RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527962.5

CTTN-212, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 2

Gene CTTN, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-212ENST00000527962 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.03■■□□□ 1.6
CTTN-212ENST00000527962 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
CTTN-212ENST00000527962 TNRQ92752 1358 aa25■■□□□ 1.59
CTTN-212ENST00000527962 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25■■□□□ 1.59
CTTN-212ENST00000527962 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25■■□□□ 1.59
CTTN-212ENST00000527962 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTTN-212ENST00000527962 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.96■■□□□ 1.59
CTTN-212ENST00000527962 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTTN-212ENST00000527962 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.95■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 PZPP20742 1482 aa24.95■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 SOCS7O14512 581 aa24.94■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 ILDR2Q71H61 639 aa24.94■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.9■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 MIA2Q96PC5 1412 aa24.9■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.89■■□□□ 1.58
CTTN-212ENST00000527962 NLRP1Q9C000 1473 aa24.89■■□□□ 1.57
CTTN-212ENST00000527962 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.88■■□□□ 1.57
CTTN-212ENST00000527962 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.88■■□□□ 1.57
CTTN-212ENST00000527962 TOM1O60784 492 aa24.87■■□□□ 1.57
CTTN-212ENST00000527962 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.573e-7■□□□□ 10
CTTN-212ENST00000527962 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CTTN-212ENST00000527962 CPS1P31327 1500 aa24.84■■□□□ 1.57
CTTN-212ENST00000527962 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.82■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.82■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 PIP4K2BP78356 416 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 MAP3K1Q13233 1512 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 APLP2Q06481 763 aa24.78■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.78■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTTN-212ENST00000527962 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.76■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 MED14O60244 1454 aa24.76■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.76■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 ABCC3O15438 1527 aa24.74■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 HSPA1LP34931 641 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 DEPDC5O75140 1603 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CTTN-212ENST00000527962 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.7■■□□□ 1.54
CTTN-212ENST00000527962 ERVK-7P63135 1459 aa24.69■■□□□ 1.54
CTTN-212ENST00000527962 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.67■■□□□ 1.54
CTTN-212ENST00000527962 KIF15Q9NS87 1388 aa24.67■■□□□ 1.54
CTTN-212ENST00000527962 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.65■■□□□ 1.54
CTTN-212ENST00000527962 EID1Q9Y6B2 187 aa24.64■■□□□ 1.54
CTTN-212ENST00000527962 KANK1Q14678 1352 aa24.64■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 ERBINQ96RT1 1412 aa24.63■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 IQGAP1P46940 1657 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.62■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.533e-7■■■□□ 16.9
CTTN-212ENST00000527962 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.61■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.61■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 ABCC5O15440 1437 aa24.6■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.58■■□□□ 1.53
CTTN-212ENST00000527962 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.56■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.55■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 LTKP29376 864 aa24.54■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 DAPK1P53355 1430 aa24.53■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.53■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 CEP152O94986 1710 aa24.52■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 SLIT1O75093 1534 aa24.52■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.52■■□□□ 1.52
CTTN-212ENST00000527962 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.51■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 SYNMO15061 1565 aa24.51■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.51■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.51■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.5■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.46■■□□□ 1.51
CTTN-212ENST00000527962 IDI1Q13907 227 aa24.45■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 ALKQ9UM73 1620 aa24.43■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.43■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.43■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.42■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.41■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 KCNA6P17658 529 aa24.4■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 BCANQ96GW7 911 aa24.4■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 PIK3C2BO00750 1634 aa24.39■■□□□ 1.5
CTTN-212ENST00000527962 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.36■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 TMEM94Q12767 1356 aa24.35■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 NOS1P29475 1434 aa24.35■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.34■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 ADGRL2O95490 1459 aa24.33■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.33■■□□□ 1.49
CTTN-212ENST00000527962 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTTN-212ENST00000527962 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTTN-212ENST00000527962 ADGRB3O60242 1522 aa24.28■■□□□ 1.48
CTTN-212ENST00000527962 TET3O43151 1660 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117 ms