RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
C9orf3-213ENST00000471978 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.39■■■■□ 3.26
C9orf3-213ENST00000471978 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.39■■■■□ 3.26
C9orf3-213ENST00000471978 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
C9orf3-213ENST00000471978 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.37■■■■□ 3.25
C9orf3-213ENST00000471978 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.33■■■■□ 3.25
C9orf3-213ENST00000471978 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
C9orf3-213ENST00000471978 PZPP20742 1482 aa35.31■■■■□ 3.24
C9orf3-213ENST00000471978 PLA2R1Q13018 1463 aa35.29■■■■□ 3.24
C9orf3-213ENST00000471978 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.29■■■■□ 3.24
C9orf3-213ENST00000471978 TNRQ92752 1358 aa35.28■■■■□ 3.24
C9orf3-213ENST00000471978 PKD2Q13563 968 aa35.28■■■■□ 3.24
C9orf3-213ENST00000471978 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.25■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.22■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 ABCC5O15440 1437 aa35.21■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.2■■■■□ 3.23
C9orf3-213ENST00000471978 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.19■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 ABCC3O15438 1527 aa35.18■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.18■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 KIF15Q9NS87 1388 aa35.16■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.16■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 DAPK1P53355 1430 aa35.15■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.14■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.14■■■■□ 3.22
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
C9orf3-213ENST00000471978 NLRP1Q9C000 1473 aa35.11■■■■□ 3.21
C9orf3-213ENST00000471978 ERBINQ96RT1 1412 aa35.08■■■■□ 3.21
C9orf3-213ENST00000471978 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.07■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 CEP152O94986 1710 aa35.05■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.04■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.04■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.22e-9■■■■■ 67.4
C9orf3-213ENST00000471978 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.04■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 ERVK-7P63135 1459 aa35.03■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.02■■■■□ 3.2
C9orf3-213ENST00000471978 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
C9orf3-213ENST00000471978 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35■■■■□ 3.19
C9orf3-213ENST00000471978 NEURL4Q96JN8 1562 aa35■■■■□ 3.19
C9orf3-213ENST00000471978 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.98■■■■□ 3.191e-6■■□□□ 11.7
C9orf3-213ENST00000471978 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
C9orf3-213ENST00000471978 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
C9orf3-213ENST00000471978 DEPDC5O75140 1603 aa34.93■■■■□ 3.18
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.92■■■■□ 3.18
C9orf3-213ENST00000471978 KANK1Q14678 1352 aa34.92■■■■□ 3.18
C9orf3-213ENST00000471978 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
C9orf3-213ENST00000471978 MED14O60244 1454 aa34.88■■■■□ 3.17
C9orf3-213ENST00000471978 ADGRL2O95490 1459 aa34.87■■■■□ 3.17
C9orf3-213ENST00000471978 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.85■■■■□ 3.17
C9orf3-213ENST00000471978 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.82■■■■□ 3.16
C9orf3-213ENST00000471978 CPS1P31327 1500 aa34.81■■■■□ 3.16
C9orf3-213ENST00000471978 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.81■■■■□ 3.16
C9orf3-213ENST00000471978 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.8■■■■□ 3.16
C9orf3-213ENST00000471978 IQGAP1P46940 1657 aa34.79■■■■□ 3.16
C9orf3-213ENST00000471978 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.74■■■■□ 3.15
C9orf3-213ENST00000471978 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.71■■■■□ 3.15
C9orf3-213ENST00000471978 SLIT1O75093 1534 aa34.71■■■■□ 3.15
C9orf3-213ENST00000471978 PIK3C2BO00750 1634 aa34.7■■■■□ 3.15
C9orf3-213ENST00000471978 LTKP29376 864 aa34.7■■■■□ 3.15
C9orf3-213ENST00000471978 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.69■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.69■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.69■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 IDI1Q13907 227 aa34.66■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 EID1Q9Y6B2 187 aa34.66■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 SYNMO15061 1565 aa34.64■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 NOS1P29475 1434 aa34.64■■■■□ 3.14
C9orf3-213ENST00000471978 TOM1O60784 492 aa34.63■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.62■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.62■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 ROCK1Q13464 1354 aa34.6■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.59■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 PIP4K2BP78356 416 aa34.58■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
C9orf3-213ENST00000471978 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.57■■■■□ 3.12
C9orf3-213ENST00000471978 ITGAEP38570 1179 aa34.55■■■■□ 3.12
C9orf3-213ENST00000471978 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.55■■■■□ 3.12
C9orf3-213ENST00000471978 TET3O43151 1660 aa34.54■■■■□ 3.12
C9orf3-213ENST00000471978 UNC13BO14795 1591 aa34.53■■■■□ 3.12
C9orf3-213ENST00000471978 ADGRB3O60242 1522 aa34.51■■■■□ 3.12
C9orf3-213ENST00000471978 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.47■■■■□ 3.11
C9orf3-213ENST00000471978 HSPA1LP34931 641 aa34.46■■■■□ 3.11
C9orf3-213ENST00000471978 ALKQ9UM73 1620 aa34.44■■■■□ 3.1
C9orf3-213ENST00000471978 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.41■■■■□ 3.1
C9orf3-213ENST00000471978 ILDR2Q71H61 639 aa34.4■■■■□ 3.1
C9orf3-213ENST00000471978 NUP155O75694 1391 aa34.39■■■■□ 3.1
C9orf3-213ENST00000471978 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.39■■■■□ 3.1
C9orf3-213ENST00000471978 E9PCH4 1651 aa34.38■■■■□ 3.09
C9orf3-213ENST00000471978 BCANQ96GW7 911 aa34.36■■■■□ 3.09
C9orf3-213ENST00000471978 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.33■■■■□ 3.09
C9orf3-213ENST00000471978 ZFYVE9O95405 1425 aa34.33■■■■□ 3.09
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