RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 CERKQ8TCT0 537 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 PZPP20742 1482 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 ABCC5O15440 1437 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRF-211ENST00000467464 PLA2R1Q13018 1463 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 ABCC3O15438 1527 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 APLP2Q06481 763 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 DAPK1P53355 1430 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 TNRQ92752 1358 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRF-211ENST00000467464 KIF15Q9NS87 1388 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 ERBINQ96RT1 1412 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 PKD2Q13563 968 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 NLRP1Q9C000 1473 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 ERVK-7P63135 1459 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRF-211ENST00000467464 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 DEPDC5O75140 1603 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 ADGRL2O95490 1459 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 CEP152O94986 1710 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 79.7
PTPRF-211ENST00000467464 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRF-211ENST00000467464 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRF-211ENST00000467464 MED14O60244 1454 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRF-211ENST00000467464 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRF-211ENST00000467464 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRF-211ENST00000467464 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRF-211ENST00000467464 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 KANK1Q14678 1352 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 SLIT1O75093 1534 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 NOS1P29475 1434 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 SYNMO15061 1565 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRF-211ENST00000467464 CPS1P31327 1500 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 ROCK1Q13464 1354 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 IQGAP1P46940 1657 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 PIK3C2BO00750 1634 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 LTKP29376 864 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 UNC13BO14795 1591 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 IDI1Q13907 227 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRF-211ENST00000467464 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 ALKQ9UM73 1620 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 TET3O43151 1660 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 ADGRB3O60242 1522 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRF-211ENST00000467464 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 EID1Q9Y6B2 187 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 ZFYVE9O95405 1425 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 ITGAEP38570 1179 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 E9PCH4 1651 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 NUP155O75694 1391 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 TOM1O60784 492 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 HSPA1LP34931 641 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 PIP4K2BP78356 416 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 NAIPQ13075 1403 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRF-211ENST00000467464 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.29■□□□□ 0.52
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