RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556474.1

HECTD1-215, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene HECTD1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD1-215	ENST00000556474	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.11	■■■■■ 4.81
HECTD1-215	ENST00000556474	ABCC9	O60706	1549 aa		40.35	■■■■■ 4.05
HECTD1-215	ENST00000556474	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.16	■■■■■ 4.02
HECTD1-215	ENST00000556474	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.34	■■■■□ 3.73
HECTD1-215	ENST00000556474	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.03	■■■■□ 3.68
HECTD1-215	ENST00000556474	NACAD	O15069	1562 aa		37.9	■■■■□ 3.66
HECTD1-215	ENST00000556474	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.84	■■■■□ 3.65
HECTD1-215	ENST00000556474	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.54	■■■■□ 3.6
HECTD1-215	ENST00000556474	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.46	■■■■□ 3.59
HECTD1-215	ENST00000556474	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.46	■■■■□ 3.59
HECTD1-215	ENST00000556474	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.34	■■■■□ 3.57
HECTD1-215	ENST00000556474	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.23	■■■■□ 3.55
HECTD1-215	ENST00000556474	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.14	■■■■□ 3.54
HECTD1-215	ENST00000556474	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.7	■■■■□ 3.47
HECTD1-215	ENST00000556474	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.38	■■■■□ 3.41
HECTD1-215	ENST00000556474	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.37	■■■■□ 3.41
HECTD1-215	ENST00000556474	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.37	■■■■□ 3.41
HECTD1-215	ENST00000556474	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.11	■■■■□ 3.37
HECTD1-215	ENST00000556474	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		35.66	■■■■□ 3.3
HECTD1-215	ENST00000556474	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.09	■■■■□ 3.21
HECTD1-215	ENST00000556474	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.06	■■■■□ 3.2
HECTD1-215	ENST00000556474	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.05	■■■■□ 3.2
HECTD1-215	ENST00000556474	CUX2	O14529	1486 aa		34.95	■■■■□ 3.19
HECTD1-215	ENST00000556474	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.91	■■■■□ 3.18
HECTD1-215	ENST00000556474	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.87	■■■■□ 3.17
HECTD1-215	ENST00000556474	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.83	■■■■□ 3.17
HECTD1-215	ENST00000556474	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.83	■■■■□ 3.17
HECTD1-215	ENST00000556474	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.76	■■■■□ 3.16
HECTD1-215	ENST00000556474	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.74	■■■■□ 3.15
HECTD1-215	ENST00000556474	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.61	■■■■□ 3.13
HECTD1-215	ENST00000556474	NES	P48681	1621 aa		34.48	■■■■□ 3.11
HECTD1-215	ENST00000556474	WIZ	O95785	1651 aa		34.41	■■■■□ 3.1
HECTD1-215	ENST00000556474	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.26	■■■■□ 3.07
HECTD1-215	ENST00000556474	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.21	■■■■□ 3.07
HECTD1-215	ENST00000556474	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.11	■■■■□ 3.05
HECTD1-215	ENST00000556474	TRIM41	Q8WV44	630 aa		34.03	■■■■□ 3.04
HECTD1-215	ENST00000556474	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.02	■■■■□ 3.04
HECTD1-215	ENST00000556474	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34	■■■■□ 3.03
HECTD1-215	ENST00000556474	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
HECTD1-215	ENST00000556474	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.89	■■■■□ 3.02
HECTD1-215	ENST00000556474	CFTR	P13569	1480 aa		33.74	■■■□□ 2.99
HECTD1-215	ENST00000556474	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.65	■■■□□ 2.98
HECTD1-215	ENST00000556474	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.63	■■■□□ 2.97
HECTD1-215	ENST00000556474	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.6	■■■□□ 2.97
HECTD1-215	ENST00000556474	WDR62	O43379	1518 aa		33.56	■■■□□ 2.96
HECTD1-215	ENST00000556474	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.52	■■■□□ 2.96
HECTD1-215	ENST00000556474	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
HECTD1-215	ENST00000556474	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.3	■■■□□ 2.92
HECTD1-215	ENST00000556474	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.25	■■■□□ 2.91
HECTD1-215	ENST00000556474	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.04	■■■□□ 2.88
HECTD1-215	ENST00000556474	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
HECTD1-215	ENST00000556474	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HECTD1-215	ENST00000556474	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HECTD1-215	ENST00000556474	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HECTD1-215	ENST00000556474	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
HECTD1-215	ENST00000556474	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.89	■■■□□ 2.86
HECTD1-215	ENST00000556474	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.86	■■■□□ 2.85
HECTD1-215	ENST00000556474	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.85	■■■□□ 2.85
HECTD1-215	ENST00000556474	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.77	■■■□□ 2.84
HECTD1-215	ENST00000556474	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
HECTD1-215	ENST00000556474	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
HECTD1-215	ENST00000556474	CUX1	P39880	1505 aa		32.68	■■■□□ 2.82
HECTD1-215	ENST00000556474	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.67	■■■□□ 2.82
HECTD1-215	ENST00000556474	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.67	■■■□□ 2.82	4e-8	■■■■■ 34.1
HECTD1-215	ENST00000556474	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
HECTD1-215	ENST00000556474	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.59	■■■□□ 2.81
HECTD1-215	ENST00000556474	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.57	■■■□□ 2.8
HECTD1-215	ENST00000556474	SOGA1	O94964	1423 aa		32.57	■■■□□ 2.8
HECTD1-215	ENST00000556474	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
HECTD1-215	ENST00000556474	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
HECTD1-215	ENST00000556474	CHD1	O14646	1710 aa		32.48	■■■□□ 2.79
HECTD1-215	ENST00000556474	FBLN2	P98095	1184 aa		32.4	■■■□□ 2.78
HECTD1-215	ENST00000556474	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.4	■■■□□ 2.78
HECTD1-215	ENST00000556474	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.33	■■■□□ 2.77
HECTD1-215	ENST00000556474	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.26	■■■□□ 2.75
HECTD1-215	ENST00000556474	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.23	■■■□□ 2.75
HECTD1-215	ENST00000556474	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.22	■■■□□ 2.75
HECTD1-215	ENST00000556474	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.19	■■■□□ 2.74
HECTD1-215	ENST00000556474	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.18	■■■□□ 2.74
HECTD1-215	ENST00000556474	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.18	■■■□□ 2.74
HECTD1-215	ENST00000556474	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.18	■■■□□ 2.74
HECTD1-215	ENST00000556474	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.16	■■■□□ 2.74
HECTD1-215	ENST00000556474	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.13	■■■□□ 2.73
HECTD1-215	ENST00000556474	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
HECTD1-215	ENST00000556474	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.08	■■■□□ 2.73
HECTD1-215	ENST00000556474	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
HECTD1-215	ENST00000556474	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
HECTD1-215	ENST00000556474	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.03	■■■□□ 2.72
HECTD1-215	ENST00000556474	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.02	■■■□□ 2.72
HECTD1-215	ENST00000556474	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.83	■■■□□ 2.69
HECTD1-215	ENST00000556474	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.8	■■■□□ 2.68
HECTD1-215	ENST00000556474	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.77	■■■□□ 2.68
HECTD1-215	ENST00000556474	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.75	■■■□□ 2.67
HECTD1-215	ENST00000556474	NUP160	Q12769	1436 aa		31.74	■■■□□ 2.67
HECTD1-215	ENST00000556474	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.73	■■■□□ 2.67
HECTD1-215	ENST00000556474	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.67	■■■□□ 2.66
HECTD1-215	ENST00000556474	IGF1R	P08069	1367 aa		31.62	■■■□□ 2.65
HECTD1-215	ENST00000556474	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.53	■■■□□ 2.64
HECTD1-215	ENST00000556474	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.49	■■■□□ 2.63
HECTD1-215	ENST00000556474	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.43	■■■□□ 2.62

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