RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538579.1

VWCE-207, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 2

Gene VWCE, Length 581 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-207ENST00000538579 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.26■■■■■ 5
VWCE-207ENST00000538579 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.26■■■■■ 4.19
VWCE-207ENST00000538579 ABCC9O60706 1549 aa40.97■■■■■ 4.15
VWCE-207ENST00000538579 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.15■■■■□ 3.86
VWCE-207ENST00000538579 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.12■■■■□ 3.85
VWCE-207ENST00000538579 NACADO15069 1562 aa38.98■■■■□ 3.83
VWCE-207ENST00000538579 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.53■■■■□ 3.76
VWCE-207ENST00000538579 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
VWCE-207ENST00000538579 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.28■■■■□ 3.72
VWCE-207ENST00000538579 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.2■■■■□ 3.71
VWCE-207ENST00000538579 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.16■■■■□ 3.7
VWCE-207ENST00000538579 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.07■■■■□ 3.68
VWCE-207ENST00000538579 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.91■■■■□ 3.66
VWCE-207ENST00000538579 SCRIBQ14160 1630 aa37.68■■■■□ 3.62
VWCE-207ENST00000538579 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.47■■■■□ 3.59
VWCE-207ENST00000538579 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
VWCE-207ENST00000538579 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.99■■■■□ 3.51
VWCE-207ENST00000538579 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.86■■■■□ 3.49
VWCE-207ENST00000538579 NCAPD3P42695 1498 aa35.99■■■■□ 3.35
VWCE-207ENST00000538579 SMARCA4P51532 1647 aa35.96■■■■□ 3.35
VWCE-207ENST00000538579 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.94■■■■□ 3.34
VWCE-207ENST00000538579 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
VWCE-207ENST00000538579 SMARCA2P51531 1590 aa35.86■■■■□ 3.33
VWCE-207ENST00000538579 HMGXB3Q12766 1538 aa35.71■■■■□ 3.31
VWCE-207ENST00000538579 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.64■■■■□ 3.3
VWCE-207ENST00000538579 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
VWCE-207ENST00000538579 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.58■■■■□ 3.29
VWCE-207ENST00000538579 ERCC6Q03468 1493 aa35.38■■■■□ 3.25
VWCE-207ENST00000538579 NESP48681 1621 aa35.28■■■■□ 3.24
VWCE-207ENST00000538579 WIZO95785 1651 aa35.23■■■■□ 3.23
VWCE-207ENST00000538579 CUX2O14529 1486 aa35.11■■■■□ 3.21
VWCE-207ENST00000538579 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.09■■■■□ 3.21
VWCE-207ENST00000538579 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
VWCE-207ENST00000538579 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.97■■■■□ 3.19
VWCE-207ENST00000538579 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.96■■■■□ 3.19
VWCE-207ENST00000538579 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
VWCE-207ENST00000538579 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.79■■■■□ 3.16
VWCE-207ENST00000538579 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
VWCE-207ENST00000538579 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.7■■■■□ 3.15
VWCE-207ENST00000538579 CFTRP13569 1480 aa34.6■■■■□ 3.13
VWCE-207ENST00000538579 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.57■■■■□ 3.12
VWCE-207ENST00000538579 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.53■■■■□ 3.12
VWCE-207ENST00000538579 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.53■■■■□ 3.12
VWCE-207ENST00000538579 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.46■■■■□ 3.11
VWCE-207ENST00000538579 WDR62O43379 1518 aa34.42■■■■□ 3.1
VWCE-207ENST00000538579 PRDM2Q13029 1718 aa34.21■■■■□ 3.07
VWCE-207ENST00000538579 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
