RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 PDE3BQ13370 1112 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 NLRP13Q86W25 1043 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 SYNJ2O15056 1496 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 TSPY4P0CV99 314 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 TSPY10P0CW01 314 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 ABCA8O94911 1581 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 ATP10BO94823 1461 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 JPH4Q96JJ6 628 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 NUP160Q12769 1436 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.33■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 INSRP06213 1382 aa15.33■□□□□ 0.05
PTPRK-217ENST00000524534 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 MS4A1P11836 297 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 18
PTPRK-217ENST00000524534 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 PDE4AP27815 886 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 BACH2Q9BYV9 841 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 LAMC1P11047 1609 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRK-217ENST00000524534 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 PLA2R1Q13018 1463 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 TESK2Q96S53 571 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 A2MP01023 1474 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 FBLN2P98095 1184 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 UNC13BO14795 1591 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 PREX2Q70Z35 1606 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 ERBINQ96RT1 1412 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 RGL3Q3MIN7 710 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 PANK3Q9H999 370 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRK-217ENST00000524534 PLIN1O60240 522 aa15.21■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 CRBNQ96SW2 442 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 USP35Q9P2H5 1018 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 ATP10AO60312 1499 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 TMF1P82094 1093 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 ERCC6Q03468 1493 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 NEFMP07197 916 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRK-217ENST00000524534 PLXNC1O60486 1568 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.015e-7■■□□□ 13.3
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PTPRK-217ENST00000524534 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 SKAP1Q86WV1 359 aa15.12■□□□□ 0.01
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PTPRK-217ENST00000524534 ZNF521Q96K83 1311 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 PPP2R1AP30153 589 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
PTPRK-217ENST00000524534 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PTPRK-217ENST00000524534 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.08■□□□□ 0
PTPRK-217ENST00000524534 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.07■□□□□ 0
PTPRK-217ENST00000524534 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
PTPRK-217ENST00000524534 IQGAP1P46940 1657 aa15.06■□□□□ 0
PTPRK-217ENST00000524534 GOLGA2Q08379 1002 aa15.06■□□□□ 0
PTPRK-217ENST00000524534 MADDQ8WXG6 1647 aa15.05■□□□□ 0
PTPRK-217ENST00000524534 SYNMO15061 1565 aa15.05■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 PIK3C2GO75747 1445 aa15.05■□□□□ -0
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