RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538579.1

VWCE-207, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 2

Gene VWCE, Length 581 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-207ENST00000538579 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.19■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.18■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 DAPK1P53355 1430 aa29.15■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 CERKQ8TCT0 537 aa29.15■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.15■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 PTPRTO14522 1441 aa29.14■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 NCOA1Q15788 1441 aa29.14■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.14■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.14■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.14■■■□□ 2.26
VWCE-207ENST00000538579 KIF15Q9NS87 1388 aa29.13■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.12■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 PZPP20742 1482 aa29.12■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 TNRQ92752 1358 aa29.12■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.11■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 PKD2Q13563 968 aa29.09■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.09■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.08■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
VWCE-207ENST00000538579 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
VWCE-207ENST00000538579 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.06■■■□□ 2.24
VWCE-207ENST00000538579 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
VWCE-207ENST00000538579 ERBINQ96RT1 1412 aa29.04■■■□□ 2.24
VWCE-207ENST00000538579 ABCC3O15438 1527 aa29.03■■■□□ 2.24
VWCE-207ENST00000538579 PLA2R1Q13018 1463 aa29.03■■■□□ 2.24
VWCE-207ENST00000538579 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
VWCE-207ENST00000538579 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
VWCE-207ENST00000538579 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
VWCE-207ENST00000538579 KANK1Q14678 1352 aa28.98■■■□□ 2.23
VWCE-207ENST00000538579 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.97■■■□□ 2.23
VWCE-207ENST00000538579 NLRP1Q9C000 1473 aa28.96■■■□□ 2.23
VWCE-207ENST00000538579 CEP152O94986 1710 aa28.94■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.93■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.91■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.9■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 ADGRL2O95490 1459 aa28.9■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 ERVK-7P63135 1459 aa28.9■■■□□ 2.22
VWCE-207ENST00000538579 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
VWCE-207ENST00000538579 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.86■■■□□ 2.21
VWCE-207ENST00000538579 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.85■■■□□ 2.21
VWCE-207ENST00000538579 DEPDC5O75140 1603 aa28.84■■■□□ 2.21
VWCE-207ENST00000538579 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.84■■■□□ 2.21
VWCE-207ENST00000538579 ITGAEP38570 1179 aa28.83■■■□□ 2.21
VWCE-207ENST00000538579 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
VWCE-207ENST00000538579 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.78■■■□□ 2.2
VWCE-207ENST00000538579 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.76■■■□□ 2.19
VWCE-207ENST00000538579 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.75■■■□□ 2.19
VWCE-207ENST00000538579 ROCK1Q13464 1354 aa28.75■■■□□ 2.19
VWCE-207ENST00000538579 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.74■■■□□ 2.19
VWCE-207ENST00000538579 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
VWCE-207ENST00000538579 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.74■■■□□ 2.19
VWCE-207ENST00000538579 MED14O60244 1454 aa28.71■■■□□ 2.19
VWCE-207ENST00000538579 IDI1Q13907 227 aa28.7■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.7■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 EID1Q9Y6B2 187 aa28.69■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.69■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.65■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.65■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.64■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 LTKP29376 864 aa28.64■■■□□ 2.18
VWCE-207ENST00000538579 NOS1P29475 1434 aa28.63■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 PIK3C2BO00750 1634 aa28.62■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 IQGAP1P46940 1657 aa28.62■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 SLIT1O75093 1534 aa28.6■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 CPS1P31327 1500 aa28.6■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.6■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.59■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 NUP155O75694 1391 aa28.58■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 SYNMO15061 1565 aa28.58■■■□□ 2.17
VWCE-207ENST00000538579 UNC13BO14795 1591 aa28.57■■■□□ 2.16
VWCE-207ENST00000538579 TET3O43151 1660 aa28.57■■■□□ 2.16
VWCE-207ENST00000538579 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
VWCE-207ENST00000538579 TOM1O60784 492 aa28.52■■■□□ 2.16
VWCE-207ENST00000538579 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.51■■■□□ 2.16
VWCE-207ENST00000538579 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
VWCE-207ENST00000538579 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
VWCE-207ENST00000538579 BCANQ96GW7 911 aa28.49■■■□□ 2.15
VWCE-207ENST00000538579 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
VWCE-207ENST00000538579 ADGRB3O60242 1522 aa28.48■■■□□ 2.15
VWCE-207ENST00000538579 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.47■■■□□ 2.15
VWCE-207ENST00000538579 PIP4K2BP78356 416 aa28.45■■■□□ 2.14
VWCE-207ENST00000538579 E9PCH4 1651 aa28.45■■■□□ 2.14
VWCE-207ENST00000538579 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.43■■■□□ 2.14
VWCE-207ENST00000538579 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
VWCE-207ENST00000538579 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.4■■■□□ 2.14
VWCE-207ENST00000538579 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.39■■■□□ 2.14
VWCE-207ENST00000538579 NAIPQ13075 1403 aa28.39■■■□□ 2.14
VWCE-207ENST00000538579 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms