RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514495.1

CTBP1-214, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-214	ENST00000514495	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CTBP1-214	ENST00000514495	NCOA1	Q15788	1441 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CTBP1-214	ENST00000514495	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	43.2	■■■■■ 4.51
CTBP1-214	ENST00000514495	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.2	■■■■■ 4.51
CTBP1-214	ENST00000514495	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		43.17	■■■■■ 4.5
CTBP1-214	ENST00000514495	PTPRT	O14522	1441 aa		43.17	■■■■■ 4.5
CTBP1-214	ENST00000514495	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
CTBP1-214	ENST00000514495	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.15	■■■■■ 4.5
CTBP1-214	ENST00000514495	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
CTBP1-214	ENST00000514495	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		43.14	■■■■■ 4.5
CTBP1-214	ENST00000514495	PZP	P20742	1482 aa		43.13	■■■■■ 4.49
CTBP1-214	ENST00000514495	ABCC5	O15440	1437 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CTBP1-214	ENST00000514495	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CTBP1-214	ENST00000514495	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.09	■■■■■ 4.49
CTBP1-214	ENST00000514495	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
CTBP1-214	ENST00000514495	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
CTBP1-214	ENST00000514495	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
CTBP1-214	ENST00000514495	DAPK1	P53355	1430 aa		43.06	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	TNR	Q92752	1358 aa		43.06	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.06	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.05	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	PLA2R1	Q13018	1463 aa		43.04	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		43.02	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	ABCC3	O15438	1527 aa		43.02	■■■■■ 4.48
CTBP1-214	ENST00000514495	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43	■■■■■ 4.47
CTBP1-214	ENST00000514495	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.98	■■■■■ 4.47
CTBP1-214	ENST00000514495	CEP152	O94986	1710 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CTBP1-214	ENST00000514495	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CTBP1-214	ENST00000514495	PKD2	Q13563	968 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CTBP1-214	ENST00000514495	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CTBP1-214	ENST00000514495	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CTBP1-214	ENST00000514495	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CTBP1-214	ENST00000514495	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.86	■■■■■ 4.45
CTBP1-214	ENST00000514495	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
CTBP1-214	ENST00000514495	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
CTBP1-214	ENST00000514495	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CTBP1-214	ENST00000514495	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.44
CTBP1-214	ENST00000514495	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CTBP1-214	ENST00000514495	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CTBP1-214	ENST00000514495	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.79	■■■■■ 4.44
CTBP1-214	ENST00000514495	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.78	■■■■■ 4.44	3e-7	■■□□□ 12.4
CTBP1-214	ENST00000514495	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
CTBP1-214	ENST00000514495	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.75	■■■■■ 4.43	1e-6	■■■■□ 23.5
CTBP1-214	ENST00000514495	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CTBP1-214	ENST00000514495	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CTBP1-214	ENST00000514495	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.73	■■■■■ 4.43
CTBP1-214	ENST00000514495	KANK1	Q14678	1352 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CTBP1-214	ENST00000514495	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CTBP1-214	ENST00000514495	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CTBP1-214	ENST00000514495	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CTBP1-214	ENST00000514495	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CTBP1-214	ENST00000514495	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CTBP1-214	ENST00000514495	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CTBP1-214	ENST00000514495	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CTBP1-214	ENST00000514495	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
CTBP1-214	ENST00000514495	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CTBP1-214	ENST00000514495	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
CTBP1-214	ENST00000514495	MED14	O60244	1454 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CTBP1-214	ENST00000514495	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.51	■■■■■ 4.39
CTBP1-214	ENST00000514495	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CTBP1-214	ENST00000514495	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CTBP1-214	ENST00000514495	CPS1	P31327	1500 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CTBP1-214	ENST00000514495	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CTBP1-214	ENST00000514495	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.38
CTBP1-214	ENST00000514495	ITGAE	P38570	1179 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	SYNM	O15061	1565 aa		42.38	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	SLIT1	O75093	1534 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	UNC13B	O14795	1591 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	TET3	O43151	1660 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	NOS1	P29475	1434 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CTBP1-214	ENST00000514495	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	IDI1	Q13907	227 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	LTK	P29376	864 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CTBP1-214	ENST00000514495	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CTBP1-214	ENST00000514495	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CTBP1-214	ENST00000514495	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CTBP1-214	ENST00000514495	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CTBP1-214	ENST00000514495		E9PCH4	1651 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CTBP1-214	ENST00000514495	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.34
CTBP1-214	ENST00000514495	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
CTBP1-214	ENST00000514495	TOM1	O60784	492 aa		42.12	■■■■■ 4.33
CTBP1-214	ENST00000514495	NUP155	O75694	1391 aa		42.11	■■■■■ 4.33
CTBP1-214	ENST00000514495	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CTBP1-214	ENST00000514495	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CTBP1-214	ENST00000514495	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CTBP1-214	ENST00000514495	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CTBP1-214	ENST00000514495	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CTBP1-214	ENST00000514495	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
CTBP1-214	ENST00000514495	BCAN	Q96GW7	911 aa		41.96	■■■■■ 4.31
CTBP1-214	ENST00000514495	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		41.96	■■■■■ 4.31
CTBP1-214	ENST00000514495	ALK	Q9UM73	1620 aa		41.95	■■■■■ 4.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms