RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRK-217ENST00000524534 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.62■□□□□ 0.73
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PTPRK-217ENST00000524534 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.3■□□□□ 0.68
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PTPRK-217ENST00000524534 SCRIBQ14160 1630 aa18.39■□□□□ 0.53
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PTPRK-217ENST00000524534 WIZO95785 1651 aa17.95■□□□□ 0.46
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PTPRK-217ENST00000524534 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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PTPRK-217ENST00000524534 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
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PTPRK-217ENST00000524534 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.43
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PTPRK-217ENST00000524534 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.65■□□□□ 0.42
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PTPRK-217ENST00000524534 CEP162Q5TB80 1403 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRK-217ENST00000524534 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.59■□□□□ 0.41
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PTPRK-217ENST00000524534 SOGA1O94964 1423 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRK-217ENST00000524534 EEA1Q15075 1411 aa17.55■□□□□ 0.4
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PTPRK-217ENST00000524534 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.96■□□□□ 0.31
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PTPRK-217ENST00000524534 ITGAEP38570 1179 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRK-217ENST00000524534 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRK-217ENST00000524534 PRDM2Q13029 1718 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRK-217ENST00000524534 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-217ENST00000524534 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.5■□□□□ 0.23
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