RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.66■■■■□ 3.94
PPP4C-208ENST00000564966 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-208ENST00000564966 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.63■■■■□ 3.93
PPP4C-208ENST00000564966 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.63■■■■□ 3.93
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PPP4C-208ENST00000564966 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
PPP4C-208ENST00000564966 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.58■■■■□ 3.93
PPP4C-208ENST00000564966 TNRQ92752 1358 aa39.56■■■■□ 3.92
PPP4C-208ENST00000564966 PZPP20742 1482 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP4C-208ENST00000564966 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP4C-208ENST00000564966 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.52■■■■□ 3.92
PPP4C-208ENST00000564966 PKD2Q13563 968 aa39.51■■■■□ 3.92
PPP4C-208ENST00000564966 PLA2R1Q13018 1463 aa39.5■■■■□ 3.91
PPP4C-208ENST00000564966 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
PPP4C-208ENST00000564966 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
PPP4C-208ENST00000564966 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
PPP4C-208ENST00000564966 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.45■■■■□ 3.91
PPP4C-208ENST00000564966 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.45■■■■□ 3.91
PPP4C-208ENST00000564966 ABCC5O15440 1437 aa39.44■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.44■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 KIF15Q9NS87 1388 aa39.43■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.42■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.41■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 ABCC3O15438 1527 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 DAPK1P53355 1430 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.39■■■■□ 3.9
PPP4C-208ENST00000564966 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-208ENST00000564966 NLRP1Q9C000 1473 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP4C-208ENST00000564966 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.33■■■■□ 3.89
PPP4C-208ENST00000564966 CEP152O94986 1710 aa39.32■■■■□ 3.89
PPP4C-208ENST00000564966 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
PPP4C-208ENST00000564966 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.32■■■■□ 3.88
PPP4C-208ENST00000564966 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
PPP4C-208ENST00000564966 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.3■■■■□ 3.881e-10■■□□□ 12.5
PPP4C-208ENST00000564966 ERBINQ96RT1 1412 aa39.3■■■■□ 3.88
PPP4C-208ENST00000564966 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-208ENST00000564966 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
PPP4C-208ENST00000564966 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.27■■■■□ 3.88
PPP4C-208ENST00000564966 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.27■■■■□ 3.88
PPP4C-208ENST00000564966 ERVK-7P63135 1459 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4C-208ENST00000564966 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.23■■■■□ 3.87
PPP4C-208ENST00000564966 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.22■■■■□ 3.87
PPP4C-208ENST00000564966 KANK1Q14678 1352 aa39.21■■■■□ 3.87
PPP4C-208ENST00000564966 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
PPP4C-208ENST00000564966 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.17■■■■□ 3.86
PPP4C-208ENST00000564966 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.12■■■■□ 3.85
PPP4C-208ENST00000564966 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
PPP4C-208ENST00000564966 DEPDC5O75140 1603 aa39.1■■■■□ 3.85
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.07■■■■□ 3.85
PPP4C-208ENST00000564966 ADGRL2O95490 1459 aa39.03■■■■□ 3.84
PPP4C-208ENST00000564966 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.02■■■■□ 3.84
PPP4C-208ENST00000564966 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.01■■■■□ 3.84
PPP4C-208ENST00000564966 MED14O60244 1454 aa39■■■■□ 3.83
PPP4C-208ENST00000564966 IQGAP1P46940 1657 aa39■■■■□ 3.83
PPP4C-208ENST00000564966 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
PPP4C-208ENST00000564966 CPS1P31327 1500 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP4C-208ENST00000564966 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.96■■■■□ 3.83
PPP4C-208ENST00000564966 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.94■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.92■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 TXNDC2Q86VQ3 553 aa38.92■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 EID1Q9Y6B2 187 aa38.91■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 PIK3C2BO00750 1634 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 ITGAEP38570 1179 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
PPP4C-208ENST00000564966 DISP3Q9P2K9 1392 aa38.87■■■■□ 3.81
PPP4C-208ENST00000564966 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.87■■■■□ 3.81
PPP4C-208ENST00000564966 PIP4K2BP78356 416 aa38.86■■■■□ 3.81
PPP4C-208ENST00000564966 LTKP29376 864 aa38.85■■■■□ 3.81
PPP4C-208ENST00000564966 TOM1O60784 492 aa38.84■■■■□ 3.81
PPP4C-208ENST00000564966 IDI1Q13907 227 aa38.83■■■■□ 3.81
PPP4C-208ENST00000564966 SLIT1O75093 1534 aa38.83■■■■□ 3.81
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGAP23Q9P227 1491 aa38.81■■■■□ 3.8
PPP4C-208ENST00000564966 SYNMO15061 1565 aa38.79■■■■□ 3.8
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM2Q9UHN6 1383 aa38.79■■■■□ 3.8
PPP4C-208ENST00000564966 NOS1P29475 1434 aa38.75■■■■□ 3.79
PPP4C-208ENST00000564966 ROCK1Q13464 1354 aa38.73■■■■□ 3.79
PPP4C-208ENST00000564966 SLC52A1Q9NWF4 448 aa38.73■■■■□ 3.79
PPP4C-208ENST00000564966 STRCP1A6NGW2 1772 aa38.72■■■■□ 3.79
PPP4C-208ENST00000564966 TET3O43151 1660 aa38.71■■■■□ 3.79
PPP4C-208ENST00000564966 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
PPP4C-208ENST00000564966 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
PPP4C-208ENST00000564966 UNC13BO14795 1591 aa38.69■■■■□ 3.78
PPP4C-208ENST00000564966 ADGRB3O60242 1522 aa38.68■■■■□ 3.78
PPP4C-208ENST00000564966 BCANQ96GW7 911 aa38.68■■■■□ 3.78
PPP4C-208ENST00000564966 LRRC7Q96NW7 1537 aa38.68■■■■□ 3.78
PPP4C-208ENST00000564966 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.65■■■■□ 3.78
PPP4C-208ENST00000564966 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
PPP4C-208ENST00000564966 CHGAP10645 457 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
PPP4C-208ENST00000564966 HSPA1LP34931 641 aa38.62■■■■□ 3.77
PPP4C-208ENST00000564966 SLC26A8Q96RN1 970 aa38.6■■■■□ 3.77
PPP4C-208ENST00000564966 NUP155O75694 1391 aa38.59■■■■□ 3.77
PPP4C-208ENST00000564966 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
PPP4C-208ENST00000564966 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.54■■■■□ 3.76
PPP4C-208ENST00000564966 E9PCH4 1651 aa38.54■■■■□ 3.76
PPP4C-208ENST00000564966 HDGFP51858 240 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
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