RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.47■■■■■ 4.23
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CASP9-211ENST00000546969 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.2■■■■□ 3.23
CASP9-211ENST00000546969 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.07■■■■□ 3.2
CASP9-211ENST00000546969 NACADO15069 1562 aa35.03■■■■□ 3.2
CASP9-211ENST00000546969 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.63■■■■□ 3.13
CASP9-211ENST00000546969 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
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CASP9-211ENST00000546969 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.3■■■■□ 3.08
CASP9-211ENST00000546969 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.23■■■■□ 3.07
CASP9-211ENST00000546969 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.1■■■■□ 3.05
CASP9-211ENST00000546969 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.98■■■■□ 3.03
CASP9-211ENST00000546969 SCRIBQ14160 1630 aa33.79■■■■□ 3
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CASP9-211ENST00000546969 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
CASP9-211ENST00000546969 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.2■■■□□ 2.9
CASP9-211ENST00000546969 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.12■■■□□ 2.89
CASP9-211ENST00000546969 NCAPD3P42695 1498 aa32.3■■■□□ 2.76
CASP9-211ENST00000546969 SMARCA4P51532 1647 aa32.26■■■□□ 2.76
CASP9-211ENST00000546969 SMARCA2P51531 1590 aa32.24■■■□□ 2.75
CASP9-211ENST00000546969 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.23■■■□□ 2.75
CASP9-211ENST00000546969 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
CASP9-211ENST00000546969 HMGXB3Q12766 1538 aa32.09■■■□□ 2.73
CASP9-211ENST00000546969 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
CASP9-211ENST00000546969 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.93■■■□□ 2.7
CASP9-211ENST00000546969 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.9■■■□□ 2.7
CASP9-211ENST00000546969 ERCC6Q03468 1493 aa31.84■■■□□ 2.69
CASP9-211ENST00000546969 CUX2O14529 1486 aa31.62■■■□□ 2.65
CASP9-211ENST00000546969 NESP48681 1621 aa31.61■■■□□ 2.65
CASP9-211ENST00000546969 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.55■■■□□ 2.64
CASP9-211ENST00000546969 WIZO95785 1651 aa31.54■■■□□ 2.64
CASP9-211ENST00000546969 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.44■■■□□ 2.62
CASP9-211ENST00000546969 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CASP9-211ENST00000546969 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.38■■■□□ 2.61
CASP9-211ENST00000546969 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.23■■■□□ 2.59
CASP9-211ENST00000546969 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CASP9-211ENST00000546969 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.22■■■□□ 2.59
CASP9-211ENST00000546969 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CASP9-211ENST00000546969 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.07■■■□□ 2.56
CASP9-211ENST00000546969 CFTRP13569 1480 aa31.04■■■□□ 2.56
CASP9-211ENST00000546969 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.03■■■□□ 2.56
CASP9-211ENST00000546969 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.01■■■□□ 2.55
CASP9-211ENST00000546969 WDR62O43379 1518 aa30.92■■■□□ 2.54
CASP9-211ENST00000546969 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.86■■■□□ 2.53
CASP9-211ENST00000546969 PRDM2Q13029 1718 aa30.73■■■□□ 2.51
CASP9-211ENST00000546969 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
CASP9-211ENST00000546969 ABCC8Q09428 1581 aa30.51■■■□□ 2.47
CASP9-211ENST00000546969 TOPBP1Q92547 1522 aa30.42■■■□□ 2.46
CASP9-211ENST00000546969 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CASP9-211ENST00000546969 IFT140Q96RY7 1462 aa30.41■■■□□ 2.46
CASP9-211ENST00000546969 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.36■■■□□ 2.45
CASP9-211ENST00000546969 OSCARQ8IYS5 282 aa30.33■■■□□ 2.45
CASP9-211ENST00000546969 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CASP9-211ENST00000546969 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CASP9-211ENST00000546969 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CASP9-211ENST00000546969 SOGA1O94964 1423 aa30.07■■■□□ 2.4
CASP9-211ENST00000546969 TRIM41Q8WV44 630 aa30.06■■■□□ 2.4
CASP9-211ENST00000546969 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
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CASP9-211ENST00000546969 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.99■■■□□ 2.39
CASP9-211ENST00000546969 CUX1P39880 1505 aa29.97■■■□□ 2.39
CASP9-211ENST00000546969 FBLN2P98095 1184 aa29.94■■■□□ 2.38
CASP9-211ENST00000546969 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CASP9-211ENST00000546969 WDR97A6NE52 1622 aa29.9■■■□□ 2.38
CASP9-211ENST00000546969 CHD1O14646 1710 aa29.79■■■□□ 2.36
CASP9-211ENST00000546969 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CASP9-211ENST00000546969 GRIN2BQ13224 1484 aa29.77■■■□□ 2.36
CASP9-211ENST00000546969 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.74■■■□□ 2.35
CASP9-211ENST00000546969 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CASP9-211ENST00000546969 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
CASP9-211ENST00000546969 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.71■■■□□ 2.35
CASP9-211ENST00000546969 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.71■■■□□ 2.35
CASP9-211ENST00000546969 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.71■■■□□ 2.35
CASP9-211ENST00000546969 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.7■■■□□ 2.35
CASP9-211ENST00000546969 ARHGEF11O15085 1522 aa29.68■■■□□ 2.34
CASP9-211ENST00000546969 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.68■■■□□ 2.34
CASP9-211ENST00000546969 TOP2BQ02880 1626 aa29.62■■■□□ 2.33
CASP9-211ENST00000546969 SYNJ2O15056 1496 aa29.61■■■□□ 2.33
CASP9-211ENST00000546969 SYNJ1O43426 1573 aa29.59■■■□□ 2.33
CASP9-211ENST00000546969 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.59■■■□□ 2.33
CASP9-211ENST00000546969 PBRM1Q86U86 1689 aa29.59■■■□□ 2.33
CASP9-211ENST00000546969 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.56■■■□□ 2.32
CASP9-211ENST00000546969 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.54■■■□□ 2.32
CASP9-211ENST00000546969 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.44■■■□□ 2.3
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CASP9-211ENST00000546969 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.36■■■□□ 2.29
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CASP9-211ENST00000546969 GRIN2AQ12879 1464 aa29.34■■■□□ 2.29
CASP9-211ENST00000546969 ADAMTS12P58397 1594 aa29.32■■■□□ 2.28
CASP9-211ENST00000546969 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CASP9-211ENST00000546969 NUP160Q12769 1436 aa29.2■■■□□ 2.27
CASP9-211ENST00000546969 KIF27Q86VH2 1401 aa29.17■■■□□ 2.26
CASP9-211ENST00000546969 CEP170Q5SW79 1584 aa29.14■■■□□ 2.26
CASP9-211ENST00000546969 IGF1RP08069 1367 aa29.03■■■□□ 2.24
CASP9-211ENST00000546969 JPH4Q96JJ6 628 aa29.02■■■□□ 2.24
CASP9-211ENST00000546969 SHROOM2Q13796 1616 aa28.99■■■□□ 2.23
CASP9-211ENST00000546969 CUL7Q14999 1698 aa28.99■■■□□ 2.23
CASP9-211ENST00000546969 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
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