RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 KIF3BO15066 747 aa27.56■■■□□ 2
CS-219ENST00000550655 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.56■■■□□ 2
CS-219ENST00000550655 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.56■■■□□ 2
CS-219ENST00000550655 HSPA2P54652 639 aa27.55■■■□□ 2
CS-219ENST00000550655 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CS-219ENST00000550655 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.52■■■□□ 2
CS-219ENST00000550655 PTPRKQ15262 1439 aa27.51■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 KIF15Q9NS87 1388 aa27.51■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 ERBINQ96RT1 1412 aa27.49■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 STRCQ7RTU9 1775 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 CEP152O94986 1710 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 ADGRL2O95490 1459 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 DEPDC5O75140 1603 aa27.48■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 ABCC3O15438 1527 aa27.47■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 PZPP20742 1482 aa27.45■■□□□ 1.99
CS-219ENST00000550655 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 NCOA1Q15788 1441 aa27.42■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.42■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.42■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.42■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.41■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.4■■□□□ 1.98
CS-219ENST00000550655 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.33■■□□□ 1.97
CS-219ENST00000550655 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.33■■□□□ 1.97
CS-219ENST00000550655 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
CS-219ENST00000550655 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CS-219ENST00000550655 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.32■■□□□ 1.96
CS-219ENST00000550655 TNRQ92752 1358 aa27.31■■□□□ 1.96
CS-219ENST00000550655 ERVK-7P63135 1459 aa27.28■■□□□ 1.96
CS-219ENST00000550655 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.27■■□□□ 1.96
CS-219ENST00000550655 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CS-219ENST00000550655 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CS-219ENST00000550655 PLA2R1Q13018 1463 aa27.26■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.26■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 ROCK1Q13464 1354 aa27.25■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.24■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 UNC13BO14795 1591 aa27.24■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 NLRP1Q9C000 1473 aa27.24■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 PTPRTO14522 1441 aa27.22■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 KANK1Q14678 1352 aa27.21■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.21■■□□□ 1.95
CS-219ENST00000550655 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.946e-9■□□□□ 10
CS-219ENST00000550655 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.17■■□□□ 1.94
CS-219ENST00000550655 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.17■■□□□ 1.94
CS-219ENST00000550655 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.16■■□□□ 1.94
CS-219ENST00000550655 TET3O43151 1660 aa27.15■■□□□ 1.94
CS-219ENST00000550655 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.15■■□□□ 1.94
CS-219ENST00000550655 ITGAEP38570 1179 aa27.14■■□□□ 1.94
CS-219ENST00000550655 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.14■■□□□ 1.93
CS-219ENST00000550655 SYNMO15061 1565 aa27.12■■□□□ 1.93
CS-219ENST00000550655 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.12■■□□□ 1.93
CS-219ENST00000550655 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.12■■□□□ 1.93
CS-219ENST00000550655 PIK3C2BO00750 1634 aa27.09■■□□□ 1.93
CS-219ENST00000550655 PKD2Q13563 968 aa27.09■■□□□ 1.93
CS-219ENST00000550655 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CS-219ENST00000550655 NOS1P29475 1434 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-219ENST00000550655 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CS-219ENST00000550655 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.05■■□□□ 1.92
CS-219ENST00000550655 E9PCH4 1651 aa27.05■■□□□ 1.92
CS-219ENST00000550655 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CS-219ENST00000550655 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CS-219ENST00000550655 MED14O60244 1454 aa27■■□□□ 1.91
CS-219ENST00000550655 NAIPQ13075 1403 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-219ENST00000550655 IQGAP1P46940 1657 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-219ENST00000550655 SLIT1O75093 1534 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-219ENST00000550655 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-219ENST00000550655 CERKQ8TCT0 537 aa26.98■■□□□ 1.91
CS-219ENST00000550655 ADGRB3O60242 1522 aa26.96■■□□□ 1.91
CS-219ENST00000550655 FBXO41Q8TF61 875 aa26.95■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.94■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.94■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 NUP155O75694 1391 aa26.94■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 HFM1A2PYH4 1435 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CS-219ENST00000550655 IDI1Q13907 227 aa26.9■■□□□ 1.9
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CS-219ENST00000550655 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.87■■□□□ 1.89
CS-219ENST00000550655 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.87■■□□□ 1.89
CS-219ENST00000550655 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.86■■□□□ 1.89
CS-219ENST00000550655 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.85■■□□□ 1.89
CS-219ENST00000550655 LTKP29376 864 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-219ENST00000550655 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-219ENST00000550655 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.8■■□□□ 1.88
CS-219ENST00000550655 CPS1P31327 1500 aa26.8■■□□□ 1.88
CS-219ENST00000550655 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.78■■□□□ 1.88
CS-219ENST00000550655 ZFYVE9O95405 1425 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-219ENST00000550655 EID1Q9Y6B2 187 aa26.74■■□□□ 1.87
CS-219ENST00000550655 TRPM2O94759 1503 aa26.74■■□□□ 1.87
CS-219ENST00000550655 CLTCL1P53675 1640 aa26.73■■□□□ 1.87
CS-219ENST00000550655 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.7■■□□□ 1.86
CS-219ENST00000550655 KIF1BO60333 1816 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-219ENST00000550655 TRIM52Q96A61 297 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-219ENST00000550655 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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