RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-216ENST00000489424 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.87■■□□□ 1.89
HDAC10-216ENST00000489424 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.85■■□□□ 1.89
HDAC10-216ENST00000489424 ABCC5O15440 1437 aa26.82■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 PZPP20742 1482 aa26.81■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.81■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.81■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 NCOA1Q15788 1441 aa26.81■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 PLA2R1Q13018 1463 aa26.79■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 PKD2Q13563 968 aa26.78■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 DAPK1P53355 1430 aa26.78■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 ERBINQ96RT1 1412 aa26.77■■□□□ 1.88
HDAC10-216ENST00000489424 KIF15Q9NS87 1388 aa26.75■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.74■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 TNRQ92752 1358 aa26.74■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 CERKQ8TCT0 537 aa26.74■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.73■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HDAC10-216ENST00000489424 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.7■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.7■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 NLRP1Q9C000 1473 aa26.69■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.69■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.68■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 ABCC3O15438 1527 aa26.68■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.67■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 ADGRL2O95490 1459 aa26.66■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HDAC10-216ENST00000489424 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.63■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 KANK1Q14678 1352 aa26.61■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.6■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.6■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.58■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.58■■□□□ 1.85
HDAC10-216ENST00000489424 ERVK-7P63135 1459 aa26.56■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.56■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.55■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 DEPDC5O75140 1603 aa26.55■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 ROCK1Q13464 1354 aa26.53■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.53■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.53■■□□□ 1.84
HDAC10-216ENST00000489424 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.51■■□□□ 1.83
HDAC10-216ENST00000489424 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.51■■□□□ 1.83
HDAC10-216ENST00000489424 MED14O60244 1454 aa26.49■■□□□ 1.83
HDAC10-216ENST00000489424 CEP152O94986 1710 aa26.48■■□□□ 1.83
HDAC10-216ENST00000489424 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
HDAC10-216ENST00000489424 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HDAC10-216ENST00000489424 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HDAC10-216ENST00000489424 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HDAC10-216ENST00000489424 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.41■■□□□ 1.82
HDAC10-216ENST00000489424 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.39■■□□□ 1.82
HDAC10-216ENST00000489424 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 NOS1P29475 1434 aa26.39■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.36■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 SLIT1O75093 1534 aa26.36■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.35■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 CPS1P31327 1500 aa26.34■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 IDI1Q13907 227 aa26.33■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 EID1Q9Y6B2 187 aa26.33■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
HDAC10-216ENST00000489424 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.31■■□□□ 1.8
HDAC10-216ENST00000489424 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
HDAC10-216ENST00000489424 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.3■■□□□ 1.8
HDAC10-216ENST00000489424 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.29■■□□□ 1.8
HDAC10-216ENST00000489424 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.29■■□□□ 1.8
HDAC10-216ENST00000489424 UNC13BO14795 1591 aa26.28■■□□□ 1.8
HDAC10-216ENST00000489424 LTKP29376 864 aa26.26■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 TET3O43151 1660 aa26.25■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 IQGAP1P46940 1657 aa26.24■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 SYNMO15061 1565 aa26.23■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 PIK3C2BO00750 1634 aa26.22■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.21■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 NUP155O75694 1391 aa26.2■■□□□ 1.79
HDAC10-216ENST00000489424 ITGAEP38570 1179 aa26.2■■□□□ 1.78
HDAC10-216ENST00000489424 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.18■■□□□ 1.78
HDAC10-216ENST00000489424 TOM1O60784 492 aa26.18■■□□□ 1.78
HDAC10-216ENST00000489424 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.17■■□□□ 1.78
HDAC10-216ENST00000489424 ADGRB3O60242 1522 aa26.17■■□□□ 1.78
HDAC10-216ENST00000489424 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.14■■□□□ 1.78
HDAC10-216ENST00000489424 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
HDAC10-216ENST00000489424 NAIPQ13075 1403 aa26.11■■□□□ 1.77
HDAC10-216ENST00000489424 ZFYVE9O95405 1425 aa26.09■■□□□ 1.77
HDAC10-216ENST00000489424 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.09■■□□□ 1.77
HDAC10-216ENST00000489424 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.08■■□□□ 1.77
HDAC10-216ENST00000489424 HFM1A2PYH4 1435 aa26.08■■□□□ 1.77
HDAC10-216ENST00000489424 KCNA6P17658 529 aa26.07■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.07■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 E9PCH4 1651 aa26.06■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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