RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.68■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSPA1LP34931 641 aa32.68■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PZPP20742 1482 aa32.67■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNRQ92752 1358 aa32.67■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TOM1O60784 492 aa32.65■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP162Q5TB80 1403 aa32.65■■■□□ 2.82
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.61■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.61■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MED14O60244 1454 aa32.61■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF3BO15066 747 aa32.61■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.6■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MIA2Q96PC5 1412 aa32.59■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.58■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.58■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ALKQ9UM73 1620 aa32.58■■■□□ 2.81
CDH18-AS1-201ENST00000513573 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NLRP1Q9C000 1473 aa32.56■■■□□ 2.8
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DEPDC5O75140 1603 aa32.56■■■□□ 2.8
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.56■■■□□ 2.8
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.55■■■□□ 2.8
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PIP4K2BP78356 416 aa32.55■■■□□ 2.8
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.53■■■□□ 2.8
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.5■■■□□ 2.79
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.48■■■□□ 2.79
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NCOA2Q15596 1464 aa32.45■■■□□ 2.79
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.44■■■□□ 2.78
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IQGAP1P46940 1657 aa32.4■■■□□ 2.78
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRC7Q96NW7 1537 aa32.39■■■□□ 2.78
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.39■■■□□ 2.78
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSPY4P0CV99 314 aa32.35■■■□□ 2.77
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSPY10P0CW01 314 aa32.35■■■□□ 2.77
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCC3O15438 1527 aa32.35■■■□□ 2.77
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.31■■■□□ 2.76
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SYNMO15061 1565 aa32.3■■■□□ 2.76
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ERVK-7P63135 1459 aa32.29■■■□□ 2.76
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.27■■■□□ 2.76
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBR1Q8IWV7 1749 aa32.23■■■□□ 2.75
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.23■■■□□ 2.75
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLIT1O75093 1534 aa32.2■■■□□ 2.74
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LTKP29376 864 aa32.17■■■□□ 2.74
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.17■■■□□ 2.74
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.16■■■□□ 2.74
CDH18-AS1-201ENST00000513573 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP152O94986 1710 aa32.11■■■□□ 2.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.1■■■□□ 2.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.1■■■□□ 2.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.08■■■□□ 2.73
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.05■■■□□ 2.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MAP3K1Q13233 1512 aa32.04■■■□□ 2.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.01■■■□□ 2.72
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM2Q9UHN6 1383 aa32.01■■■□□ 2.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EID1Q9Y6B2 187 aa31.99■■■□□ 2.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ERBINQ96RT1 1412 aa31.99■■■□□ 2.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PIK3C2BO00750 1634 aa31.97■■■□□ 2.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIF15Q9NS87 1388 aa31.95■■■□□ 2.71
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TET3O43151 1660 aa31.95■■■□□ 2.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KCNA6P17658 529 aa31.93■■■□□ 2.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM94Q12767 1356 aa31.93■■■□□ 2.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ABCC5O15440 1437 aa31.92■■■□□ 2.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POTEAQ6S8J7 498 aa31.9■■■□□ 2.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.9■■■□□ 2.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IDI1Q13907 227 aa31.89■■■□□ 2.7
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.88■■■□□ 2.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.86■■■□□ 2.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.86■■■□□ 2.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.83■■■□□ 2.69
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NOS1P29475 1434 aa31.82■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NWD1Q149M9 1564 aa31.81■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KANK1Q14678 1352 aa31.81■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DAPK1P53355 1430 aa31.79■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.79■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.79■■■□□ 2.68
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.76■■■□□ 2.67
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.73■■■□□ 2.67
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGRB3O60242 1522 aa31.73■■■□□ 2.67
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLAIN2Q9P270 581 aa31.71■■■□□ 2.67
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.69■■■□□ 2.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.68■■■□□ 2.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MSH6P52701 1360 aa31.67■■■□□ 2.66
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZFYVE9O95405 1425 aa31.66■■■□□ 2.66
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