RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542156.5

MTMR1-214, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MTMR1, Length 1,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-214ENST00000542156 TSPY10P0CW01 314 aa40.96■■■■■ 4.15
MTMR1-214ENST00000542156 PLA2R1Q13018 1463 aa40.95■■■■■ 4.15
MTMR1-214ENST00000542156 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.93■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.93■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.93■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.9■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 PZPP20742 1482 aa40.89■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
MTMR1-214ENST00000542156 MIA2Q96PC5 1412 aa40.87■■■■■ 4.13
MTMR1-214ENST00000542156 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.87■■■■■ 4.13
MTMR1-214ENST00000542156 TNRQ92752 1358 aa40.85■■■■■ 4.13
MTMR1-214ENST00000542156 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
MTMR1-214ENST00000542156 PKD2Q13563 968 aa40.83■■■■■ 4.13
MTMR1-214ENST00000542156 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
MTMR1-214ENST00000542156 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
MTMR1-214ENST00000542156 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.76■■■■■ 4.12
MTMR1-214ENST00000542156 ABCC3O15438 1527 aa40.73■■■■■ 4.11
MTMR1-214ENST00000542156 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.72■■■■■ 4.11
MTMR1-214ENST00000542156 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
MTMR1-214ENST00000542156 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
MTMR1-214ENST00000542156 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.7■■■■■ 4.11
MTMR1-214ENST00000542156 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.7■■■■■ 4.11
MTMR1-214ENST00000542156 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.69■■■■■ 4.1
MTMR1-214ENST00000542156 APLP2Q06481 763 aa40.68■■■■■ 4.1
MTMR1-214ENST00000542156 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.66■■■■■ 4.1
MTMR1-214ENST00000542156 CEP152O94986 1710 aa40.64■■■■■ 4.1
MTMR1-214ENST00000542156 NLRP1Q9C000 1473 aa40.64■■■■■ 4.1
MTMR1-214ENST00000542156 ABCC5O15440 1437 aa40.64■■■■■ 4.1
MTMR1-214ENST00000542156 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.62■■■■■ 4.09
MTMR1-214ENST00000542156 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
MTMR1-214ENST00000542156 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.61■■■■■ 4.09
MTMR1-214ENST00000542156 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.61■■■■■ 4.09
MTMR1-214ENST00000542156 KIF15Q9NS87 1388 aa40.59■■■■■ 4.09
MTMR1-214ENST00000542156 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.58■■■■■ 4.09
MTMR1-214ENST00000542156 ERVK-7P63135 1459 aa40.57■■■■■ 4.08
MTMR1-214ENST00000542156 DAPK1P53355 1430 aa40.56■■■■■ 4.08
MTMR1-214ENST00000542156 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
MTMR1-214ENST00000542156 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.53■■■■■ 4.08
MTMR1-214ENST00000542156 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
MTMR1-214ENST00000542156 ERBINQ96RT1 1412 aa40.5■■■■■ 4.07
MTMR1-214ENST00000542156 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.5■■■■■ 4.07
MTMR1-214ENST00000542156 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
MTMR1-214ENST00000542156 DEPDC5O75140 1603 aa40.47■■■■■ 4.07
MTMR1-214ENST00000542156 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.46■■■■■ 4.07
MTMR1-214ENST00000542156 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 MED14O60244 1454 aa40.43■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.41■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.41■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.39■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 CPS1P31327 1500 aa40.39■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 IQGAP1P46940 1657 aa40.39■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.38■■■■■ 4.06
MTMR1-214ENST00000542156 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
MTMR1-214ENST00000542156 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.36■■■■■ 4.05
MTMR1-214ENST00000542156 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.35■■■■■ 4.05
MTMR1-214ENST00000542156 KANK1Q14678 1352 aa40.27■■■■■ 4.04
MTMR1-214ENST00000542156 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.25■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 ADGRL2O95490 1459 aa40.24■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 PIK3C2BO00750 1634 aa40.24■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.23■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.21■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 SLIT1O75093 1534 aa40.21■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 ILDR2Q71H61 639 aa40.2■■■■■ 4.03
MTMR1-214ENST00000542156 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
MTMR1-214ENST00000542156 PIP4K2BP78356 416 aa40.17■■■■■ 4.02
MTMR1-214ENST00000542156 LTKP29376 864 aa40.16■■■■■ 4.02
MTMR1-214ENST00000542156 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.14■■■■■ 4.02
MTMR1-214ENST00000542156 SYNMO15061 1565 aa40.14■■■■■ 4.02
MTMR1-214ENST00000542156 TOM1O60784 492 aa40.13■■■■■ 4.01
MTMR1-214ENST00000542156 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.12■■■■■ 4.01
MTMR1-214ENST00000542156 ALKQ9UM73 1620 aa40.12■■■■■ 4.01
MTMR1-214ENST00000542156 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.11■■■■■ 4.01
MTMR1-214ENST00000542156 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.08■■■■■ 4.01
MTMR1-214ENST00000542156 HSPA1LP34931 641 aa40.06■■■■■ 4
MTMR1-214ENST00000542156 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.06■■■■■ 4
MTMR1-214ENST00000542156 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
MTMR1-214ENST00000542156 IDI1Q13907 227 aa40.05■■■■■ 4
MTMR1-214ENST00000542156 NOS1P29475 1434 aa40.05■■■■■ 4
MTMR1-214ENST00000542156 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.04■■■■■ 4
MTMR1-214ENST00000542156 EID1Q9Y6B2 187 aa40.03■■■■■ 4
MTMR1-214ENST00000542156 ADGRB3O60242 1522 aa39.97■■■■□ 3.99
MTMR1-214ENST00000542156 TET3O43151 1660 aa39.94■■■■□ 3.98
MTMR1-214ENST00000542156 UNC13BO14795 1591 aa39.93■■■■□ 3.98
MTMR1-214ENST00000542156 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
MTMR1-214ENST00000542156 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
MTMR1-214ENST00000542156 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.88■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.86■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 SOCS7O14512 581 aa39.85■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.84■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 ROCK1Q13464 1354 aa39.83■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
MTMR1-214ENST00000542156 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.81■■■■□ 3.96
MTMR1-214ENST00000542156 E9PCH4 1651 aa39.8■■■■□ 3.96
MTMR1-214ENST00000542156 ITGAEP38570 1179 aa39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms