RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483227.5

TSPAN32-210, Transcript of tetraspanin 32, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPAN32, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN32-210ENST00000483227 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.29■■■■■ 5.32
TSPAN32-210ENST00000483227 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.08■■■■■ 4.49
TSPAN32-210ENST00000483227 ABCC9O60706 1549 aa42.68■■■■■ 4.42
TSPAN32-210ENST00000483227 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.86■■■■■ 4.13
TSPAN32-210ENST00000483227 NACADO15069 1562 aa40.73■■■■■ 4.11
TSPAN32-210ENST00000483227 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.62■■■■■ 4.09
TSPAN32-210ENST00000483227 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.37■■■■■ 4.05
TSPAN32-210ENST00000483227 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
TSPAN32-210ENST00000483227 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.98■■■■□ 3.99
TSPAN32-210ENST00000483227 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.86■■■■□ 3.97
TSPAN32-210ENST00000483227 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.73■■■■□ 3.95
TSPAN32-210ENST00000483227 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.71■■■■□ 3.95
TSPAN32-210ENST00000483227 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.58■■■■□ 3.93
TSPAN32-210ENST00000483227 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.26■■■■□ 3.88
TSPAN32-210ENST00000483227 SCRIBQ14160 1630 aa39.22■■■■□ 3.87
TSPAN32-210ENST00000483227 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
TSPAN32-210ENST00000483227 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.56■■■■□ 3.76
TSPAN32-210ENST00000483227 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.46■■■■□ 3.75
TSPAN32-210ENST00000483227 NCAPD3P42695 1498 aa37.64■■■■□ 3.62
TSPAN32-210ENST00000483227 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.53■■■■□ 3.6
TSPAN32-210ENST00000483227 SMARCA4P51532 1647 aa37.51■■■■□ 3.6
TSPAN32-210ENST00000483227 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
TSPAN32-210ENST00000483227 SMARCA2P51531 1590 aa37.46■■■■□ 3.59
TSPAN32-210ENST00000483227 HMGXB3Q12766 1538 aa37.32■■■■□ 3.57
TSPAN32-210ENST00000483227 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.22■■■■□ 3.55
TSPAN32-210ENST00000483227 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
TSPAN32-210ENST00000483227 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.17■■■■□ 3.54
TSPAN32-210ENST00000483227 ERCC6Q03468 1493 aa36.88■■■■□ 3.49
TSPAN32-210ENST00000483227 NESP48681 1621 aa36.75■■■■□ 3.47
TSPAN32-210ENST00000483227 CUX2O14529 1486 aa36.7■■■■□ 3.47
TSPAN32-210ENST00000483227 WIZO95785 1651 aa36.67■■■■□ 3.46
TSPAN32-210ENST00000483227 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.66■■■■□ 3.46
TSPAN32-210ENST00000483227 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
TSPAN32-210ENST00000483227 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.52■■■■□ 3.44
TSPAN32-210ENST00000483227 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.51■■■■□ 3.43
TSPAN32-210ENST00000483227 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
TSPAN32-210ENST00000483227 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
TSPAN32-210ENST00000483227 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.25■■■■□ 3.39
TSPAN32-210ENST00000483227 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.22■■■■□ 3.39
TSPAN32-210ENST00000483227 CFTRP13569 1480 aa36.16■■■■□ 3.38
TSPAN32-210ENST00000483227 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.09■■■■□ 3.37
TSPAN32-210ENST00000483227 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.04■■■■□ 3.36
TSPAN32-210ENST00000483227 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.03■■■■□ 3.36
TSPAN32-210ENST00000483227 WDR62O43379 1518 aa35.96■■■■□ 3.35
TSPAN32-210ENST00000483227 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.94■■■■□ 3.34
TSPAN32-210ENST00000483227 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
TSPAN32-210ENST00000483227 PRDM2Q13029 1718 aa35.63■■■■□ 3.29
TSPAN32-210ENST00000483227 ABCC8Q09428 1581 aa35.45■■■■□ 3.27
TSPAN32-210ENST00000483227 TOPBP1Q92547 1522 aa35.38■■■■□ 3.25
TSPAN32-210ENST00000483227 IFT140Q96RY7 1462 aa35.34■■■■□ 3.25
TSPAN32-210ENST00000483227 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
TSPAN32-210ENST00000483227 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.28■■■■□ 3.24
TSPAN32-210ENST00000483227 OSCARQ8IYS5 282 aa35.18■■■■□ 3.22
TSPAN32-210ENST00000483227 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
TSPAN32-210ENST00000483227 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TSPAN32-210ENST00000483227 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
TSPAN32-210ENST00000483227 SOGA1O94964 1423 aa34.96■■■■□ 3.19
TSPAN32-210ENST00000483227 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
TSPAN32-210ENST00000483227 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.181e-10■■■■■ 39.9
TSPAN32-210ENST00000483227 CUX1P39880 1505 aa34.89■■■■□ 3.18
TSPAN32-210ENST00000483227 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.88■■■■□ 3.17
TSPAN32-210ENST00000483227 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.87■■■■□ 3.17
TSPAN32-210ENST00000483227 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
TSPAN32-210ENST00000483227 WDR97A6NE52 1622 aa34.75■■■■□ 3.15
TSPAN32-210ENST00000483227 TRIM41Q8WV44 630 aa34.75■■■■□ 3.15
TSPAN32-210ENST00000483227 FBLN2P98095 1184 aa34.66■■■■□ 3.14
TSPAN32-210ENST00000483227 GRIN2BQ13224 1484 aa34.59■■■■□ 3.13
TSPAN32-210ENST00000483227 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
TSPAN32-210ENST00000483227 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.55■■■■□ 3.12
TSPAN32-210ENST00000483227 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.55■■■■□ 3.12
TSPAN32-210ENST00000483227 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
TSPAN32-210ENST00000483227 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
TSPAN32-210ENST00000483227 CHD1O14646 1710 aa34.52■■■■□ 3.12
TSPAN32-210ENST00000483227 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.52■■■■□ 3.12
TSPAN32-210ENST00000483227 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
TSPAN32-210ENST00000483227 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
TSPAN32-210ENST00000483227 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
TSPAN32-210ENST00000483227 ARHGEF11O15085 1522 aa34.46■■■■□ 3.11
TSPAN32-210ENST00000483227 TOP2BQ02880 1626 aa34.46■■■■□ 3.11
TSPAN32-210ENST00000483227 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.42■■■■□ 3.1
TSPAN32-210ENST00000483227 SYNJ2O15056 1496 aa34.42■■■■□ 3.1
TSPAN32-210ENST00000483227 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.37■■■■□ 3.09
TSPAN32-210ENST00000483227 SYNJ1O43426 1573 aa34.37■■■■□ 3.09
TSPAN32-210ENST00000483227 PBRM1Q86U86 1689 aa34.31■■■■□ 3.08
TSPAN32-210ENST00000483227 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.27■■■■□ 3.08
TSPAN32-210ENST00000483227 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPAN32-210ENST00000483227 ARAP1Q96P48 1450 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPAN32-210ENST00000483227 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.13■■■■□ 3.05
TSPAN32-210ENST00000483227 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.13■■■■□ 3.05
TSPAN32-210ENST00000483227 GRIN2AQ12879 1464 aa34.11■■■■□ 3.05
TSPAN32-210ENST00000483227 ADAMTS12P58397 1594 aa34.07■■■■□ 3.05
TSPAN32-210ENST00000483227 NUP160Q12769 1436 aa34.01■■■■□ 3.03
TSPAN32-210ENST00000483227 KIF27Q86VH2 1401 aa33.9■■■■□ 3.02
TSPAN32-210ENST00000483227 CEP170Q5SW79 1584 aa33.89■■■■□ 3.02
TSPAN32-210ENST00000483227 IGF1RP08069 1367 aa33.85■■■■□ 3.01
TSPAN32-210ENST00000483227 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
TSPAN32-210ENST00000483227 JPH4Q96JJ6 628 aa33.74■■■□□ 2.99
TSPAN32-210ENST00000483227 SHROOM2Q13796 1616 aa33.73■■■□□ 2.99
TSPAN32-210ENST00000483227 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.68■■■□□ 2.98
TSPAN32-210ENST00000483227 CUL7Q14999 1698 aa33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms