RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 TNRQ92752 1358 aa31.3■■■□□ 2.6
LTB-210ENST00000429299 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
LTB-210ENST00000429299 PIP4K2BP78356 416 aa31.28■■■□□ 2.6
LTB-210ENST00000429299 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.28■■■□□ 2.6
LTB-210ENST00000429299 CPS1P31327 1500 aa31.28■■■□□ 2.6
LTB-210ENST00000429299 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.26■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.26■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 TIAM1Q13009 1591 aa31.26■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.24■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 PZPP20742 1482 aa31.23■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 CEP162Q5TB80 1403 aa31.22■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.21■■■□□ 2.59
LTB-210ENST00000429299 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.2■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.19■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.19■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.18■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 MIA2Q96PC5 1412 aa31.18■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.15■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 NLRP1Q9C000 1473 aa31.15■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
LTB-210ENST00000429299 MED14O60244 1454 aa31.12■■■□□ 2.57
LTB-210ENST00000429299 TSPY4P0CV99 314 aa31.11■■■□□ 2.57
LTB-210ENST00000429299 TSPY10P0CW01 314 aa31.11■■■□□ 2.57
LTB-210ENST00000429299 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.1■■■□□ 2.57
LTB-210ENST00000429299 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
LTB-210ENST00000429299 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.09■■■□□ 2.57
LTB-210ENST00000429299 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.07■■■□□ 2.56
LTB-210ENST00000429299 DEPDC5O75140 1603 aa31.06■■■□□ 2.56
LTB-210ENST00000429299 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
LTB-210ENST00000429299 NCOA2Q15596 1464 aa31.04■■■□□ 2.56
LTB-210ENST00000429299 ALKQ9UM73 1620 aa30.98■■■□□ 2.55
LTB-210ENST00000429299 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.97■■■□□ 2.55
LTB-210ENST00000429299 IQGAP1P46940 1657 aa30.96■■■□□ 2.55
LTB-210ENST00000429299 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.93■■■□□ 2.54
LTB-210ENST00000429299 ABCC3O15438 1527 aa30.91■■■□□ 2.54
LTB-210ENST00000429299 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
LTB-210ENST00000429299 ERVK-7P63135 1459 aa30.88■■■□□ 2.53
LTB-210ENST00000429299 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.87■■■□□ 2.53
LTB-210ENST00000429299 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
LTB-210ENST00000429299 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
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LTB-210ENST00000429299 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.83■■■□□ 2.53
LTB-210ENST00000429299 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.81■■■□□ 2.52
LTB-210ENST00000429299 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
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LTB-210ENST00000429299 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
LTB-210ENST00000429299 EID1Q9Y6B2 187 aa30.77■■■□□ 2.52
LTB-210ENST00000429299 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
LTB-210ENST00000429299 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-210ENST00000429299 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-210ENST00000429299 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.75■■■□□ 2.51
LTB-210ENST00000429299 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.74■■■□□ 2.51
LTB-210ENST00000429299 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
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LTB-210ENST00000429299 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.73■■■□□ 2.51
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LTB-210ENST00000429299 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.64■■■□□ 2.5
LTB-210ENST00000429299 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.64■■■□□ 2.5
LTB-210ENST00000429299 KIF15Q9NS87 1388 aa30.63■■■□□ 2.49
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LTB-210ENST00000429299 ERBINQ96RT1 1412 aa30.6■■■□□ 2.49
LTB-210ENST00000429299 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.49
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LTB-210ENST00000429299 TMEM94Q12767 1356 aa30.57■■■□□ 2.48
LTB-210ENST00000429299 KANK1Q14678 1352 aa30.56■■■□□ 2.48
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LTB-210ENST00000429299 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
LTB-210ENST00000429299 PIK3C2BO00750 1634 aa30.54■■■□□ 2.48
LTB-210ENST00000429299 ABCC5O15440 1437 aa30.53■■■□□ 2.48
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LTB-210ENST00000429299 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.51■■■□□ 2.47
LTB-210ENST00000429299 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.5■■■□□ 2.47
LTB-210ENST00000429299 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
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LTB-210ENST00000429299 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
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LTB-210ENST00000429299 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.42■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 DAPK1P53355 1430 aa30.42■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 SLAIN2Q9P270 581 aa30.41■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.41■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.41■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 BCANQ96GW7 911 aa30.4■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 MSH6P52701 1360 aa30.4■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.39■■■□□ 2.46
LTB-210ENST00000429299 NOS1P29475 1434 aa30.39■■■□□ 2.45
LTB-210ENST00000429299 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.38■■■□□ 2.45
LTB-210ENST00000429299 APLP2Q06481 763 aa30.36■■■□□ 2.45
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