RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562664.5

PPP4C-204, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-204ENST00000562664 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
PPP4C-204ENST00000562664 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.71■■■■□ 3.63
PPP4C-204ENST00000562664 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.7■■■■□ 3.63
PPP4C-204ENST00000562664 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.68■■■■□ 3.62
PPP4C-204ENST00000562664 KIF3BO15066 747 aa37.68■■■■□ 3.62
PPP4C-204ENST00000562664 PZPP20742 1482 aa37.67■■■■□ 3.62
PPP4C-204ENST00000562664 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
PPP4C-204ENST00000562664 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
PPP4C-204ENST00000562664 PKD2Q13563 968 aa37.62■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.59■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 TSPY4P0CV99 314 aa37.58■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 TSPY10P0CW01 314 aa37.58■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 TNRQ92752 1358 aa37.57■■■■□ 3.61
PPP4C-204ENST00000562664 MIA2Q96PC5 1412 aa37.57■■■■□ 3.6
PPP4C-204ENST00000562664 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
PPP4C-204ENST00000562664 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
PPP4C-204ENST00000562664 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.54■■■■□ 3.6
PPP4C-204ENST00000562664 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.53■■■■□ 3.6
PPP4C-204ENST00000562664 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.52■■■■□ 3.6
PPP4C-204ENST00000562664 ABCC3O15438 1527 aa37.51■■■■□ 3.59
PPP4C-204ENST00000562664 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.5■■■■□ 3.59
PPP4C-204ENST00000562664 CEP152O94986 1710 aa37.46■■■■□ 3.59
PPP4C-204ENST00000562664 NLRP1Q9C000 1473 aa37.45■■■■□ 3.59
PPP4C-204ENST00000562664 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4C-204ENST00000562664 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4C-204ENST00000562664 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4C-204ENST00000562664 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4C-204ENST00000562664 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP4C-204ENST00000562664 DEPDC5O75140 1603 aa37.38■■■■□ 3.57
PPP4C-204ENST00000562664 ERVK-7P63135 1459 aa37.34■■■■□ 3.57
PPP4C-204ENST00000562664 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.571e-10■■□□□ 12.5
PPP4C-204ENST00000562664 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
PPP4C-204ENST00000562664 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 ABCC5O15440 1437 aa37.31■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 MED14O60244 1454 aa37.3■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 CPS1P31327 1500 aa37.29■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.29■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 KIF15Q9NS87 1388 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 IQGAP1P46940 1657 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 ERBINQ96RT1 1412 aa37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.26■■■■□ 3.56
PPP4C-204ENST00000562664 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4C-204ENST00000562664 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4C-204ENST00000562664 DAPK1P53355 1430 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4C-204ENST00000562664 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4C-204ENST00000562664 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
PPP4C-204ENST00000562664 APLP2Q06481 763 aa37.2■■■■□ 3.55
PPP4C-204ENST00000562664 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.18■■■■□ 3.54
PPP4C-204ENST00000562664 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4C-204ENST00000562664 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.12■■■■□ 3.53
PPP4C-204ENST00000562664 ILDR2Q71H61 639 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-204ENST00000562664 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.07■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 PIK3C2BO00750 1634 aa37.07■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 SLIT1O75093 1534 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 SYNMO15061 1565 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 ALKQ9UM73 1620 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.05■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.04■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 ADGRL2O95490 1459 aa37.01■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
PPP4C-204ENST00000562664 KANK1Q14678 1352 aa36.99■■■■□ 3.51
PPP4C-204ENST00000562664 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.98■■■■□ 3.51
PPP4C-204ENST00000562664 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.97■■■■□ 3.51
PPP4C-204ENST00000562664 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP4C-204ENST00000562664 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP4C-204ENST00000562664 TOM1O60784 492 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP4C-204ENST00000562664 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PPP4C-204ENST00000562664 LTKP29376 864 aa36.91■■■■□ 3.5
PPP4C-204ENST00000562664 PIP4K2BP78356 416 aa36.91■■■■□ 3.5
PPP4C-204ENST00000562664 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
PPP4C-204ENST00000562664 HSPA1LP34931 641 aa36.88■■■■□ 3.49
PPP4C-204ENST00000562664 SOCS7O14512 581 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-204ENST00000562664 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-204ENST00000562664 NOS1P29475 1434 aa36.85■■■■□ 3.49
PPP4C-204ENST00000562664 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.85■■■■□ 3.49
PPP4C-204ENST00000562664 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
PPP4C-204ENST00000562664 ADGRB3O60242 1522 aa36.83■■■■□ 3.49
PPP4C-204ENST00000562664 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.79■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 TET3O43151 1660 aa36.79■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 EID1Q9Y6B2 187 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 IDI1Q13907 227 aa36.77■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.77■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 UNC13BO14795 1591 aa36.76■■■■□ 3.48
PPP4C-204ENST00000562664 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.75■■■■□ 3.47
PPP4C-204ENST00000562664 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.73■■■■□ 3.47
PPP4C-204ENST00000562664 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.64■■■■□ 3.46
PPP4C-204ENST00000562664 NWD1Q149M9 1564 aa36.64■■■■□ 3.46
PPP4C-204ENST00000562664 E9PCH4 1651 aa36.63■■■■□ 3.45
PPP4C-204ENST00000562664 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.62■■■■□ 3.45
PPP4C-204ENST00000562664 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.61■■■■□ 3.45
PPP4C-204ENST00000562664 ROCK1Q13464 1354 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP4C-204ENST00000562664 ZFYVE9O95405 1425 aa36.59■■■■□ 3.45
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