RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.64■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 PZPP20742 1482 aa29.61■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.6■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.6■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 PKD2Q13563 968 aa29.59■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 TSPY4P0CV99 314 aa29.58■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 TSPY10P0CW01 314 aa29.58■■■□□ 2.33
LTBR-211ENST00000543190 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
LTBR-211ENST00000543190 KIF3BO15066 747 aa29.56■■■□□ 2.32
LTBR-211ENST00000543190 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
LTBR-211ENST00000543190 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
LTBR-211ENST00000543190 TNRQ92752 1358 aa29.48■■■□□ 2.31
LTBR-211ENST00000543190 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
LTBR-211ENST00000543190 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.47■■■□□ 2.31
LTBR-211ENST00000543190 NLRP1Q9C000 1473 aa29.47■■■□□ 2.31
LTBR-211ENST00000543190 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.47■■■□□ 2.31
LTBR-211ENST00000543190 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.45■■■□□ 2.31
LTBR-211ENST00000543190 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.45■■■□□ 2.31
LTBR-211ENST00000543190 ABCC3O15438 1527 aa29.44■■■□□ 2.3
LTBR-211ENST00000543190 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.44■■■□□ 2.3
LTBR-211ENST00000543190 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.44■■■□□ 2.3
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.42■■■□□ 2.3
LTBR-211ENST00000543190 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
LTBR-211ENST00000543190 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.4■■■□□ 2.3
LTBR-211ENST00000543190 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.39■■■□□ 2.3
LTBR-211ENST00000543190 DEPDC5O75140 1603 aa29.38■■■□□ 2.29
LTBR-211ENST00000543190 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
LTBR-211ENST00000543190 MED14O60244 1454 aa29.36■■■□□ 2.29
LTBR-211ENST00000543190 ABCC5O15440 1437 aa29.35■■■□□ 2.29
LTBR-211ENST00000543190 ERBINQ96RT1 1412 aa29.35■■■□□ 2.29
LTBR-211ENST00000543190 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.35■■■□□ 2.29
LTBR-211ENST00000543190 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
LTBR-211ENST00000543190 CEP152O94986 1710 aa29.32■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.32■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.32■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 ERVK-7P63135 1459 aa29.3■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 APLP2Q06481 763 aa29.3■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 DAPK1P53355 1430 aa29.28■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 KIF15Q9NS87 1388 aa29.28■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 CPS1P31327 1500 aa29.27■■■□□ 2.28
LTBR-211ENST00000543190 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.26■■■□□ 2.27
LTBR-211ENST00000543190 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
LTBR-211ENST00000543190 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
LTBR-211ENST00000543190 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.23■■■□□ 2.27
LTBR-211ENST00000543190 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.22■■■□□ 2.27
LTBR-211ENST00000543190 IQGAP1P46940 1657 aa29.21■■■□□ 2.27
LTBR-211ENST00000543190 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.2■■■□□ 2.26
LTBR-211ENST00000543190 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
LTBR-211ENST00000543190 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
LTBR-211ENST00000543190 ADGRL2O95490 1459 aa29.18■■■□□ 2.26
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.16■■■□□ 2.26
LTBR-211ENST00000543190 SLIT1O75093 1534 aa29.15■■■□□ 2.26
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.15■■■□□ 2.26
LTBR-211ENST00000543190 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.13■■■□□ 2.25
LTBR-211ENST00000543190 KANK1Q14678 1352 aa29.1■■■□□ 2.25
LTBR-211ENST00000543190 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.09■■■□□ 2.25
LTBR-211ENST00000543190 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
LTBR-211ENST00000543190 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.06■■■□□ 2.24
LTBR-211ENST00000543190 SYNMO15061 1565 aa29.06■■■□□ 2.24
LTBR-211ENST00000543190 PIK3C2BO00750 1634 aa29.05■■■□□ 2.24
LTBR-211ENST00000543190 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.04■■■□□ 2.24
LTBR-211ENST00000543190 NOS1P29475 1434 aa29.02■■■□□ 2.24
LTBR-211ENST00000543190 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.01■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 ALKQ9UM73 1620 aa28.99■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 TOM1O60784 492 aa28.99■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.97■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.97■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.96■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.96■■■□□ 2.23
LTBR-211ENST00000543190 LTKP29376 864 aa28.95■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.221e-7■□□□□ 11
LTBR-211ENST00000543190 TET3O43151 1660 aa28.93■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.91■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 UNC13BO14795 1591 aa28.91■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 ROCK1Q13464 1354 aa28.9■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.9■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 IDI1Q13907 227 aa28.9■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.9■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 EID1Q9Y6B2 187 aa28.9■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 ADGRB3O60242 1522 aa28.89■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
LTBR-211ENST00000543190 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
LTBR-211ENST00000543190 ILDR2Q71H61 639 aa28.86■■■□□ 2.21
LTBR-211ENST00000543190 HSPA1LP34931 641 aa28.81■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.8■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.79■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.78■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 SOCS7O14512 581 aa28.78■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.77■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 PIP4K2BP78356 416 aa28.77■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 ZFYVE9O95405 1425 aa28.77■■■□□ 2.2
LTBR-211ENST00000543190 NWD1Q149M9 1564 aa28.76■■■□□ 2.19
LTBR-211ENST00000543190 E9PCH4 1651 aa28.76■■■□□ 2.19
LTBR-211ENST00000543190 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
LTBR-211ENST00000543190 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
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