VWCE-207ENST00000538579 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
VWCE-207ENST00000538579 ABCC8Q09428 1581 aa33.92■■■■□ 3.02
VWCE-207ENST00000538579 TOPBP1Q92547 1522 aa33.91■■■■□ 3.02
VWCE-207ENST00000538579 IFT140Q96RY7 1462 aa33.83■■■■□ 3.01
VWCE-207ENST00000538579 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.8■■■■□ 3
VWCE-207ENST00000538579 OSCARQ8IYS5 282 aa33.72■■■□□ 2.99
VWCE-207ENST00000538579 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
VWCE-207ENST00000538579 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
VWCE-207ENST00000538579 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
VWCE-207ENST00000538579 SOGA1O94964 1423 aa33.52■■■□□ 2.96
VWCE-207ENST00000538579 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.51■■■□□ 2.965e-7■■■■■ 38.3
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VWCE-207ENST00000538579 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.49■■■□□ 2.95
VWCE-207ENST00000538579 CUX1P39880 1505 aa33.45■■■□□ 2.95
VWCE-207ENST00000538579 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.44■■■□□ 2.94
VWCE-207ENST00000538579 TRIM41Q8WV44 630 aa33.42■■■□□ 2.94
VWCE-207ENST00000538579 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
VWCE-207ENST00000538579 FBLN2P98095 1184 aa33.34■■■□□ 2.93
VWCE-207ENST00000538579 WDR97A6NE52 1622 aa33.22■■■□□ 2.91
VWCE-207ENST00000538579 CHD1O14646 1710 aa33.17■■■□□ 2.9
VWCE-207ENST00000538579 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.14■■■□□ 2.9
VWCE-207ENST00000538579 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
VWCE-207ENST00000538579 GRIN2BQ13224 1484 aa33.13■■■□□ 2.89
VWCE-207ENST00000538579 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.12■■■□□ 2.89
VWCE-207ENST00000538579 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.08■■■□□ 2.89
VWCE-207ENST00000538579 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.08■■■□□ 2.89
VWCE-207ENST00000538579 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
VWCE-207ENST00000538579 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.07■■■□□ 2.88
VWCE-207ENST00000538579 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.07■■■□□ 2.88
VWCE-207ENST00000538579 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.07■■■□□ 2.88
VWCE-207ENST00000538579 ARHGEF11O15085 1522 aa33.02■■■□□ 2.88
VWCE-207ENST00000538579 TOP2BQ02880 1626 aa33.02■■■□□ 2.88
VWCE-207ENST00000538579 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33■■■□□ 2.87
VWCE-207ENST00000538579 SYNJ1O43426 1573 aa32.98■■■□□ 2.87
VWCE-207ENST00000538579 SYNJ2O15056 1496 aa32.96■■■□□ 2.87
VWCE-207ENST00000538579 PBRM1Q86U86 1689 aa32.96■■■□□ 2.87
VWCE-207ENST00000538579 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.93■■■□□ 2.86
VWCE-207ENST00000538579 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.91■■■□□ 2.86
VWCE-207ENST00000538579 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.79■■■□□ 2.84
VWCE-207ENST00000538579 ARAP1Q96P48 1450 aa32.72■■■□□ 2.83
VWCE-207ENST00000538579 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.68■■■□□ 2.82
VWCE-207ENST00000538579 GRIN2AQ12879 1464 aa32.68■■■□□ 2.82
VWCE-207ENST00000538579 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.67■■■□□ 2.82
VWCE-207ENST00000538579 ADAMTS12P58397 1594 aa32.66■■■□□ 2.82
VWCE-207ENST00000538579 NUP160Q12769 1436 aa32.54■■■□□ 2.8
VWCE-207ENST00000538579 CEP170Q5SW79 1584 aa32.5■■■□□ 2.79
VWCE-207ENST00000538579 KIF27Q86VH2 1401 aa32.49■■■□□ 2.79
VWCE-207ENST00000538579 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
VWCE-207ENST00000538579 IGF1RP08069 1367 aa32.42■■■□□ 2.78
VWCE-207ENST00000538579 JPH4Q96JJ6 628 aa32.35■■■□□ 2.77
VWCE-207ENST00000538579 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.32■■■□□ 2.77
VWCE-207ENST00000538579 SHROOM2Q13796 1616 aa32.29■■■□□ 2.76
VWCE-207ENST00000538579 CUL7Q14999 1698 aa32.27■■■□□ 2.76
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