RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRKQ15262 1439 aa37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF3BO15066 747 aa37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CERKQ8TCT0 537 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRTO14522 1441 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NCOA1Q15788 1441 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-204ENST00000587718 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.51■■■■□ 3.59
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.51■■■■□ 3.59
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-204ENST00000587718 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PZPP20742 1482 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC5O15440 1437 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2R1Q13018 1463 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-204ENST00000587718 TNRQ92752 1358 aa37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PKD2Q13563 968 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.32■■■■□ 3.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DAPK1P53355 1430 aa37.32■■■■□ 3.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC3O15438 1527 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-204ENST00000587718 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF15Q9NS87 1388 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-204ENST00000587718 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.29■■■■□ 3.56
CAPNS1-204ENST00000587718 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.26■■■■□ 3.56
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ERBINQ96RT1 1412 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-204ENST00000587718 NLRP1Q9C000 1473 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-204ENST00000587718 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVK-7P63135 1459 aa37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-204ENST00000587718 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP152O94986 1710 aa37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.11■■■■□ 3.53
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-204ENST00000587718 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-204ENST00000587718 DEPDC5O75140 1603 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-204ENST00000587718 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRL2O95490 1459 aa37.07■■■■□ 3.52
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CAPNS1-204ENST00000587718 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-204ENST00000587718 MED14O60244 1454 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-204ENST00000587718 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.99■■■■□ 3.51
CAPNS1-204ENST00000587718 KANK1Q14678 1352 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-204ENST00000587718 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-204ENST00000587718 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGAEP38570 1179 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-204ENST00000587718 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-204ENST00000587718 HFM1A2PYH4 1435 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CPS1P31327 1500 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-204ENST00000587718 SLIT1O75093 1534 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 IQGAP1P46940 1657 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LTKP29376 864 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 NOS1P29475 1434 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 IDI1Q13907 227 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ROCK1Q13464 1354 aa36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3C2BO00750 1634 aa36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNMO15061 1565 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-204ENST00000587718 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-204ENST00000587718 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 EID1Q9Y6B2 187 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 UNC13BO14795 1591 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NAIPQ13075 1403 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TET3O43151 1660 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-204ENST00000587718 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.61■■■■□ 3.45
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