RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.3■■□□□ 1.8
NEK9-211ENST00000557673 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.29■■□□□ 1.8
NEK9-211ENST00000557673 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.28■■□□□ 1.8
NEK9-211ENST00000557673 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.26■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.26■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 NCOA2Q15596 1464 aa26.25■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 TNRQ92752 1358 aa26.24■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 TSPY4P0CV99 314 aa26.24■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 TSPY10P0CW01 314 aa26.24■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.23■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.22■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 PZPP20742 1482 aa26.21■■□□□ 1.79
NEK9-211ENST00000557673 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
NEK9-211ENST00000557673 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.17■■□□□ 1.78
NEK9-211ENST00000557673 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.15■■□□□ 1.78
NEK9-211ENST00000557673 MIA2Q96PC5 1412 aa26.14■■□□□ 1.78
NEK9-211ENST00000557673 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.14■■□□□ 1.78
NEK9-211ENST00000557673 NLRP1Q9C000 1473 aa26.13■■□□□ 1.77
NEK9-211ENST00000557673 CPS1P31327 1500 aa26.11■■□□□ 1.77
NEK9-211ENST00000557673 TOM1O60784 492 aa26.11■■□□□ 1.77
NEK9-211ENST00000557673 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
NEK9-211ENST00000557673 MAP3K1Q13233 1512 aa26.1■■□□□ 1.77
NEK9-211ENST00000557673 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
NEK9-211ENST00000557673 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.09■■□□□ 1.77
NEK9-211ENST00000557673 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
NEK9-211ENST00000557673 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.07■■□□□ 1.76
NEK9-211ENST00000557673 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.06■■□□□ 1.76
NEK9-211ENST00000557673 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
NEK9-211ENST00000557673 PIP4K2BP78356 416 aa26.03■■□□□ 1.76
NEK9-211ENST00000557673 MED14O60244 1454 aa26.03■■□□□ 1.76
NEK9-211ENST00000557673 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NEK9-211ENST00000557673 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.01■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 DEPDC5O75140 1603 aa26■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 ABCC3O15438 1527 aa25.98■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 HSPA1LP34931 641 aa25.98■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.97■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.95■■□□□ 1.75
NEK9-211ENST00000557673 APLP2Q06481 763 aa25.94■■□□□ 1.74
NEK9-211ENST00000557673 ERVK-7P63135 1459 aa25.93■■□□□ 1.74
NEK9-211ENST00000557673 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.91■■□□□ 1.74
NEK9-211ENST00000557673 IQGAP1P46940 1657 aa25.9■■□□□ 1.74
NEK9-211ENST00000557673 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.85■■□□□ 1.73
NEK9-211ENST00000557673 KIF15Q9NS87 1388 aa25.85■■□□□ 1.73
NEK9-211ENST00000557673 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.84■■□□□ 1.73
NEK9-211ENST00000557673 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NEK9-211ENST00000557673 ERBINQ96RT1 1412 aa25.83■■□□□ 1.73
NEK9-211ENST00000557673 EID1Q9Y6B2 187 aa25.83■■□□□ 1.73
NEK9-211ENST00000557673 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.82■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.82■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.82■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 CEP152O94986 1710 aa25.8■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 KANK1Q14678 1352 aa25.8■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 SYNMO15061 1565 aa25.79■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.79■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 ABCC5O15440 1437 aa25.79■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.722e-6■□□□□ 10.2
NEK9-211ENST00000557673 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.77■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 LTKP29376 864 aa25.77■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.77■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 SLIT1O75093 1534 aa25.77■■□□□ 1.72
NEK9-211ENST00000557673 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.76■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 ALKQ9UM73 1620 aa25.76■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.74■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.74■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 DAPK1P53355 1430 aa25.73■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.72■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.71■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.7■■□□□ 1.71
NEK9-211ENST00000557673 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.66■■□□□ 1.7
NEK9-211ENST00000557673 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.65■■□□□ 1.7
NEK9-211ENST00000557673 IDI1Q13907 227 aa25.65■■□□□ 1.7
NEK9-211ENST00000557673 PIK3C2BO00750 1634 aa25.64■■□□□ 1.7
NEK9-211ENST00000557673 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.63■■□□□ 1.69
NEK9-211ENST00000557673 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
NEK9-211ENST00000557673 KCNA6P17658 529 aa25.61■■□□□ 1.69
NEK9-211ENST00000557673 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.61■■□□□ 1.69
NEK9-211ENST00000557673 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.58■■□□□ 1.69
NEK9-211ENST00000557673 TMEM94Q12767 1356 aa25.56■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 NOS1P29475 1434 aa25.56■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.55■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 BCANQ96GW7 911 aa25.54■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 ADGRL2O95490 1459 aa25.53■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 TET3O43151 1660 aa25.52■■□□□ 1.68
NEK9-211ENST00000557673 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NEK9-211ENST00000557673 ADGRB3O60242 1522 aa25.51■■□□□ 1.67
NEK9-211ENST00000557673 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms