RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481605.5

TTC3-217, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 1,540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-217ENST00000481605 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.78■■■■□ 3.48
TTC3-217ENST00000481605 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.77■■■■□ 3.48
TTC3-217ENST00000481605 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.76■■■■□ 3.48
TTC3-217ENST00000481605 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
TTC3-217ENST00000481605 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
TTC3-217ENST00000481605 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.7■■■■□ 3.47
TTC3-217ENST00000481605 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 PZPP20742 1482 aa36.68■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.66■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.65■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 ABCC5O15440 1437 aa36.65■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 TNRQ92752 1358 aa36.65■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 PLA2R1Q13018 1463 aa36.64■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
TTC3-217ENST00000481605 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.63■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.62■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.61■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.6■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 PKD2Q13563 968 aa36.59■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 KIF15Q9NS87 1388 aa36.58■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 DAPK1P53355 1430 aa36.58■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 ABCC3O15438 1527 aa36.57■■■■□ 3.45
TTC3-217ENST00000481605 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.56■■■■□ 3.44
TTC3-217ENST00000481605 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
TTC3-217ENST00000481605 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.54■■■■□ 3.44
TTC3-217ENST00000481605 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.53■■■■□ 3.44
TTC3-217ENST00000481605 ERBINQ96RT1 1412 aa36.49■■■■□ 3.43
TTC3-217ENST00000481605 NLRP1Q9C000 1473 aa36.47■■■■□ 3.43
TTC3-217ENST00000481605 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.47■■■■□ 3.43
TTC3-217ENST00000481605 CEP152O94986 1710 aa36.44■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.43■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.42■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.41■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 ERVK-7P63135 1459 aa36.4■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
TTC3-217ENST00000481605 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.423e-9■■■■□ 21.4
TTC3-217ENST00000481605 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.425e-7■■□□□ 13.6
TTC3-217ENST00000481605 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
TTC3-217ENST00000481605 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.35■■■■□ 3.41
TTC3-217ENST00000481605 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.35■■■■□ 3.41
TTC3-217ENST00000481605 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.34■■■■□ 3.41
TTC3-217ENST00000481605 DEPDC5O75140 1603 aa36.34■■■■□ 3.41
TTC3-217ENST00000481605 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.31■■■■□ 3.4
TTC3-217ENST00000481605 KANK1Q14678 1352 aa36.31■■■■□ 3.4
TTC3-217ENST00000481605 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
TTC3-217ENST00000481605 ADGRL2O95490 1459 aa36.3■■■■□ 3.4
TTC3-217ENST00000481605 MED14O60244 1454 aa36.21■■■■□ 3.39
TTC3-217ENST00000481605 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
TTC3-217ENST00000481605 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.2■■■■□ 3.38
TTC3-217ENST00000481605 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.19■■■■□ 3.38
TTC3-217ENST00000481605 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.18■■■■□ 3.38
TTC3-217ENST00000481605 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.17■■■■□ 3.38
TTC3-217ENST00000481605 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
TTC3-217ENST00000481605 IQGAP1P46940 1657 aa36.12■■■■□ 3.37
TTC3-217ENST00000481605 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.12■■■■□ 3.37
TTC3-217ENST00000481605 CPS1P31327 1500 aa36.1■■■■□ 3.37
TTC3-217ENST00000481605 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.08■■■■□ 3.37
TTC3-217ENST00000481605 PIK3C2BO00750 1634 aa36.07■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.06■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 SLIT1O75093 1534 aa36.05■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.04■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 LTKP29376 864 aa36.03■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 IDI1Q13907 227 aa36.03■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.03■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 NOS1P29475 1434 aa36.02■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 ROCK1Q13464 1354 aa36.02■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 SYNMO15061 1565 aa36.01■■■■□ 3.36
TTC3-217ENST00000481605 ITGAEP38570 1179 aa35.99■■■■□ 3.35
TTC3-217ENST00000481605 EID1Q9Y6B2 187 aa35.99■■■■□ 3.35
TTC3-217ENST00000481605 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.98■■■■□ 3.35
TTC3-217ENST00000481605 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TTC3-217ENST00000481605 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
TTC3-217ENST00000481605 UNC13BO14795 1591 aa35.94■■■■□ 3.34
TTC3-217ENST00000481605 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.93■■■■□ 3.34
TTC3-217ENST00000481605 TET3O43151 1660 aa35.93■■■■□ 3.34
TTC3-217ENST00000481605 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.91■■■■□ 3.34
TTC3-217ENST00000481605 TOM1O60784 492 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC3-217ENST00000481605 ADGRB3O60242 1522 aa35.88■■■■□ 3.33
TTC3-217ENST00000481605 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
TTC3-217ENST00000481605 PIP4K2BP78356 416 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC3-217ENST00000481605 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC3-217ENST00000481605 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.85■■■■□ 3.33
TTC3-217ENST00000481605 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.82■■■■□ 3.33
TTC3-217ENST00000481605 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.8■■■■□ 3.32
TTC3-217ENST00000481605 NUP155O75694 1391 aa35.79■■■■□ 3.32
TTC3-217ENST00000481605 E9PCH4 1651 aa35.78■■■■□ 3.32
TTC3-217ENST00000481605 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
TTC3-217ENST00000481605 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.73■■■■□ 3.31
TTC3-217ENST00000481605 ALKQ9UM73 1620 aa35.73■■■■□ 3.31
TTC3-217ENST00000481605 HSPA1LP34931 641 aa35.72■■■■□ 3.31
TTC3-217ENST00000481605 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.71■■■■□ 3.31
TTC3-217ENST00000481605 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.69■■■■□ 3.3
TTC3-217ENST00000481605 ZFYVE9O95405 1425 aa35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms