RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451154.5

USP42-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 42, humanhuman

TSL 5

Gene USP42, Length 520 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP42-204ENST00000451154 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.71■■■■■ 4.43
USP42-204ENST00000451154 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
USP42-204ENST00000451154 MIA2Q96PC5 1412 aa42.67■■■■■ 4.42
USP42-204ENST00000451154 APLP2Q06481 763 aa42.66■■■■■ 4.42
USP42-204ENST00000451154 PKD2Q13563 968 aa42.66■■■■■ 4.42
USP42-204ENST00000451154 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.65■■■■■ 4.42
USP42-204ENST00000451154 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.64■■■■■ 4.42
USP42-204ENST00000451154 PLA2R1Q13018 1463 aa42.62■■■■■ 4.41
USP42-204ENST00000451154 TNRQ92752 1358 aa42.62■■■■■ 4.41
USP42-204ENST00000451154 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.61■■■■■ 4.41
USP42-204ENST00000451154 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.61■■■■■ 4.41
USP42-204ENST00000451154 PZPP20742 1482 aa42.59■■■■■ 4.41
USP42-204ENST00000451154 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.58■■■■■ 4.41
USP42-204ENST00000451154 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
USP42-204ENST00000451154 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
USP42-204ENST00000451154 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
USP42-204ENST00000451154 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
USP42-204ENST00000451154 ABCC5O15440 1437 aa42.43■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.42■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 ABCC3O15438 1527 aa42.41■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.41■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.4■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.39■■■■■ 4.38
USP42-204ENST00000451154 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.38■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 KIF15Q9NS87 1388 aa42.37■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 NLRP1Q9C000 1473 aa42.36■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.35■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.35■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.34■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
USP42-204ENST00000451154 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.31■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 DAPK1P53355 1430 aa42.31■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.31■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.3■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.29■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 CEP152O94986 1710 aa42.29■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.28■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.26■■■■■ 4.36
USP42-204ENST00000451154 ERVK-7P63135 1459 aa42.25■■■■■ 4.35
USP42-204ENST00000451154 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.25■■■■■ 4.35
USP42-204ENST00000451154 ERBINQ96RT1 1412 aa42.22■■■■■ 4.35
USP42-204ENST00000451154 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.16■■■■■ 4.34
USP42-204ENST00000451154 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
USP42-204ENST00000451154 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
USP42-204ENST00000451154 MED14O60244 1454 aa42.12■■■■■ 4.33
USP42-204ENST00000451154 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
USP42-204ENST00000451154 DEPDC5O75140 1603 aa42.11■■■■■ 4.33
USP42-204ENST00000451154 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.11■■■■■ 4.33
USP42-204ENST00000451154 KANK1Q14678 1352 aa42.08■■■■■ 4.33
USP42-204ENST00000451154 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.07■■■■■ 4.33
USP42-204ENST00000451154 CPS1P31327 1500 aa42.05■■■■■ 4.32
USP42-204ENST00000451154 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.04■■■■■ 4.32
USP42-204ENST00000451154 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.03■■■■■ 4.32
USP42-204ENST00000451154 IQGAP1P46940 1657 aa42.02■■■■■ 4.32
USP42-204ENST00000451154 LTKP29376 864 aa41.97■■■■■ 4.31
USP42-204ENST00000451154 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.96■■■■■ 4.31
USP42-204ENST00000451154 ADGRL2O95490 1459 aa41.95■■■■■ 4.31
USP42-204ENST00000451154 TOM1O60784 492 aa41.94■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 PIP4K2BP78356 416 aa41.94■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.91■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.91■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 IDI1Q13907 227 aa41.89■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 ILDR2Q71H61 639 aa41.89■■■■■ 4.3
USP42-204ENST00000451154 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.88■■■■■ 4.29
USP42-204ENST00000451154 EID1Q9Y6B2 187 aa41.87■■■■■ 4.29
USP42-204ENST00000451154 PIK3C2BO00750 1634 aa41.87■■■■■ 4.29
USP42-204ENST00000451154 SLIT1O75093 1534 aa41.86■■■■■ 4.29
USP42-204ENST00000451154 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.86■■■■■ 4.29
USP42-204ENST00000451154 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.85■■■■■ 4.29
USP42-204ENST00000451154 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.8■■■■■ 4.28
USP42-204ENST00000451154 HSPA1LP34931 641 aa41.8■■■■■ 4.28
USP42-204ENST00000451154 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
USP42-204ENST00000451154 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.77■■■■■ 4.28
USP42-204ENST00000451154 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.77■■■■■ 4.28
USP42-204ENST00000451154 NOS1P29475 1434 aa41.77■■■■■ 4.28
USP42-204ENST00000451154 SYNMO15061 1565 aa41.76■■■■■ 4.28
USP42-204ENST00000451154 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.71■■■■■ 4.27
USP42-204ENST00000451154 ALKQ9UM73 1620 aa41.69■■■■■ 4.26
USP42-204ENST00000451154 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
USP42-204ENST00000451154 ITGAEP38570 1179 aa41.66■■■■■ 4.26
USP42-204ENST00000451154 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
USP42-204ENST00000451154 ROCK1Q13464 1354 aa41.62■■■■■ 4.25
USP42-204ENST00000451154 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.61■■■■■ 4.25
USP42-204ENST00000451154 TET3O43151 1660 aa41.59■■■■■ 4.25
USP42-204ENST00000451154 ADGRB3O60242 1522 aa41.59■■■■■ 4.25
USP42-204ENST00000451154 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
USP42-204ENST00000451154 SOCS7O14512 581 aa41.54■■■■■ 4.24
USP42-204ENST00000451154 BCANQ96GW7 911 aa41.54■■■■■ 4.24
USP42-204ENST00000451154 UNC13BO14795 1591 aa41.54■■■■■ 4.24
USP42-204ENST00000451154 KCNA6P17658 529 aa41.52■■■■■ 4.24
USP42-204ENST00000451154 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.23
USP42-204ENST00000451154 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.5■■■■■ 4.23
USP42-204ENST00000451154 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.48■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms