RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.15■■■□□ 2.26
CLK1-211ENST00000481641 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.14■■■□□ 2.26
CLK1-211ENST00000481641 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.14■■■□□ 2.25
CLK1-211ENST00000481641 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CLK1-211ENST00000481641 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.13■■■□□ 2.25
CLK1-211ENST00000481641 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CLK1-211ENST00000481641 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.06■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 PZPP20742 1482 aa29.06■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 TNRQ92752 1358 aa29.06■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.04■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.04■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 ABCC5O15440 1437 aa29.03■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 PLA2R1Q13018 1463 aa29.03■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.02■■■□□ 2.24
CLK1-211ENST00000481641 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 PKD2Q13563 968 aa29■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 FGD6Q6ZV73 1430 aa29■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.99■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 ABCC3O15438 1527 aa28.99■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.98■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.98■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.97■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 KIF15Q9NS87 1388 aa28.97■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 DAPK1P53355 1430 aa28.96■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CLK1-211ENST00000481641 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.95■■■□□ 2.22
CLK1-211ENST00000481641 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.94■■■□□ 2.22
CLK1-211ENST00000481641 CEP152O94986 1710 aa28.92■■■□□ 2.22
CLK1-211ENST00000481641 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CLK1-211ENST00000481641 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CLK1-211ENST00000481641 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 NLRP1Q9C000 1473 aa28.88■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 ERBINQ96RT1 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.213e-13■■□□□ 11.8
CLK1-211ENST00000481641 ERVK-7P63135 1459 aa28.85■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.85■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.85■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.84■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CLK1-211ENST00000481641 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.82■■■□□ 2.2
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.82■■■□□ 2.2
CLK1-211ENST00000481641 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
CLK1-211ENST00000481641 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
CLK1-211ENST00000481641 DEPDC5O75140 1603 aa28.76■■■□□ 2.2
CLK1-211ENST00000481641 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.74■■■□□ 2.19
CLK1-211ENST00000481641 KANK1Q14678 1352 aa28.73■■■□□ 2.19
CLK1-211ENST00000481641 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CLK1-211ENST00000481641 ADGRL2O95490 1459 aa28.72■■■□□ 2.19
CLK1-211ENST00000481641 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.7■■■□□ 2.18
CLK1-211ENST00000481641 MED14O60244 1454 aa28.7■■■□□ 2.18
CLK1-211ENST00000481641 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.69■■■□□ 2.18
CLK1-211ENST00000481641 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CLK1-211ENST00000481641 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.67■■■□□ 2.18
CLK1-211ENST00000481641 IQGAP1P46940 1657 aa28.65■■■□□ 2.18
CLK1-211ENST00000481641 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.64■■■□□ 2.18
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.62■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 CPS1P31327 1500 aa28.61■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 LTKP29376 864 aa28.61■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 PIK3C2BO00750 1634 aa28.61■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.59■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 IDI1Q13907 227 aa28.58■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.58■■■□□ 2.17
CLK1-211ENST00000481641 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.57■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.57■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 SYNMO15061 1565 aa28.56■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 SLIT1O75093 1534 aa28.56■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.55■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 ITGAEP38570 1179 aa28.54■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 NOS1P29475 1434 aa28.53■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.51■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.51■■■□□ 2.16
CLK1-211ENST00000481641 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CLK1-211ENST00000481641 PIP4K2BP78356 416 aa28.51■■■□□ 2.15
CLK1-211ENST00000481641 EID1Q9Y6B2 187 aa28.51■■■□□ 2.15
CLK1-211ENST00000481641 TOM1O60784 492 aa28.48■■■□□ 2.15
CLK1-211ENST00000481641 ROCK1Q13464 1354 aa28.47■■■□□ 2.15
CLK1-211ENST00000481641 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.45■■■□□ 2.15
CLK1-211ENST00000481641 UNC13BO14795 1591 aa28.45■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 TET3O43151 1660 aa28.45■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.43■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 ADGRB3O60242 1522 aa28.42■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 ALKQ9UM73 1620 aa28.41■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 HSPA1LP34931 641 aa28.4■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.39■■■□□ 2.14
CLK1-211ENST00000481641 ILDR2Q71H61 639 aa28.38■■■□□ 2.13
CLK1-211ENST00000481641 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CLK1-211ENST00000481641 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.37■■■□□ 2.13
CLK1-211ENST00000481641 E9PCH4 1651 aa28.36■■■□□ 2.13
CLK1-211ENST00000481641 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.36■■■□□ 2.13
CLK1-211ENST00000481641 NUP155O75694 1391 aa28.35■■■□□ 2.13
CLK1-211ENST00000481641 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.34■■■□□ 2.13
CLK1-211ENST00000481641 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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