216ENST00000601816 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.53■■■■■ 4.08
PNKP-216ENST00000601816 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.53■■■■■ 4.08
PNKP-216ENST00000601816 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
PNKP-216ENST00000601816 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 DAPK1P53355 1430 aa40.5■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.49■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 NCOA1Q15788 1441 aa40.47■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 PZPP20742 1482 aa40.46■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 KIF15Q9NS87 1388 aa40.46■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.45■■■■■ 4.07
PNKP-216ENST00000601816 FBXO41Q8TF61 875 aa40.43■■■■■ 4.06
PNKP-216ENST00000601816 PTPRTO14522 1441 aa40.42■■■■■ 4.06
PNKP-216ENST00000601816 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
PNKP-216ENST00000601816 TNRQ92752 1358 aa40.39■■■■■ 4.06
PNKP-216ENST00000601816 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.39■■■■■ 4.06
PNKP-216ENST00000601816 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 ABCC3O15438 1527 aa40.37■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 ERBINQ96RT1 1412 aa40.36■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.36■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.35■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.33■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 PLA2R1Q13018 1463 aa40.32■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 CERKQ8TCT0 537 aa40.32■■■■■ 4.05
PNKP-216ENST00000601816 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.31■■■■■ 4.04
PNKP-216ENST00000601816 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.27■■■■■ 4.04
PNKP-216ENST00000601816 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
PNKP-216ENST00000601816 PKD2Q13563 968 aa40.24■■■■■ 4.03
PNKP-216ENST00000601816 CEP152O94986 1710 aa40.24■■■■■ 4.03
PNKP-216ENST00000601816 ADGRL2O95490 1459 aa40.21■■■■■ 4.03
PNKP-216ENST00000601816 NLRP1Q9C000 1473 aa40.21■■■■■ 4.03
PNKP-216ENST00000601816 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.18■■■■■ 4.02
PNKP-216ENST00000601816 DEPDC5O75140 1603 aa40.18■■■■■ 4.02
PNKP-216ENST00000601816 ERVK-7P63135 1459 aa40.17■■■■■ 4.02
PNKP-216ENST00000601816 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.021e-7■■■■□ 24.4
PNKP-216ENST00000601816 KANK1Q14678 1352 aa40.14■■■■■ 4.02
PNKP-216ENST00000601816 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.1■■■■■ 4.01
PNKP-216ENST00000601816 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.09■■■■■ 4.01
PNKP-216ENST00000601816 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
PNKP-216ENST00000601816 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.08■■■■■ 4.01
PNKP-216ENST00000601816 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
PNKP-216ENST00000601816 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.05■■■■■ 4
PNKP-216ENST00000601816 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
PNKP-216ENST00000601816 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.02■■■■■ 4
PNKP-216ENST00000601816 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.01■■■■■ 4
PNKP-216ENST00000601816 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.01■■■■□ 3.99
PNKP-216ENST00000601816 ANKLE2Q86XL3 938 aa40■■■■□ 3.99
PNKP-216ENST00000601816 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
PNKP-216ENST00000601816 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
PNKP-216ENST00000601816 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.99■■■■□ 3.99
PNKP-216ENST00000601816 ROCK1Q13464 1354 aa39.92■■■■□ 3.98
PNKP-216ENST00000601816 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.92■■■■□ 3.98
PNKP-216ENST00000601816 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.89■■■■□ 3.98
PNKP-216ENST00000601816 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.88■■■■□ 3.98
PNKP-216ENST00000601816 ITGAEP38570 1179 aa39.87■■■■□ 3.97
PNKP-216ENST00000601816 MED14O60244 1454 aa39.87■■■■□ 3.97
PNKP-216ENST00000601816 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
PNKP-216ENST00000601816 UNC13BO14795 1591 aa39.8■■■■□ 3.96
PNKP-216ENST00000601816 PIK3C2BO00750 1634 aa39.79■■■■□ 3.96
PNKP-216ENST00000601816 NOS1P29475 1434 aa39.78■■■■□ 3.96
PNKP-216ENST00000601816 IQGAP1P46940 1657 aa39.78■■■■□ 3.96
PNKP-216ENST00000601816 SYNMO15061 1565 aa39.76■■■■□ 3.96
PNKP-216ENST00000601816 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 TET3O43151 1660 aa39.75■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 SLIT1O75093 1534 aa39.75■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.75■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.74■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 IDI1Q13907 227 aa39.72■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 CPS1P31327 1500 aa39.7■■■■□ 3.95
PNKP-216ENST00000601816 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.69■■■■□ 3.94
PNKP-216ENST00000601816 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
PNKP-216ENST00000601816 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.67■■■■□ 3.94
PNKP-216ENST00000601816 EID1Q9Y6B2 187 aa39.67■■■■□ 3.94
PNKP-216ENST00000601816 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.67■■■■□ 3.94
PNKP-216ENST00000601816 LTKP29376 864 aa39.66■■■■□ 3.94
PNKP-216ENST00000601816 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.65■■■■□ 3.94
PNKP-216ENST00000601816 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.63■■■■□ 3.93
PNKP-216ENST00000601816 ADGRB3O60242 1522 aa39.62■■■■□ 3.93
PNKP-216ENST00000601816 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.61■■■■□ 3.93
PNKP-216ENST00000601816 NUP155O75694 1391 aa39.6■■■■□ 3.93
PNKP-216ENST00000601816 E9PCH4 1651 aa39.55■■■■□ 3.92
PNKP-216ENST00000601816 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.47■■■■□ 3.91
PNKP-216ENST00000601816 NAIPQ13075 1403 aa39.44■■■■□ 3.9
PNKP-216ENST00000601816 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.42■■■■□ 3.9
PNKP-216ENST00000601816 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.42■■■■□ 3.9
PNKP-216ENST00000601816 TOM1O60784 492 aa39.41■■■■□ 3.9
PNKP-216ENST00000601816 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.38■■■■□ 3.89
PNKP-216ENST00000601816 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
PNKP-216ENST00000601816 ZFYVE9O95405 1425 aa39.38■■■■□ 3.89
PNKP-216ENST00000601816 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.36■■■■□ 3.89
PNKP-216ENST00000601816 HFM1A2PYH4 1435 aa39.34■■■■□ 3.89
PNKP-216ENST00000601816 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
PNKP-216ENST00000601816 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms