RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503988.1

DCTD-206, Transcript of dCMP deaminase, human

TSL 5

Gene DCTD, Length 1,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTD-206	ENST00000503988	APLP2	Q06481	763 aa		43.08	■■■■■ 4.49
DCTD-206	ENST00000503988	KIF3B	O15066	747 aa		43.06	■■■■■ 4.48
DCTD-206	ENST00000503988	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		43.04	■■■■■ 4.48
DCTD-206	ENST00000503988	PLA2R1	Q13018	1463 aa		43.02	■■■■■ 4.48
DCTD-206	ENST00000503988	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		43.02	■■■■■ 4.48
DCTD-206	ENST00000503988	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
DCTD-206	ENST00000503988	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.96	■■■■■ 4.47
DCTD-206	ENST00000503988	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
DCTD-206	ENST00000503988	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.94	■■■■■ 4.46
DCTD-206	ENST00000503988	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.94	■■■■■ 4.46
DCTD-206	ENST00000503988	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.93	■■■■■ 4.46
DCTD-206	ENST00000503988	PZP	P20742	1482 aa		42.91	■■■■■ 4.46
DCTD-206	ENST00000503988	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.87	■■■■■ 4.45
DCTD-206	ENST00000503988	PKD2	Q13563	968 aa		42.87	■■■■■ 4.45
DCTD-206	ENST00000503988	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.87	■■■■■ 4.45
DCTD-206	ENST00000503988	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.86	■■■■■ 4.45
DCTD-206	ENST00000503988	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
DCTD-206	ENST00000503988	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
DCTD-206	ENST00000503988	TNR	Q92752	1358 aa		42.83	■■■■■ 4.45
DCTD-206	ENST00000503988	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.81	■■■■■ 4.44
DCTD-206	ENST00000503988	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.79	■■■■■ 4.44
DCTD-206	ENST00000503988	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.76	■■■■■ 4.44
DCTD-206	ENST00000503988	ABCC5	O15440	1437 aa		42.76	■■■■■ 4.44
DCTD-206	ENST00000503988	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.76	■■■■■ 4.44
DCTD-206	ENST00000503988	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.76	■■■■■ 4.44
DCTD-206	ENST00000503988	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
DCTD-206	ENST00000503988	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.74	■■■■■ 4.43
DCTD-206	ENST00000503988	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.74	■■■■■ 4.43
DCTD-206	ENST00000503988	ABCC3	O15438	1527 aa		42.72	■■■■■ 4.43
DCTD-206	ENST00000503988	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
DCTD-206	ENST00000503988	DAPK1	P53355	1430 aa		42.69	■■■■■ 4.42
DCTD-206	ENST00000503988	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.65	■■■■■ 4.42
DCTD-206	ENST00000503988	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.65	■■■■■ 4.42
DCTD-206	ENST00000503988	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.63	■■■■■ 4.41
DCTD-206	ENST00000503988	CEP152	O94986	1710 aa		42.63	■■■■■ 4.41
DCTD-206	ENST00000503988	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.62	■■■■■ 4.41
DCTD-206	ENST00000503988	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.62	■■■■■ 4.41
DCTD-206	ENST00000503988	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.6	■■■■■ 4.41
DCTD-206	ENST00000503988	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.58	■■■■■ 4.41
DCTD-206	ENST00000503988	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.55	■■■■■ 4.4
DCTD-206	ENST00000503988	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.53	■■■■■ 4.4
DCTD-206	ENST00000503988	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
DCTD-206	ENST00000503988	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
DCTD-206	ENST00000503988	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.51	■■■■■ 4.4
DCTD-206	ENST00000503988	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.4
DCTD-206	ENST00000503988	MED14	O60244	1454 aa		42.5	■■■■■ 4.39
DCTD-206	ENST00000503988	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.49	■■■■■ 4.39
DCTD-206	ENST00000503988	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.48	■■■■■ 4.39
DCTD-206	ENST00000503988	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.48	■■■■■ 4.39
DCTD-206	ENST00000503988	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.47	■■■■■ 4.39
DCTD-206	ENST00000503988	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.45	■■■■■ 4.39
DCTD-206	ENST00000503988	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
DCTD-206	ENST00000503988	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
DCTD-206	ENST00000503988	CPS1	P31327	1500 aa		42.42	■■■■■ 4.38
DCTD-206	ENST00000503988	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.41	■■■■■ 4.38
DCTD-206	ENST00000503988	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.4	■■■■■ 4.38
DCTD-206	ENST00000503988	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.4	■■■■■ 4.38	3e-7	■□□□□ 10.7
DCTD-206	ENST00000503988	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.4	■■■■■ 4.38
DCTD-206	ENST00000503988	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.37	■■■■■ 4.37
DCTD-206	ENST00000503988	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.37	■■■■■ 4.37
DCTD-206	ENST00000503988	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.35	■■■■■ 4.37
DCTD-206	ENST00000503988	KANK1	Q14678	1352 aa		42.35	■■■■■ 4.37
DCTD-206	ENST00000503988	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.27	■■■■■ 4.36
DCTD-206	ENST00000503988	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.25	■■■■■ 4.35
DCTD-206	ENST00000503988	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.24	■■■■■ 4.35
DCTD-206	ENST00000503988	SLIT1	O75093	1534 aa		42.22	■■■■■ 4.35
DCTD-206	ENST00000503988	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.2	■■■■■ 4.35
DCTD-206	ENST00000503988	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.19	■■■■■ 4.34
DCTD-206	ENST00000503988	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
DCTD-206	ENST00000503988	LTK	P29376	864 aa		42.18	■■■■■ 4.34
DCTD-206	ENST00000503988	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.15	■■■■■ 4.34
DCTD-206	ENST00000503988	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DCTD-206	ENST00000503988	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DCTD-206	ENST00000503988	SYNM	O15061	1565 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DCTD-206	ENST00000503988	TOM1	O60784	492 aa		42.11	■■■■■ 4.33
DCTD-206	ENST00000503988	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
DCTD-206	ENST00000503988	HSPA1L	P34931	641 aa		42.1	■■■■■ 4.33
DCTD-206	ENST00000503988	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.07	■■■■■ 4.33
DCTD-206	ENST00000503988	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.06	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	NOS1	P29475	1434 aa		42.03	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.03	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	IDI1	Q13907	227 aa		42.03	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.02	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.01	■■■■■ 4.32
DCTD-206	ENST00000503988	SOCS7	O14512	581 aa		42	■■■■■ 4.31
DCTD-206	ENST00000503988	UNC13B	O14795	1591 aa		41.99	■■■■■ 4.31
DCTD-206	ENST00000503988	TET3	O43151	1660 aa		41.99	■■■■■ 4.31
DCTD-206	ENST00000503988	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
DCTD-206	ENST00000503988	EID1	Q9Y6B2	187 aa		41.96	■■■■■ 4.31
DCTD-206	ENST00000503988	ITGAE	P38570	1179 aa		41.95	■■■■■ 4.31
DCTD-206	ENST00000503988	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.93	■■■■■ 4.3
DCTD-206	ENST00000503988	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	41.91	■■■■■ 4.3
DCTD-206	ENST00000503988	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.9	■■■■■ 4.3
DCTD-206	ENST00000503988	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.9	■■■■■ 4.3
DCTD-206	ENST00000503988	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		41.83	■■■■■ 4.29
DCTD-206	ENST00000503988	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		41.83	■■■■■ 4.29
DCTD-206	ENST00000503988		E9PCH4	1651 aa		41.81	■■■■■ 4.28
DCTD-206	ENST00000503988	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.75	■■■■■ 4.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms