RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.21■■□□□ 1.79
CASP9-211ENST00000546969 NCOA1Q15788 1441 aa26.2■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.19■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.17■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 PKD2Q13563 968 aa26.17■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.17■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 TNRQ92752 1358 aa26.17■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.16■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 PZPP20742 1482 aa26.16■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.16■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 KIF15Q9NS87 1388 aa26.15■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.14■■□□□ 1.78
CASP9-211ENST00000546969 ABCC5O15440 1437 aa26.14■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.12■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 DAPK1P53355 1430 aa26.12■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.12■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 PLA2R1Q13018 1463 aa26.11■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.11■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.09■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 ERBINQ96RT1 1412 aa26.08■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.08■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CASP9-211ENST00000546969 KANK1Q14678 1352 aa26.07■■□□□ 1.76
CASP9-211ENST00000546969 NLRP1Q9C000 1473 aa26.05■■□□□ 1.76
CASP9-211ENST00000546969 ABCC3O15438 1527 aa26.05■■□□□ 1.76
CASP9-211ENST00000546969 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
CASP9-211ENST00000546969 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.01■■□□□ 1.75
CASP9-211ENST00000546969 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.96■■□□□ 1.75
CASP9-211ENST00000546969 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.95■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 CEP152O94986 1710 aa25.94■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 ERVK-7P63135 1459 aa25.94■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.745e-12■■■□□ 17.9
CASP9-211ENST00000546969 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.93■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.92■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 ADGRL2O95490 1459 aa25.91■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.91■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.9■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.89■■□□□ 1.74
CASP9-211ENST00000546969 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CASP9-211ENST00000546969 DEPDC5O75140 1603 aa25.87■■□□□ 1.73
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.87■■□□□ 1.73
CASP9-211ENST00000546969 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CASP9-211ENST00000546969 EID1Q9Y6B2 187 aa25.83■■□□□ 1.73
CASP9-211ENST00000546969 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.81■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 ITGAEP38570 1179 aa25.8■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.79■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 MED14O60244 1454 aa25.79■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.78■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 ROCK1Q13464 1354 aa25.78■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.77■■□□□ 1.72
CASP9-211ENST00000546969 CPS1P31327 1500 aa25.76■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.76■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.75■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.74■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 IQGAP1P46940 1657 aa25.73■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.73■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 IDI1Q13907 227 aa25.72■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CASP9-211ENST00000546969 TOM1O60784 492 aa25.7■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 SLIT1O75093 1534 aa25.68■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.68■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 PIK3C2BO00750 1634 aa25.67■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 NOS1P29475 1434 aa25.67■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.66■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 LTKP29376 864 aa25.66■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 TET3O43151 1660 aa25.64■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CASP9-211ENST00000546969 BCANQ96GW7 911 aa25.63■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 NUP155O75694 1391 aa25.63■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 UNC13BO14795 1591 aa25.62■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 SYNMO15061 1565 aa25.61■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.6■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 PIP4K2BP78356 416 aa25.58■■□□□ 1.69
CASP9-211ENST00000546969 ADGRB3O60242 1522 aa25.58■■□□□ 1.68
CASP9-211ENST00000546969 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CASP9-211ENST00000546969 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
CASP9-211ENST00000546969 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.54■■□□□ 1.68
CASP9-211ENST00000546969 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.51■■□□□ 1.67
CASP9-211ENST00000546969 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.5■■□□□ 1.67
CASP9-211ENST00000546969 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.5■■□□□ 1.67
CASP9-211ENST00000546969 KCNA6P17658 529 aa25.48■■□□□ 1.67
CASP9-211ENST00000546969 E9PCH4 1651 aa25.48■■□□□ 1.67
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