RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.11■■■■□ 3.69
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.75■■■□□ 2.83
CLDN9-201ENST00000445369 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CLDN9-201ENST00000445369 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.91■■■□□ 2.7
CLDN9-201ENST00000445369 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.44■■■□□ 2.62
CLDN9-201ENST00000445369 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.21■■■□□ 2.59
CLDN9-201ENST00000445369 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CLDN9-201ENST00000445369 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.67■■■□□ 2.5
CLDN9-201ENST00000445369 ABCC9O60706 1549 aa30.38■■■□□ 2.45
CLDN9-201ENST00000445369 SCRIBQ14160 1630 aa30.38■■■□□ 2.45
CLDN9-201ENST00000445369 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.27■■■□□ 2.44
CLDN9-201ENST00000445369 NACADO15069 1562 aa30.25■■■□□ 2.43
CLDN9-201ENST00000445369 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CLDN9-201ENST00000445369 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.78■■■□□ 2.36
CLDN9-201ENST00000445369 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
CLDN9-201ENST00000445369 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.55■■■□□ 2.32
CLDN9-201ENST00000445369 WIZO95785 1651 aa29.4■■■□□ 2.3
CLDN9-201ENST00000445369 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.39■■■□□ 2.3
CLDN9-201ENST00000445369 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CLDN9-201ENST00000445369 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.21■■■□□ 2.27
CLDN9-201ENST00000445369 SMARCA4P51532 1647 aa29.12■■■□□ 2.25
CLDN9-201ENST00000445369 TRIM41Q8WV44 630 aa29.11■■■□□ 2.25
CLDN9-201ENST00000445369 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CLDN9-201ENST00000445369 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CLDN9-201ENST00000445369 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.97■■■□□ 2.23
CLDN9-201ENST00000445369 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.88■■■□□ 2.21
CLDN9-201ENST00000445369 SMARCA2P51531 1590 aa28.82■■■□□ 2.2
CLDN9-201ENST00000445369 HRCP23327 699 aa28.81■■■□□ 2.2
CLDN9-201ENST00000445369 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.77■■■□□ 2.2
CLDN9-201ENST00000445369 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CLDN9-201ENST00000445369 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.68■■■□□ 2.18
CLDN9-201ENST00000445369 ABCC8Q09428 1581 aa28.56■■■□□ 2.16
CLDN9-201ENST00000445369 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CLDN9-201ENST00000445369 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.38■■■□□ 2.13
CLDN9-201ENST00000445369 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.34■■■□□ 2.13
CLDN9-201ENST00000445369 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CLDN9-201ENST00000445369 SOGA1O94964 1423 aa28.18■■■□□ 2.1
CLDN9-201ENST00000445369 EEA1Q15075 1411 aa28.18■■■□□ 2.1
CLDN9-201ENST00000445369 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
CLDN9-201ENST00000445369 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CLDN9-201ENST00000445369 SYNJ1O43426 1573 aa28.07■■■□□ 2.08
CLDN9-201ENST00000445369 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.05■■■□□ 2.08
CLDN9-201ENST00000445369 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.99■■■□□ 2.07
CLDN9-201ENST00000445369 HMGXB3Q12766 1538 aa27.98■■■□□ 2.07
CLDN9-201ENST00000445369 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.98■■■□□ 2.07
CLDN9-201ENST00000445369 CEP162Q5TB80 1403 aa27.97■■■□□ 2.07
CLDN9-201ENST00000445369 NCAPD3P42695 1498 aa27.92■■■□□ 2.06
CLDN9-201ENST00000445369 GOLGA3Q08378 1498 aa27.91■■■□□ 2.06
CLDN9-201ENST00000445369 KIF21BO75037 1637 aa27.85■■■□□ 2.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CLDN9-201ENST00000445369 TOP2BQ02880 1626 aa27.83■■■□□ 2.05
CLDN9-201ENST00000445369 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.79■■■□□ 2.04
CLDN9-201ENST00000445369 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.79■■■□□ 2.04
CLDN9-201ENST00000445369 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CLDN9-201ENST00000445369 CFTRP13569 1480 aa27.6■■■□□ 2.01
CLDN9-201ENST00000445369 PRDM2Q13029 1718 aa27.58■■■□□ 2.01
CLDN9-201ENST00000445369 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.56■■■□□ 2
CLDN9-201ENST00000445369 CUX1P39880 1505 aa27.56■■■□□ 2
CLDN9-201ENST00000445369 CLIP1P30622 1438 aa27.51■■□□□ 1.99
CLDN9-201ENST00000445369 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
CLDN9-201ENST00000445369 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.44■■□□□ 1.98
CLDN9-201ENST00000445369 PRXQ9BXM0 1461 aa27.42■■□□□ 1.98
CLDN9-201ENST00000445369 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.4■■□□□ 1.98
CLDN9-201ENST00000445369 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CLDN9-201ENST00000445369 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CLDN9-201ENST00000445369 KIF27Q86VH2 1401 aa27.32■■□□□ 1.96
CLDN9-201ENST00000445369 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.29■■□□□ 1.96
CLDN9-201ENST00000445369 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CLDN9-201ENST00000445369 ARAP1Q96P48 1450 aa27.16■■□□□ 1.94
CLDN9-201ENST00000445369 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CLDN9-201ENST00000445369 CUX2O14529 1486 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN9-201ENST00000445369 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN9-201ENST00000445369 APLP2Q06481 763 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN9-201ENST00000445369 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.03■■□□□ 1.92
CLDN9-201ENST00000445369 IGF1RP08069 1367 aa27■■□□□ 1.91
CLDN9-201ENST00000445369 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.97■■□□□ 1.91
CLDN9-201ENST00000445369 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.96■■□□□ 1.91
CLDN9-201ENST00000445369 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CLDN9-201ENST00000445369 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.88■■□□□ 1.89
CLDN9-201ENST00000445369 NESP48681 1621 aa26.86■■□□□ 1.89
CLDN9-201ENST00000445369 TOPBP1Q92547 1522 aa26.86■■□□□ 1.89
CLDN9-201ENST00000445369 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.83■■□□□ 1.89
CLDN9-201ENST00000445369 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.83■■□□□ 1.88
CLDN9-201ENST00000445369 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CLDN9-201ENST00000445369 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CLDN9-201ENST00000445369 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.77■■□□□ 1.88
CLDN9-201ENST00000445369 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CLDN9-201ENST00000445369 WDR97A6NE52 1622 aa26.73■■□□□ 1.87
CLDN9-201ENST00000445369 CUL7Q14999 1698 aa26.71■■□□□ 1.87
CLDN9-201ENST00000445369 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.71■■□□□ 1.87
CLDN9-201ENST00000445369 MAP3K1Q13233 1512 aa26.71■■□□□ 1.87
CLDN9-201ENST00000445369 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CLDN9-201ENST00000445369 TIAM1Q13009 1591 aa26.68■■□□□ 1.86
CLDN9-201ENST00000445369 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.62■■□□□ 1.85
CLDN9-201ENST00000445369 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CLDN9-201ENST00000445369 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.59■■□□□ 1.85
CLDN9-201ENST00000445369 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN9-201ENST00000445369 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN9-201ENST00000445369 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 152.3 ms