RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556474.1

HECTD1-215, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1-215ENST00000556474 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.48■■■□□ 2.15
HECTD1-215ENST00000556474 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.48■■■□□ 2.15
HECTD1-215ENST00000556474 NPATQ14207 1427 aa28.47■■■□□ 2.15
HECTD1-215ENST00000556474 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.47■■■□□ 2.15
HECTD1-215ENST00000556474 ABCC5O15440 1437 aa28.45■■■□□ 2.15
HECTD1-215ENST00000556474 APLP2Q06481 763 aa28.43■■■□□ 2.14
HECTD1-215ENST00000556474 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.42■■■□□ 2.14
HECTD1-215ENST00000556474 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HECTD1-215ENST00000556474 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.4■■■□□ 2.14
HECTD1-215ENST00000556474 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
HECTD1-215ENST00000556474 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.39■■■□□ 2.14
HECTD1-215ENST00000556474 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
HECTD1-215ENST00000556474 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.39■■■□□ 2.13
HECTD1-215ENST00000556474 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.34■■■□□ 2.13
HECTD1-215ENST00000556474 DAPK1P53355 1430 aa28.33■■■□□ 2.13
HECTD1-215ENST00000556474 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.32■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.32■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.31■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.31■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.29■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.29■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 PZPP20742 1482 aa28.28■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HECTD1-215ENST00000556474 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.26■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 ABCC3O15438 1527 aa28.26■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.26■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.26■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 KIF15Q9NS87 1388 aa28.25■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 TNRQ92752 1358 aa28.23■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.21■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 PLA2R1Q13018 1463 aa28.21■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 PKD2Q13563 968 aa28.21■■■□□ 2.11
HECTD1-215ENST00000556474 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
HECTD1-215ENST00000556474 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
HECTD1-215ENST00000556474 CEP152O94986 1710 aa28.18■■■□□ 2.1
HECTD1-215ENST00000556474 PIP4K2BP78356 416 aa28.15■■■□□ 2.1
HECTD1-215ENST00000556474 ERBINQ96RT1 1412 aa28.15■■■□□ 2.1
HECTD1-215ENST00000556474 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
HECTD1-215ENST00000556474 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 ADGRL2O95490 1459 aa28.13■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 DEPDC5O75140 1603 aa28.11■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 HSPA1LP34931 641 aa28.11■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.11■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 ERVK-7P63135 1459 aa28.1■■■□□ 2.09
HECTD1-215ENST00000556474 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.097e-13■■■□□ 16.6
HECTD1-215ENST00000556474 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.07■■■□□ 2.08
HECTD1-215ENST00000556474 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.07■■■□□ 2.08
HECTD1-215ENST00000556474 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
HECTD1-215ENST00000556474 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.06■■■□□ 2.08
HECTD1-215ENST00000556474 NLRP1Q9C000 1473 aa28.06■■■□□ 2.08
HECTD1-215ENST00000556474 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
HECTD1-215ENST00000556474 TOM1O60784 492 aa28.02■■■□□ 2.08
HECTD1-215ENST00000556474 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.01■■■□□ 2.07
HECTD1-215ENST00000556474 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
HECTD1-215ENST00000556474 CPS1P31327 1500 aa28■■■□□ 2.07
HECTD1-215ENST00000556474 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.99■■■□□ 2.07
HECTD1-215ENST00000556474 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
HECTD1-215ENST00000556474 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.97■■■□□ 2.07
HECTD1-215ENST00000556474 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
HECTD1-215ENST00000556474 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.94■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.94■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 MED14O60244 1454 aa27.93■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 LTKP29376 864 aa27.9■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 IDI1Q13907 227 aa27.9■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 ROCK1Q13464 1354 aa27.89■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 KANK1Q14678 1352 aa27.89■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 NOS1P29475 1434 aa27.89■■■□□ 2.06
HECTD1-215ENST00000556474 SYNMO15061 1565 aa27.89■■■□□ 2.05
HECTD1-215ENST00000556474 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.87■■■□□ 2.05
HECTD1-215ENST00000556474 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.87■■■□□ 2.05
HECTD1-215ENST00000556474 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
HECTD1-215ENST00000556474 PIK3C2BO00750 1634 aa27.86■■■□□ 2.05
HECTD1-215ENST00000556474 ITGAEP38570 1179 aa27.86■■■□□ 2.05
HECTD1-215ENST00000556474 SLIT1O75093 1534 aa27.82■■■□□ 2.04
HECTD1-215ENST00000556474 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HECTD1-215ENST00000556474 UNC13BO14795 1591 aa27.82■■■□□ 2.04
HECTD1-215ENST00000556474 ALKQ9UM73 1620 aa27.81■■■□□ 2.04
HECTD1-215ENST00000556474 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.81■■■□□ 2.04
HECTD1-215ENST00000556474 IQGAP1P46940 1657 aa27.79■■■□□ 2.04
HECTD1-215ENST00000556474 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.77■■■□□ 2.04
HECTD1-215ENST00000556474 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.76■■■□□ 2.03
HECTD1-215ENST00000556474 TET3O43151 1660 aa27.76■■■□□ 2.03
HECTD1-215ENST00000556474 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HECTD1-215ENST00000556474 E9PCH4 1651 aa27.72■■■□□ 2.03
HECTD1-215ENST00000556474 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
HECTD1-215ENST00000556474 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
HECTD1-215ENST00000556474 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.7■■■□□ 2.03
HECTD1-215ENST00000556474 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.7■■■□□ 2.02
HECTD1-215ENST00000556474 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.7■■■□□ 2.02
HECTD1-215ENST00000556474 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.69■■■□□ 2.02
HECTD1-215ENST00000556474 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.69■■■□□ 2.02
HECTD1-215ENST00000556474 NUP155O75694 1391 aa27.68■■■□□ 2.02
HECTD1-215ENST00000556474 ADGRB3O60242 1522 aa27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms