RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
RBM3-211ENST00000491240 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.63■■□□□ 1.69
RBM3-211ENST00000491240 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.6■■□□□ 1.69
RBM3-211ENST00000491240 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RBM3-211ENST00000491240 MIA2Q96PC5 1412 aa25.58■■□□□ 1.69
RBM3-211ENST00000491240 TNRQ92752 1358 aa25.57■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.56■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.55■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.54■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 PZPP20742 1482 aa25.54■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 PKD2Q13563 968 aa25.53■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 PLA2R1Q13018 1463 aa25.53■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RBM3-211ENST00000491240 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.5■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.5■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 ABCC5O15440 1437 aa25.48■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.47■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 ABCC3O15438 1527 aa25.47■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.46■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 KIF15Q9NS87 1388 aa25.45■■□□□ 1.67
RBM3-211ENST00000491240 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.44■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.43■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.43■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 DAPK1P53355 1430 aa25.43■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 CEP152O94986 1710 aa25.43■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.42■■□□□ 1.66
RBM3-211ENST00000491240 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.39■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.39■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.38■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 NLRP1Q9C000 1473 aa25.38■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.38■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 ERVK-7P63135 1459 aa25.37■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.35■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.34■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 ERBINQ96RT1 1412 aa25.33■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.33■■□□□ 1.65
RBM3-211ENST00000491240 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.31■■□□□ 1.64
RBM3-211ENST00000491240 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RBM3-211ENST00000491240 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RBM3-211ENST00000491240 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 KANK1Q14678 1352 aa25.26■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.24■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 DEPDC5O75140 1603 aa25.23■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.22■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.21■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 IQGAP1P46940 1657 aa25.21■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.21■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 MED14O60244 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
RBM3-211ENST00000491240 PIP4K2BP78356 416 aa25.2■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 CPS1P31327 1500 aa25.18■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 LTKP29376 864 aa25.18■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.18■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.18■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 ADGRL2O95490 1459 aa25.16■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 PIK3C2BO00750 1634 aa25.15■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.14■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 ITGAEP38570 1179 aa25.14■■□□□ 1.62
RBM3-211ENST00000491240 IDI1Q13907 227 aa25.13■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 ILDR2Q71H61 639 aa25.12■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.12■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.12■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 TOM1O60784 492 aa25.11■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.1■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 EID1Q9Y6B2 187 aa25.1■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 SLIT1O75093 1534 aa25.09■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 SYNMO15061 1565 aa25.09■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.08■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 HSPA1LP34931 641 aa25.08■■□□□ 1.61
RBM3-211ENST00000491240 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.07■■□□□ 1.6
RBM3-211ENST00000491240 NOS1P29475 1434 aa25.05■■□□□ 1.6
RBM3-211ENST00000491240 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.05■■□□□ 1.6
RBM3-211ENST00000491240 SLC26A8Q96RN1 970 aa25■■□□□ 1.59
RBM3-211ENST00000491240 ALKQ9UM73 1620 aa25■■□□□ 1.59
RBM3-211ENST00000491240 BCANQ96GW7 911 aa24.99■■□□□ 1.59
RBM3-211ENST00000491240 ADGRB3O60242 1522 aa24.98■■□□□ 1.59
RBM3-211ENST00000491240 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.98■■□□□ 1.59
RBM3-211ENST00000491240 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RBM3-211ENST00000491240 TET3O43151 1660 aa24.97■■□□□ 1.59
RBM3-211ENST00000491240 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RBM3-211ENST00000491240 UNC13BO14795 1591 aa24.95■■□□□ 1.58
RBM3-211ENST00000491240 ROCK1Q13464 1354 aa24.94■■□□□ 1.58
RBM3-211ENST00000491240 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RBM3-211ENST00000491240 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RBM3-211ENST00000491240 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.93■■□□□ 1.58
RBM3-211ENST00000491240 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.91■■□□□ 1.58
RBM3-211ENST00000491240 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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