RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 TMC1Q8TDI8 760 aa20■□□□□ 0.79
TOP3B-206ENST00000436282 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TOP3B-206ENST00000436282 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.795e-7■□□□□ 9.8
TOP3B-206ENST00000436282 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.97■□□□□ 0.79
TOP3B-206ENST00000436282 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3B-206ENST00000436282 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.96■□□□□ 0.79
TOP3B-206ENST00000436282 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 CHD1O14646 1710 aa19.95■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.94■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.93■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.91■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 E9PCH4 1651 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 RGL3Q3MIN7 710 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.9■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 RALBP1Q15311 655 aa19.89■□□□□ 0.78
TOP3B-206ENST00000436282 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.88■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.87■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.86■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 MS4A1P11836 297 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 PREX2Q70Z35 1606 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 PDE4AP27815 886 aa19.85■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.775e-7■□□□□ 8.9
TOP3B-206ENST00000436282 PDE3BQ13370 1112 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 USP35Q9P2H5 1018 aa19.83■□□□□ 0.77
TOP3B-206ENST00000436282 BACH2Q9BYV9 841 aa19.83■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.82■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC2Q92887 1545 aa19.81■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.8■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 SHROOM2Q13796 1616 aa19.79■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 NLRP13Q86W25 1043 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.78■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 NEFMP07197 916 aa19.77■□□□□ 0.76
TOP3B-206ENST00000436282 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 INSRP06213 1382 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 IL27Q8NEV9 243 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 PLA2R1Q13018 1463 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3B-206ENST00000436282 PLCH2O75038 1416 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 AFAP1Q8N556 730 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.68■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.68■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.67■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 A2MP01023 1474 aa19.65■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.64■□□□□ 0.74
TOP3B-206ENST00000436282 CRBNQ96SW2 442 aa19.64■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 UNC13BO14795 1591 aa19.64■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 PLIN1O60240 522 aa19.64■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.63■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 LAMC1P11047 1609 aa19.61■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 PLXNC1O60486 1568 aa19.61■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.6■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 ERBINQ96RT1 1412 aa19.6■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa19.6■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 IQGAP3Q86VI3 1631 aa19.58■□□□□ 0.73
TOP3B-206ENST00000436282 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC1P33527 1531 aa19.58■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 SKAP1Q86WV1 359 aa19.57■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.57■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 GSE1Q14687 1217 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 TESK2Q96S53 571 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 KIF3BO15066 747 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 NFKBIBQ15653 356 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 PANK3Q9H999 370 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 TMF1P82094 1093 aa19.52■□□□□ 0.72
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