RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.05■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.03■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 ABCC5O15440 1437 aa28.03■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.03■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 PTPRTO14522 1441 aa28.02■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.02■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 NCOA1Q15788 1441 aa28.01■■■□□ 2.08
CTIF-209ENST00000591387 PZPP20742 1482 aa28.01■■■□□ 2.07
CTIF-209ENST00000591387 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CTIF-209ENST00000591387 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CTIF-209ENST00000591387 DAPK1P53355 1430 aa27.99■■■□□ 2.07
CTIF-209ENST00000591387 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.99■■■□□ 2.07
CTIF-209ENST00000591387 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CTIF-209ENST00000591387 KIF15Q9NS87 1388 aa27.96■■■□□ 2.07
CTIF-209ENST00000591387 CERKQ8TCT0 537 aa27.95■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.95■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 PLA2R1Q13018 1463 aa27.95■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 TNRQ92752 1358 aa27.94■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 ERBINQ96RT1 1412 aa27.92■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 ABCC3O15438 1527 aa27.92■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 PKD2Q13563 968 aa27.91■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.91■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.9■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.9■■■□□ 2.06
CTIF-209ENST00000591387 NLRP1Q9C000 1473 aa27.86■■■□□ 2.05
CTIF-209ENST00000591387 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.86■■■□□ 2.05
CTIF-209ENST00000591387 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CTIF-209ENST00000591387 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
CTIF-209ENST00000591387 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.84■■■□□ 2.05
CTIF-209ENST00000591387 CEP152O94986 1710 aa27.84■■■□□ 2.05
CTIF-209ENST00000591387 ADGRL2O95490 1459 aa27.82■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.82■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 DEPDC5O75140 1603 aa27.81■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 ERVK-7P63135 1459 aa27.78■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.78■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 KANK1Q14678 1352 aa27.78■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.77■■■□□ 2.04
CTIF-209ENST00000591387 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.76■■■□□ 2.03
CTIF-209ENST00000591387 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.032e-9■■■□□ 16.8
CTIF-209ENST00000591387 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CTIF-209ENST00000591387 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.72■■■□□ 2.03
CTIF-209ENST00000591387 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.71■■■□□ 2.03
CTIF-209ENST00000591387 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.7■■■□□ 2.02
CTIF-209ENST00000591387 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.029e-7■■□□□ 13.7
CTIF-209ENST00000591387 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.69■■■□□ 2.02
CTIF-209ENST00000591387 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.68■■■□□ 2.02
CTIF-209ENST00000591387 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.66■■■□□ 2.02
CTIF-209ENST00000591387 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CTIF-209ENST00000591387 MED14O60244 1454 aa27.64■■■□□ 2.01
CTIF-209ENST00000591387 ROCK1Q13464 1354 aa27.63■■■□□ 2.01
CTIF-209ENST00000591387 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.62■■■□□ 2.01
CTIF-209ENST00000591387 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CTIF-209ENST00000591387 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.58■■■□□ 2.01
CTIF-209ENST00000591387 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CTIF-209ENST00000591387 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 IQGAP1P46940 1657 aa27.54■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 SLIT1O75093 1534 aa27.53■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 NOS1P29475 1434 aa27.53■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 PIK3C2BO00750 1634 aa27.52■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 UNC13BO14795 1591 aa27.52■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 CPS1P31327 1500 aa27.52■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.52■■■□□ 2
CTIF-209ENST00000591387 TET3O43151 1660 aa27.51■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 IDI1Q13907 227 aa27.5■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.5■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.5■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
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CTIF-209ENST00000591387 SYNMO15061 1565 aa27.48■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.48■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 EID1Q9Y6B2 187 aa27.48■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.48■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.46■■□□□ 1.99
CTIF-209ENST00000591387 LTKP29376 864 aa27.45■■□□□ 1.98
CTIF-209ENST00000591387 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.42■■□□□ 1.98
CTIF-209ENST00000591387 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.42■■□□□ 1.98
CTIF-209ENST00000591387 ADGRB3O60242 1522 aa27.4■■□□□ 1.98
CTIF-209ENST00000591387 NUP155O75694 1391 aa27.38■■□□□ 1.97
CTIF-209ENST00000591387 E9PCH4 1651 aa27.36■■□□□ 1.97
CTIF-209ENST00000591387 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.34■■□□□ 1.97
CTIF-209ENST00000591387 TOM1O60784 492 aa27.33■■□□□ 1.97
CTIF-209ENST00000591387 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CTIF-209ENST00000591387 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.29■■□□□ 1.96
CTIF-209ENST00000591387 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.29■■□□□ 1.96
CTIF-209ENST00000591387 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.28■■□□□ 1.96
CTIF-209ENST00000591387 NAIPQ13075 1403 aa27.26■■□□□ 1.95
CTIF-209ENST00000591387 ZFYVE9O95405 1425 aa27.24■■□□□ 1.95
CTIF-209ENST00000591387 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
CTIF-209ENST00000591387 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.22■■□□□ 1.95
CTIF-209ENST00000591387 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CTIF-209ENST00000591387 HFM1A2PYH4 1435 aa27.2■■□□□ 1.94
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