RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.49■■■□□ 2.47
NPAS1-201ENST00000439365 PTPRTO14522 1441 aa30.47■■■□□ 2.47
NPAS1-201ENST00000439365 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
NPAS1-201ENST00000439365 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.46■■■□□ 2.47
NPAS1-201ENST00000439365 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
NPAS1-201ENST00000439365 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.45■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.44■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.43■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 TNRQ92752 1358 aa30.42■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 PZPP20742 1482 aa30.41■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 ABCC5O15440 1437 aa30.41■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.41■■■□□ 2.46
NPAS1-201ENST00000439365 KIF15Q9NS87 1388 aa30.38■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.38■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 PKD2Q13563 968 aa30.37■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.37■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.37■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 DAPK1P53355 1430 aa30.37■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.36■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 PLA2R1Q13018 1463 aa30.34■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.34■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
NPAS1-201ENST00000439365 ABCC3O15438 1527 aa30.32■■■□□ 2.44
NPAS1-201ENST00000439365 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
NPAS1-201ENST00000439365 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
NPAS1-201ENST00000439365 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
NPAS1-201ENST00000439365 ERBINQ96RT1 1412 aa30.28■■■□□ 2.44
NPAS1-201ENST00000439365 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.28■■■□□ 2.44
NPAS1-201ENST00000439365 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.25■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 NLRP1Q9C000 1473 aa30.24■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 CEP152O94986 1710 aa30.22■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.22■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.21■■■□□ 2.43
NPAS1-201ENST00000439365 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.2■■■□□ 2.42
NPAS1-201ENST00000439365 KANK1Q14678 1352 aa30.19■■■□□ 2.42
NPAS1-201ENST00000439365 ERVK-7P63135 1459 aa30.19■■■□□ 2.42
NPAS1-201ENST00000439365 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.17■■■□□ 2.42
NPAS1-201ENST00000439365 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
NPAS1-201ENST00000439365 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
NPAS1-201ENST00000439365 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
NPAS1-201ENST00000439365 ADGRL2O95490 1459 aa30.09■■■□□ 2.41
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.09■■■□□ 2.41
NPAS1-201ENST00000439365 DEPDC5O75140 1603 aa30.09■■■□□ 2.41
NPAS1-201ENST00000439365 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.08■■■□□ 2.41
NPAS1-201ENST00000439365 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.08■■■□□ 2.41
NPAS1-201ENST00000439365 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
NPAS1-201ENST00000439365 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.03■■■□□ 2.4
NPAS1-201ENST00000439365 ITGAEP38570 1179 aa30.02■■■□□ 2.4
NPAS1-201ENST00000439365 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.02■■■□□ 2.4
NPAS1-201ENST00000439365 UBAP1LF5GYI3 381 aa30■■■□□ 2.39
NPAS1-201ENST00000439365 MED14O60244 1454 aa29.99■■■□□ 2.39
NPAS1-201ENST00000439365 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.98■■■□□ 2.39
NPAS1-201ENST00000439365 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.97■■■□□ 2.39
NPAS1-201ENST00000439365 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.97■■■□□ 2.39
NPAS1-201ENST00000439365 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.95■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 IQGAP1P46940 1657 aa29.94■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 EID1Q9Y6B2 187 aa29.94■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 CPS1P31327 1500 aa29.92■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.92■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 IDI1Q13907 227 aa29.92■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 PIK3C2BO00750 1634 aa29.91■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 LTKP29376 864 aa29.9■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 ROCK1Q13464 1354 aa29.89■■■□□ 2.38
NPAS1-201ENST00000439365 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
NPAS1-201ENST00000439365 SLIT1O75093 1534 aa29.86■■■□□ 2.37
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.85■■■□□ 2.37
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.85■■■□□ 2.37
NPAS1-201ENST00000439365 SYNMO15061 1565 aa29.84■■■□□ 2.37
NPAS1-201ENST00000439365 NOS1P29475 1434 aa29.84■■■□□ 2.37
NPAS1-201ENST00000439365 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.83■■■□□ 2.37
NPAS1-201ENST00000439365 TOM1O60784 492 aa29.82■■■□□ 2.36
NPAS1-201ENST00000439365 PIP4K2BP78356 416 aa29.82■■■□□ 2.36
NPAS1-201ENST00000439365 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
NPAS1-201ENST00000439365 TET3O43151 1660 aa29.79■■■□□ 2.36
NPAS1-201ENST00000439365 UNC13BO14795 1591 aa29.79■■■□□ 2.36
NPAS1-201ENST00000439365 NUP155O75694 1391 aa29.76■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 BCANQ96GW7 911 aa29.75■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 ADGRB3O60242 1522 aa29.75■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.74■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.72■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.71■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.71■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
NPAS1-201ENST00000439365 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.7■■■□□ 2.34
NPAS1-201ENST00000439365 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
NPAS1-201ENST00000439365 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.68■■■□□ 2.34
NPAS1-201ENST00000439365 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
NPAS1-201ENST00000439365 E9PCH4 1651 aa29.66■■■□□ 2.34
NPAS1-201ENST00000439365 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
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