RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.72■■■■□ 3.95
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.54■■■■□ 3.28
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCC9O60706 1549 aa34.6■■■■□ 3.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.39■■■□□ 2.94
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NACADO15069 1562 aa33.33■■■□□ 2.93
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.15■■■□□ 2.9
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.96■■■□□ 2.87
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.93■■■□□ 2.86
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.75■■■□□ 2.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.37■■■□□ 2.77
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCRIBQ14160 1630 aa32.26■■■□□ 2.75
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.18■■■□□ 2.74
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.12■■■□□ 2.73
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.73■■■□□ 2.67
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.64
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.4■■■□□ 2.62
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.13■■■□□ 2.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMARCA4P51532 1647 aa30.91■■■□□ 2.54
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMARCA2P51531 1590 aa30.71■■■□□ 2.51
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCAPD3P42695 1498 aa30.69■■■□□ 2.5
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.67■■■□□ 2.5
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.65■■■□□ 2.5
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HMGXB3Q12766 1538 aa30.63■■■□□ 2.49
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.58■■■□□ 2.49
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WIZO95785 1651 aa30.3■■■□□ 2.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.98■■■□□ 2.39
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NESP48681 1621 aa29.92■■■□□ 2.38
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERCC6Q03468 1493 aa29.85■■■□□ 2.37
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.74■■■□□ 2.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.72■■■□□ 2.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.67■■■□□ 2.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CUX2O14529 1486 aa29.67■■■□□ 2.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRDM2Q13029 1718 aa29.6■■■□□ 2.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CFTRP13569 1480 aa29.6■■■□□ 2.33
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.54■■■□□ 2.32
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.43■■■□□ 2.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.42■■■□□ 2.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.41■■■□□ 2.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR62O43379 1518 aa29.38■■■□□ 2.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCC8Q09428 1581 aa29.01■■■□□ 2.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.98■■■□□ 2.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOPBP1Q92547 1522 aa28.97■■■□□ 2.23
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFT140Q96RY7 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CUX1P39880 1505 aa28.71■■■□□ 2.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.7■■■□□ 2.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.62■■■□□ 2.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR97A6NE52 1622 aa28.59■■■□□ 2.17
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.56■■■□□ 2.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SOGA1O94964 1423 aa28.52■■■□□ 2.16
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.51■■■□□ 2.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOP2BQ02880 1626 aa28.51■■■□□ 2.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYNJ1O43426 1573 aa28.45■■■□□ 2.15
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.37■■■□□ 2.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PBRM1Q86U86 1689 aa28.35■■■□□ 2.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHD1O14646 1710 aa28.34■■■□□ 2.13
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OSCARQ8IYS5 282 aa28.25■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.24■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.23■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYNJ2O15056 1496 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAMTS12P58397 1594 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.99■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBLN2P98095 1184 aa27.99■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF11O15085 1522 aa27.92■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRIN2AQ12879 1464 aa27.92■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.92■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIF27Q86VH2 1401 aa27.87■■■□□ 2.05
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CUL7Q14999 1698 aa27.85■■■□□ 2.05
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP170Q5SW79 1584 aa27.81■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUP160Q12769 1436 aa27.8■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGF1RP08069 1367 aa27.71■■■□□ 2.03
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SHROOM2Q13796 1616 aa27.7■■■□□ 2.02
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARAP1Q96P48 1450 aa27.67■■■□□ 2.02
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.66■■■□□ 2.02
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM41Q8WV44 630 aa27.63■■■□□ 2.01
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.55■■■□□ 2
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.51■■□□□ 1.99
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms