RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483227.5

TSPAN32-210, Transcript of tetraspanin 32, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPAN32, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN32-210ENST00000483227 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.44■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.44■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 STRCQ7RTU9 1775 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 NCOA1Q15788 1441 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 PZPP20742 1482 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 CERKQ8TCT0 537 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPAN32-210ENST00000483227 DAPK1P53355 1430 aa30.39■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 KIF15Q9NS87 1388 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 PKD2Q13563 968 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 TNRQ92752 1358 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 PLA2R1Q13018 1463 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.33■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
TSPAN32-210ENST00000483227 ERBINQ96RT1 1412 aa30.32■■■□□ 2.44
TSPAN32-210ENST00000483227 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
TSPAN32-210ENST00000483227 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.31■■■□□ 2.44
TSPAN32-210ENST00000483227 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.29■■■□□ 2.44
TSPAN32-210ENST00000483227 ABCC3O15438 1527 aa30.28■■■□□ 2.44
TSPAN32-210ENST00000483227 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.28■■■□□ 2.44
TSPAN32-210ENST00000483227 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
TSPAN32-210ENST00000483227 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPAN32-210ENST00000483227 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TSPAN32-210ENST00000483227 NLRP1Q9C000 1473 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPAN32-210ENST00000483227 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TSPAN32-210ENST00000483227 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPAN32-210ENST00000483227 KANK1Q14678 1352 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 ADGRL2O95490 1459 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 ERVK-7P63135 1459 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPAN32-210ENST00000483227 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN32-210ENST00000483227 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN32-210ENST00000483227 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
TSPAN32-210ENST00000483227 DEPDC5O75140 1603 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN32-210ENST00000483227 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN32-210ENST00000483227 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN32-210ENST00000483227 CEP152O94986 1710 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN32-210ENST00000483227 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TSPAN32-210ENST00000483227 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.06■■■□□ 2.4
TSPAN32-210ENST00000483227 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN32-210ENST00000483227 ROCK1Q13464 1354 aa30.03■■■□□ 2.4
TSPAN32-210ENST00000483227 MED14O60244 1454 aa30■■■□□ 2.39
TSPAN32-210ENST00000483227 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TSPAN32-210ENST00000483227 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.98■■■□□ 2.39
TSPAN32-210ENST00000483227 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
TSPAN32-210ENST00000483227 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
TSPAN32-210ENST00000483227 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.91■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.91■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 NOS1P29475 1434 aa29.9■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 IDI1Q13907 227 aa29.9■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.9■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 ITGAEP38570 1179 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 EID1Q9Y6B2 187 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN32-210ENST00000483227 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.88■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 SLIT1O75093 1534 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 CPS1P31327 1500 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 LTKP29376 864 aa29.85■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.84■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.83■■■□□ 2.37
TSPAN32-210ENST00000483227 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 IQGAP1P46940 1657 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 PIK3C2BO00750 1634 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 UNC13BO14795 1591 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 SYNMO15061 1565 aa29.79■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 TET3O43151 1660 aa29.78■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 NUP155O75694 1391 aa29.77■■■□□ 2.36
TSPAN32-210ENST00000483227 TOM1O60784 492 aa29.73■■■□□ 2.35
TSPAN32-210ENST00000483227 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
TSPAN32-210ENST00000483227 ADGRB3O60242 1522 aa29.7■■■□□ 2.34
TSPAN32-210ENST00000483227 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.69■■■□□ 2.34
TSPAN32-210ENST00000483227 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.69■■■□□ 2.34
TSPAN32-210ENST00000483227 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.62■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 E9PCH4 1651 aa29.6■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 NAIPQ13075 1403 aa29.6■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 ZFYVE9O95405 1425 aa29.58■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 KCNA6P17658 529 aa29.58■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.58■■■□□ 2.33
TSPAN32-210ENST00000483227 PIP4K2BP78356 416 aa29.57■■■□□ 2.32
TSPAN32-210ENST00000483227 BCANQ96GW7 911 aa29.57■■■□□ 2.32
TSPAN32-210ENST00000483227 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms