RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 ERBINQ96RT1 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 PLA2R1Q13018 1463 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 BCANQ96GW7 911 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 MRS2Q9HD23 443 aa24.55■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN9-201ENST00000445369 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.51■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 ATP10AO60312 1499 aa24.51■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 E9PCH4 1651 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 A2MP01023 1474 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 LAMC1P11047 1609 aa24.48■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.48■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
CLDN9-201ENST00000445369 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.45■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.45■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.45■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.44■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.43■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.42■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.41■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.41■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CLDN9-201ENST00000445369 DEPDC5O75140 1603 aa24.39■■□□□ 1.49
CLDN9-201ENST00000445369 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CLDN9-201ENST00000445369 RGL3Q3MIN7 710 aa24.36■■□□□ 1.49
CLDN9-201ENST00000445369 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CLDN9-201ENST00000445369 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CLDN9-201ENST00000445369 OSCARQ8IYS5 282 aa24.34■■□□□ 1.49
CLDN9-201ENST00000445369 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.32■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.32■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 CEP152O94986 1710 aa24.32■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 TRPM2O94759 1503 aa24.31■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 ATP7AQ04656 1500 aa24.31■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 FANCAO15360 1455 aa24.31■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 AFAP1Q8N556 730 aa24.3■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 TET3O43151 1660 aa24.3■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 MADDQ8WXG6 1647 aa24.27■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.27■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.27■■□□□ 1.48
CLDN9-201ENST00000445369 PTPRTO14522 1441 aa24.26■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 RALBP1Q15311 655 aa24.25■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 CLTCL1P53675 1640 aa24.25■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 ADGRL1O94910 1474 aa24.23■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 TESK2Q96S53 571 aa24.23■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 IQGAP1P46940 1657 aa24.22■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 ASXL2Q76L83 1435 aa24.22■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.21■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 TMC1Q8TDI8 760 aa24.2■■□□□ 1.47
CLDN9-201ENST00000445369 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.2■■□□□ 1.46
CLDN9-201ENST00000445369 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.2■■□□□ 1.46
CLDN9-201ENST00000445369 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.19■■□□□ 1.46
CLDN9-201ENST00000445369 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.17■■□□□ 1.46
CLDN9-201ENST00000445369 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CLDN9-201ENST00000445369 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.16■■□□□ 1.46
CLDN9-201ENST00000445369 KANK1Q14678 1352 aa24.15■■□□□ 1.46
CLDN9-201ENST00000445369 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.13■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 NUDCQ9Y266 331 aa24.13■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 STAC3Q96MF2 364 aa24.12■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.12■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.11■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 TMF1P82094 1093 aa24.11■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 NLRP13Q86W25 1043 aa24.1■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.09■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 KIF3BO15066 747 aa24.09■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.08■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.08■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.06■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 KIF1BO60333 1816 aa24.06■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 IFT172Q9UG01 1749 aa24.05■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.05■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 PANK3Q9H999 370 aa24.04■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.03■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.03■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.03■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 MYOM2P54296 1465 aa24.03■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 SYNMO15061 1565 aa24.02■■□□□ 1.44
CLDN9-201ENST00000445369 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.01■■□□□ 1.43
CLDN9-201ENST00000445369 MROH2AA6NES4 1674 aa24.01■■□□□ 1.43
CLDN9-201ENST00000445369 ABCA6Q8N139 1617 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms