RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487097.1

AC096888.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC096888.1, Length 565 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC096888.1-201ENST00000487097 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.84■■■■■ 4.13
AC096888.1-201ENST00000487097 CERKQ8TCT0 537 aa40.81■■■■■ 4.12
AC096888.1-201ENST00000487097 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.81■■■■■ 4.12
AC096888.1-201ENST00000487097 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
AC096888.1-201ENST00000487097 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
AC096888.1-201ENST00000487097 PZPP20742 1482 aa40.76■■■■■ 4.12
AC096888.1-201ENST00000487097 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.75■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.75■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 PLA2R1Q13018 1463 aa40.72■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.72■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 ABCC5O15440 1437 aa40.71■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.71■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
AC096888.1-201ENST00000487097 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.69■■■■■ 4.1
AC096888.1-201ENST00000487097 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.68■■■■■ 4.1
AC096888.1-201ENST00000487097 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.67■■■■■ 4.1
AC096888.1-201ENST00000487097 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
AC096888.1-201ENST00000487097 TNRQ92752 1358 aa40.66■■■■■ 4.1
AC096888.1-201ENST00000487097 ABCC3O15438 1527 aa40.63■■■■■ 4.1
AC096888.1-201ENST00000487097 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.63■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 DAPK1P53355 1430 aa40.62■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 PKD2Q13563 968 aa40.62■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.62■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 KIF15Q9NS87 1388 aa40.61■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.57■■■■■ 4.09
AC096888.1-201ENST00000487097 ERBINQ96RT1 1412 aa40.55■■■■■ 4.08
AC096888.1-201ENST00000487097 NLRP1Q9C000 1473 aa40.51■■■■■ 4.08
AC096888.1-201ENST00000487097 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.5■■■■■ 4.07
AC096888.1-201ENST00000487097 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.48■■■■■ 4.07
AC096888.1-201ENST00000487097 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
AC096888.1-201ENST00000487097 CEP152O94986 1710 aa40.45■■■■■ 4.07
AC096888.1-201ENST00000487097 ERVK-7P63135 1459 aa40.44■■■■■ 4.06
AC096888.1-201ENST00000487097 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.43■■■■■ 4.06
AC096888.1-201ENST00000487097 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.42■■■■■ 4.06
AC096888.1-201ENST00000487097 DEPDC5O75140 1603 aa40.42■■■■■ 4.06
AC096888.1-201ENST00000487097 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.39■■■■■ 4.06
AC096888.1-201ENST00000487097 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
AC096888.1-201ENST00000487097 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.37■■■■■ 4.05
AC096888.1-201ENST00000487097 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.37■■■■■ 4.05
AC096888.1-201ENST00000487097 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
AC096888.1-201ENST00000487097 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.37■■■■■ 4.05
AC096888.1-201ENST00000487097 ADGRL2O95490 1459 aa40.37■■■■■ 4.05
AC096888.1-201ENST00000487097 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
AC096888.1-201ENST00000487097 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
AC096888.1-201ENST00000487097 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
AC096888.1-201ENST00000487097 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
AC096888.1-201ENST00000487097 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.29■■■■■ 4.04
AC096888.1-201ENST00000487097 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.27■■■■■ 4.04
AC096888.1-201ENST00000487097 KANK1Q14678 1352 aa40.26■■■■■ 4.04
AC096888.1-201ENST00000487097 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
AC096888.1-201ENST00000487097 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.26■■■■■ 4.03
AC096888.1-201ENST00000487097 MED14O60244 1454 aa40.26■■■■■ 4.03
AC096888.1-201ENST00000487097 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.19■■■■■ 4.02
AC096888.1-201ENST00000487097 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
AC096888.1-201ENST00000487097 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.16■■■■■ 4.02
AC096888.1-201ENST00000487097 IQGAP1P46940 1657 aa40.11■■■■■ 4.01
AC096888.1-201ENST00000487097 CPS1P31327 1500 aa40.1■■■■■ 4.01
AC096888.1-201ENST00000487097 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.1■■■■■ 4.01
AC096888.1-201ENST00000487097 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.08■■■■■ 4.01
AC096888.1-201ENST00000487097 SLIT1O75093 1534 aa40.07■■■■■ 4.01
AC096888.1-201ENST00000487097 ROCK1Q13464 1354 aa40.05■■■■■ 4
AC096888.1-201ENST00000487097 NOS1P29475 1434 aa40.04■■■■■ 4
AC096888.1-201ENST00000487097 PIK3C2BO00750 1634 aa40.04■■■■■ 4
AC096888.1-201ENST00000487097 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
AC096888.1-201ENST00000487097 SYNMO15061 1565 aa40.01■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.99■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 LTKP29376 864 aa39.97■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 IDI1Q13907 227 aa39.97■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 UNC13BO14795 1591 aa39.96■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.95■■■■□ 3.99
AC096888.1-201ENST00000487097 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.94■■■■□ 3.98
AC096888.1-201ENST00000487097 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
AC096888.1-201ENST00000487097 TET3O43151 1660 aa39.92■■■■□ 3.98
AC096888.1-201ENST00000487097 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.89■■■■□ 3.98
AC096888.1-201ENST00000487097 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.88■■■■□ 3.97
AC096888.1-201ENST00000487097 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.88■■■■□ 3.97
AC096888.1-201ENST00000487097 EID1Q9Y6B2 187 aa39.88■■■■□ 3.97
AC096888.1-201ENST00000487097 ADGRB3O60242 1522 aa39.86■■■■□ 3.97
AC096888.1-201ENST00000487097 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.85■■■■□ 3.97
AC096888.1-201ENST00000487097 ITGAEP38570 1179 aa39.8■■■■□ 3.96
AC096888.1-201ENST00000487097 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.8■■■■□ 3.96
AC096888.1-201ENST00000487097 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.79■■■■□ 3.96
AC096888.1-201ENST00000487097 TOM1O60784 492 aa39.78■■■■□ 3.96
AC096888.1-201ENST00000487097 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
AC096888.1-201ENST00000487097 E9PCH4 1651 aa39.73■■■■□ 3.95
AC096888.1-201ENST00000487097 ALKQ9UM73 1620 aa39.73■■■■□ 3.95
AC096888.1-201ENST00000487097 NUP155O75694 1391 aa39.7■■■■□ 3.95
AC096888.1-201ENST00000487097 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.67■■■■□ 3.94
AC096888.1-201ENST00000487097 ZFYVE9O95405 1425 aa39.66■■■■□ 3.94
AC096888.1-201ENST00000487097 PIP4K2BP78356 416 aa39.65■■■■□ 3.94
AC096888.1-201ENST00000487097 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.64■■■■□ 3.94
AC096888.1-201ENST00000487097 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.64■■■■□ 3.94
AC096888.1-201ENST00000487097 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
AC096888.1-201ENST00000487097 HSPA1LP34931 641 aa39.58■■■■□ 3.93
AC096888.1-201ENST00000487097 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.57■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms