RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-208ENST00000495490 CPS1P31327 1500 aa26.27■■□□□ 1.8
TIMM17B-208ENST00000495490 PZPP20742 1482 aa26.26■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 TNRQ92752 1358 aa26.26■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.25■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 CEP162Q5TB80 1403 aa26.25■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.24■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.24■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 HSPA1LP34931 641 aa26.23■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 KIF3BO15066 747 aa26.22■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.2■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.2■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 TOM1O60784 492 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 PIP4K2BP78356 416 aa26.17■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 MIA2Q96PC5 1412 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 DEPDC5O75140 1603 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 ALKQ9UM73 1620 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 MED14O60244 1454 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 NLRP1Q9C000 1473 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.15■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.14■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.14■■□□□ 1.78
TIMM17B-208ENST00000495490 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMM17B-208ENST00000495490 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TIMM17B-208ENST00000495490 NCOA2Q15596 1464 aa26.12■■□□□ 1.77
TIMM17B-208ENST00000495490 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TIMM17B-208ENST00000495490 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.1■■□□□ 1.77
TIMM17B-208ENST00000495490 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.08■■□□□ 1.77
TIMM17B-208ENST00000495490 IQGAP1P46940 1657 aa26.08■■□□□ 1.77
TIMM17B-208ENST00000495490 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TIMM17B-208ENST00000495490 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TIMM17B-208ENST00000495490 ABCC3O15438 1527 aa26.02■■□□□ 1.76
TIMM17B-208ENST00000495490 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.01■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 TSPY4P0CV99 314 aa26■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 TSPY10P0CW01 314 aa26■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 SYNMO15061 1565 aa25.98■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.97■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 ERVK-7P63135 1459 aa25.97■■□□□ 1.75
TIMM17B-208ENST00000495490 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.95■■□□□ 1.74
TIMM17B-208ENST00000495490 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TIMM17B-208ENST00000495490 CEP152O94986 1710 aa25.92■■□□□ 1.74
TIMM17B-208ENST00000495490 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.89■■□□□ 1.73
TIMM17B-208ENST00000495490 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TIMM17B-208ENST00000495490 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TIMM17B-208ENST00000495490 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.87■■□□□ 1.73
TIMM17B-208ENST00000495490 SLIT1O75093 1534 aa25.86■■□□□ 1.73
TIMM17B-208ENST00000495490 LTKP29376 864 aa25.84■■□□□ 1.73
TIMM17B-208ENST00000495490 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
TIMM17B-208ENST00000495490 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.82■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.81■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.79■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.79■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.78■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TIMM17B-208ENST00000495490 MAP3K1Q13233 1512 aa25.76■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 PIK3C2BO00750 1634 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 ERBINQ96RT1 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 KIF15Q9NS87 1388 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 EID1Q9Y6B2 187 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TIMM17B-208ENST00000495490 ABCC5O15440 1437 aa25.68■■□□□ 1.7
TIMM17B-208ENST00000495490 TET3O43151 1660 aa25.65■■□□□ 1.7
TIMM17B-208ENST00000495490 TMEM94Q12767 1356 aa25.65■■□□□ 1.7
TIMM17B-208ENST00000495490 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.64■■□□□ 1.7
TIMM17B-208ENST00000495490 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.64■■□□□ 1.7
TIMM17B-208ENST00000495490 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.63■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 KCNA6P17658 529 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 IDI1Q13907 227 aa25.61■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 POTEAQ6S8J7 498 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 DAPK1P53355 1430 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 KANK1Q14678 1352 aa25.58■■□□□ 1.69
TIMM17B-208ENST00000495490 NWD1Q149M9 1564 aa25.57■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 NOS1P29475 1434 aa25.56■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.55■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.55■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 ADGRB3O60242 1522 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM17B-208ENST00000495490 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.49■■□□□ 1.67
TIMM17B-208ENST00000495490 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.49■■□□□ 1.67
TIMM17B-208ENST00000495490 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TIMM17B-208ENST00000495490 PHLPP1O60346 1717 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM17B-208ENST00000495490 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms