RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GGT6Q6P531 493 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF15Q9NS87 1388 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DEPDC5O75140 1603 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF3BO15066 747 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZMYM3Q14202 1370 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.95■■□□□ 1.59
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP152O94986 1710 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCOA1Q15788 1441 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPRKQ15262 1439 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCC3O15438 1527 aa24.91■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.9■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PZPP20742 1482 aa24.89■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.87■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.84■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ROCK1Q13464 1354 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STRCQ7RTU9 1775 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSPA2P54652 639 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UNC13BO14795 1591 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KANK1Q14678 1352 aa24.74■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.74■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERVK-7P63135 1459 aa24.73■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNRQ92752 1358 aa24.73■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.72■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NLRP1Q9C000 1473 aa24.72■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.71■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLA2R1Q13018 1463 aa24.71■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TET3O43151 1660 aa24.7■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.68■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ITGAEP38570 1179 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTPRTO14522 1441 aa24.61■■□□□ 1.53
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 E9PCH4 1651 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYNMO15061 1565 aa24.58■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIK3C2BO00750 1634 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NAIPQ13075 1403 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HFM1A2PYH4 1435 aa24.55■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NOS1P29475 1434 aa24.55■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.54■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PKD2Q13563 968 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-221ENST00000540665 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLIT1O75093 1534 aa24.48■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRB3O60242 1522 aa24.47■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUP155O75694 1391 aa24.47■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.47■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IQGAP1P46940 1657 aa24.46■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MED14O60244 1454 aa24.46■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.45■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.45■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.44■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.4■■□□□ 1.5
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TTC28-AS1-221ENST00000540665 IDI1Q13907 227 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.34■■□□□ 1.49
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.33■■□□□ 1.49
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRPM2O94759 1503 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CERKQ8TCT0 537 aa24.31■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.31■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLTCL1P53675 1640 aa24.28■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPS1P31327 1500 aa24.27■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF1BO60333 1816 aa24.27■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EID1Q9Y6B2 187 aa24.26■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZFYVE9O95405 1425 aa24.26■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LTKP29376 864 aa24.25■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBXO41Q8TF61 875 aa24.25■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM52Q96A61 297 aa24.23■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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