RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 TSPY4P0CV99 314 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 TSPY10P0CW01 314 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 ILDR2Q71H61 639 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.05■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 TNRQ92752 1358 aa27.04■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.03■■□□□ 1.92
CS-214ENST00000548849 PZPP20742 1482 aa27■■□□□ 1.91
CS-214ENST00000548849 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-214ENST00000548849 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.98■■□□□ 1.91
CS-214ENST00000548849 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.98■■□□□ 1.91
CS-214ENST00000548849 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.97■■□□□ 1.91
CS-214ENST00000548849 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.96■■□□□ 1.91
CS-214ENST00000548849 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.96■■□□□ 1.91
CS-214ENST00000548849 MIA2Q96PC5 1412 aa26.94■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 SOCS7O14512 581 aa26.92■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.9■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 NLRP1Q9C000 1473 aa26.89■■□□□ 1.9
CS-214ENST00000548849 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.86■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.86■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 CPS1P31327 1500 aa26.85■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 TOM1O60784 492 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 PIP4K2BP78356 416 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-214ENST00000548849 ABCC3O15438 1527 aa26.82■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 MAP3K1Q13233 1512 aa26.82■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.82■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 MED14O60244 1454 aa26.78■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 DEPDC5O75140 1603 aa26.77■■□□□ 1.88
CS-214ENST00000548849 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 HSPA1LP34931 641 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 ERVK-7P63135 1459 aa26.75■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.74■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.74■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 CEP152O94986 1710 aa26.73■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 APLP2Q06481 763 aa26.72■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 IQGAP1P46940 1657 aa26.72■■□□□ 1.87
CS-214ENST00000548849 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.7■■□□□ 1.86
CS-214ENST00000548849 KIF15Q9NS87 1388 aa26.69■■□□□ 1.86
CS-214ENST00000548849 ABCC5O15440 1437 aa26.66■■□□□ 1.86
CS-214ENST00000548849 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.866e-9■□□□□ 10
CS-214ENST00000548849 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-214ENST00000548849 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.65■■□□□ 1.86
CS-214ENST00000548849 ERBINQ96RT1 1412 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.62■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.62■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.62■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.61■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.6■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 DAPK1P53355 1430 aa26.6■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 LTKP29376 864 aa26.6■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 ALKQ9UM73 1620 aa26.59■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 KANK1Q14678 1352 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 EID1Q9Y6B2 187 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-214ENST00000548849 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-214ENST00000548849 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-214ENST00000548849 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.55■■□□□ 1.84
CS-214ENST00000548849 SLIT1O75093 1534 aa26.55■■□□□ 1.84
CS-214ENST00000548849 SYNMO15061 1565 aa26.55■■□□□ 1.84
CS-214ENST00000548849 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.53■■□□□ 1.84
CS-214ENST00000548849 PIK3C2BO00750 1634 aa26.51■■□□□ 1.83
CS-214ENST00000548849 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CS-214ENST00000548849 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.49■■□□□ 1.83
CS-214ENST00000548849 IDI1Q13907 227 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-214ENST00000548849 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.45■■□□□ 1.83
CS-214ENST00000548849 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.44■■□□□ 1.82
CS-214ENST00000548849 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CS-214ENST00000548849 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CS-214ENST00000548849 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CS-214ENST00000548849 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.39■■□□□ 1.82
CS-214ENST00000548849 KCNA6P17658 529 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 NOS1P29475 1434 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 ADGRL2O95490 1459 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 BCANQ96GW7 911 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 TMEM94Q12767 1356 aa26.34■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 ADGRB3O60242 1522 aa26.33■■□□□ 1.81
CS-214ENST00000548849 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-214ENST00000548849 TET3O43151 1660 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-214ENST00000548849 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CS-214ENST00000548849 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.3■■□□□ 1.8
CS-214ENST00000548849 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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