RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 DAPK1P53355 1430 aa28.05■■■□□ 2.08
PTPRU-207ENST00000492954 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.05■■■□□ 2.08
PTPRU-207ENST00000492954 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRU-207ENST00000492954 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRU-207ENST00000492954 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRU-207ENST00000492954 NCOA1Q15788 1441 aa28.02■■■□□ 2.08
PTPRU-207ENST00000492954 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
PTPRU-207ENST00000492954 KIF15Q9NS87 1388 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 PZPP20742 1482 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.99■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 FBXO41Q8TF61 875 aa27.98■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 PTPRTO14522 1441 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 TNRQ92752 1358 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRU-207ENST00000492954 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.95■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 ABCC3O15438 1527 aa27.95■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 ERBINQ96RT1 1412 aa27.93■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.93■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 CERKQ8TCT0 537 aa27.91■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.91■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.9■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 PLA2R1Q13018 1463 aa27.89■■■□□ 2.06
PTPRU-207ENST00000492954 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PTPRU-207ENST00000492954 PKD2Q13563 968 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRU-207ENST00000492954 CEP152O94986 1710 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRU-207ENST00000492954 ADGRL2O95490 1459 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRU-207ENST00000492954 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PTPRU-207ENST00000492954 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
PTPRU-207ENST00000492954 ERVK-7P63135 1459 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRU-207ENST00000492954 NLRP1Q9C000 1473 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRU-207ENST00000492954 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.81■■■□□ 2.04
PTPRU-207ENST00000492954 DEPDC5O75140 1603 aa27.79■■■□□ 2.04
PTPRU-207ENST00000492954 KANK1Q14678 1352 aa27.76■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.76■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.75■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.75■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.7■■■□□ 2.03
PTPRU-207ENST00000492954 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.69■■■□□ 2.02
PTPRU-207ENST00000492954 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.69■■■□□ 2.02
PTPRU-207ENST00000492954 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.68■■■□□ 2.02
PTPRU-207ENST00000492954 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PTPRU-207ENST00000492954 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PTPRU-207ENST00000492954 ROCK1Q13464 1354 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRU-207ENST00000492954 ITGAEP38570 1179 aa27.63■■■□□ 2.01
PTPRU-207ENST00000492954 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.6■■■□□ 2.01
PTPRU-207ENST00000492954 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PTPRU-207ENST00000492954 MED14O60244 1454 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRU-207ENST00000492954 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRU-207ENST00000492954 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRU-207ENST00000492954 NOS1P29475 1434 aa27.55■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 SYNMO15061 1565 aa27.54■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 PIK3C2BO00750 1634 aa27.53■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 UNC13BO14795 1591 aa27.53■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 IDI1Q13907 227 aa27.52■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.51■■■□□ 2
PTPRU-207ENST00000492954 IQGAP1P46940 1657 aa27.51■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 SLIT1O75093 1534 aa27.51■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 LTKP29376 864 aa27.5■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.5■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 TET3O43151 1660 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 CPS1P31327 1500 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRU-207ENST00000492954 EID1Q9Y6B2 187 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 ADGRB3O60242 1522 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 NUP155O75694 1391 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRU-207ENST00000492954 E9PCH4 1651 aa27.37■■□□□ 1.97
PTPRU-207ENST00000492954 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRU-207ENST00000492954 NAIPQ13075 1403 aa27.33■■□□□ 1.96
PTPRU-207ENST00000492954 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRU-207ENST00000492954 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRU-207ENST00000492954 ZFYVE9O95405 1425 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRU-207ENST00000492954 TOM1O60784 492 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 HFM1A2PYH4 1435 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms