RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568146.1

NOL3-211, Transcript of nucleolar protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOL3, Length 1,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3-211ENST00000568146 CERKQ8TCT0 537 aa29.09■■■□□ 2.25
NOL3-211ENST00000568146 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.09■■■□□ 2.25
NOL3-211ENST00000568146 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
NOL3-211ENST00000568146 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
NOL3-211ENST00000568146 PZPP20742 1482 aa29.04■■■□□ 2.24
NOL3-211ENST00000568146 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NOL3-211ENST00000568146 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.03■■■□□ 2.24
NOL3-211ENST00000568146 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.03■■■□□ 2.24
NOL3-211ENST00000568146 ABCC5O15440 1437 aa29.02■■■□□ 2.24
NOL3-211ENST00000568146 PLA2R1Q13018 1463 aa29.02■■■□□ 2.24
NOL3-211ENST00000568146 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.01■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.01■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.99■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 TNRQ92752 1358 aa28.98■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.97■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.97■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 ABCC3O15438 1527 aa28.96■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.96■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.96■■■□□ 2.23
NOL3-211ENST00000568146 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NOL3-211ENST00000568146 DAPK1P53355 1430 aa28.95■■■□□ 2.22
NOL3-211ENST00000568146 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.93■■■□□ 2.22
NOL3-211ENST00000568146 KIF15Q9NS87 1388 aa28.93■■■□□ 2.22
NOL3-211ENST00000568146 PKD2Q13563 968 aa28.92■■■□□ 2.22
NOL3-211ENST00000568146 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
NOL3-211ENST00000568146 ERBINQ96RT1 1412 aa28.88■■■□□ 2.21
NOL3-211ENST00000568146 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.87■■■□□ 2.21
NOL3-211ENST00000568146 NLRP1Q9C000 1473 aa28.86■■■□□ 2.21
NOL3-211ENST00000568146 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
NOL3-211ENST00000568146 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.85■■■□□ 2.21
NOL3-211ENST00000568146 ERVK-7P63135 1459 aa28.82■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 CEP152O94986 1710 aa28.81■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.79■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 DEPDC5O75140 1603 aa28.79■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.79■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.78■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.78■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.78■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
NOL3-211ENST00000568146 ADGRL2O95490 1459 aa28.76■■■□□ 2.19
NOL3-211ENST00000568146 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.76■■■□□ 2.19
NOL3-211ENST00000568146 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
NOL3-211ENST00000568146 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
NOL3-211ENST00000568146 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
NOL3-211ENST00000568146 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.7■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.69■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.68■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 MED14O60244 1454 aa28.68■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 KANK1Q14678 1352 aa28.66■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
NOL3-211ENST00000568146 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.63■■■□□ 2.17
NOL3-211ENST00000568146 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.61■■■□□ 2.17
NOL3-211ENST00000568146 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.58■■■□□ 2.17
NOL3-211ENST00000568146 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.57■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 IQGAP1P46940 1657 aa28.57■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 CPS1P31327 1500 aa28.56■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 SLIT1O75093 1534 aa28.55■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 NOS1P29475 1434 aa28.53■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 PIK3C2BO00750 1634 aa28.53■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 SYNMO15061 1565 aa28.52■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 ROCK1Q13464 1354 aa28.52■■■□□ 2.16
NOL3-211ENST00000568146 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.5■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 LTKP29376 864 aa28.5■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 IDI1Q13907 227 aa28.49■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 UNC13BO14795 1591 aa28.46■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.46■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.46■■■□□ 2.15
NOL3-211ENST00000568146 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.43■■■□□ 2.14
NOL3-211ENST00000568146 TET3O43151 1660 aa28.43■■■□□ 2.14
NOL3-211ENST00000568146 ADGRB3O60242 1522 aa28.4■■■□□ 2.14
NOL3-211ENST00000568146 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.39■■■□□ 2.14
NOL3-211ENST00000568146 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.39■■■□□ 2.14
NOL3-211ENST00000568146 EID1Q9Y6B2 187 aa28.39■■■□□ 2.14
NOL3-211ENST00000568146 ITGAEP38570 1179 aa28.37■■■□□ 2.13
NOL3-211ENST00000568146 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.37■■■□□ 2.13
NOL3-211ENST00000568146 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.36■■■□□ 2.13
NOL3-211ENST00000568146 ALKQ9UM73 1620 aa28.35■■■□□ 2.13
NOL3-211ENST00000568146 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.34■■■□□ 2.13
NOL3-211ENST00000568146 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
NOL3-211ENST00000568146 TOM1O60784 492 aa28.33■■■□□ 2.13
NOL3-211ENST00000568146 E9PCH4 1651 aa28.31■■■□□ 2.12
NOL3-211ENST00000568146 NUP155O75694 1391 aa28.28■■■□□ 2.12
NOL3-211ENST00000568146 ZFYVE9O95405 1425 aa28.28■■■□□ 2.12
NOL3-211ENST00000568146 PIP4K2BP78356 416 aa28.27■■■□□ 2.12
NOL3-211ENST00000568146 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.26■■■□□ 2.11
NOL3-211ENST00000568146 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.26■■■□□ 2.11
NOL3-211ENST00000568146 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
NOL3-211ENST00000568146 HSPA1LP34931 641 aa28.23■■■□□ 2.11
NOL3-211ENST00000568146 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.23■■■□□ 2.11
NOL3-211ENST00000568146 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.22■■■□□ 2.11
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