RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492601.2

SGMS1-204, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-204ENST00000492601 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SGMS1-204ENST00000492601 PTPRTO14522 1441 aa27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-204ENST00000492601 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-204ENST00000492601 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.07■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.07■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 PZPP20742 1482 aa27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-204ENST00000492601 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 A2ML1A8K2U0 1454 aa27■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 TNRQ92752 1358 aa26.99■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 PLA2R1Q13018 1463 aa26.99■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 CEP152O94986 1710 aa26.99■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 ABCC5O15440 1437 aa26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.97■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.96■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 ABCC3O15438 1527 aa26.95■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.95■■□□□ 1.91
SGMS1-204ENST00000492601 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SGMS1-204ENST00000492601 PKD2Q13563 968 aa26.94■■□□□ 1.9
SGMS1-204ENST00000492601 DAPK1P53355 1430 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-204ENST00000492601 KIF15Q9NS87 1388 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-204ENST00000492601 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.9■■□□□ 1.9
SGMS1-204ENST00000492601 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.86■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 NLRP1Q9C000 1473 aa26.86■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.85■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 ERBINQ96RT1 1412 aa26.85■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.84■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.84■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SGMS1-204ENST00000492601 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 ERVK-7P63135 1459 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 DEPDC5O75140 1603 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.8■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.8■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SGMS1-204ENST00000492601 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.76■■□□□ 1.87
SGMS1-204ENST00000492601 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.75■■□□□ 1.87
SGMS1-204ENST00000492601 KANK1Q14678 1352 aa26.72■■□□□ 1.87
SGMS1-204ENST00000492601 IQGAP1P46940 1657 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-204ENST00000492601 ADGRL2O95490 1459 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-204ENST00000492601 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-204ENST00000492601 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SGMS1-204ENST00000492601 MED14O60244 1454 aa26.68■■□□□ 1.86
SGMS1-204ENST00000492601 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.67■■□□□ 1.86
SGMS1-204ENST00000492601 PIK3C2BO00750 1634 aa26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-204ENST00000492601 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-204ENST00000492601 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.64■■□□□ 1.85
SGMS1-204ENST00000492601 CPS1P31327 1500 aa26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-204ENST00000492601 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-204ENST00000492601 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-204ENST00000492601 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-204ENST00000492601 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.6■■□□□ 1.85
SGMS1-204ENST00000492601 SYNMO15061 1565 aa26.58■■□□□ 1.85
SGMS1-204ENST00000492601 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 SLIT1O75093 1534 aa26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.55■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 LTKP29376 864 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 TET3O43151 1660 aa26.52■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 IDI1Q13907 227 aa26.52■■□□□ 1.84
SGMS1-204ENST00000492601 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 UNC13BO14795 1591 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 NOS1P29475 1434 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 ITGAEP38570 1179 aa26.51■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.5■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 EID1Q9Y6B2 187 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 ROCK1Q13464 1354 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 ADGRB3O60242 1522 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 PIP4K2BP78356 416 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-204ENST00000492601 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 TOM1O60784 492 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 E9PCH4 1651 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 ALKQ9UM73 1620 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-204ENST00000492601 HSPA1LP34931 641 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-204ENST00000492601 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-204ENST00000492601 NUP155O75694 1391 aa26.33■■□□□ 1.81
SGMS1-204ENST00000492601 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.33■■□□□ 1.81
SGMS1-204ENST00000492601 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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