RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
LMO1-202ENST00000428101 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.73■■■■■ 4.43
LMO1-202ENST00000428101 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.72■■■■■ 4.43
LMO1-202ENST00000428101 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.43
LMO1-202ENST00000428101 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.69■■■■■ 4.42
LMO1-202ENST00000428101 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.67■■■■■ 4.42
LMO1-202ENST00000428101 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
LMO1-202ENST00000428101 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
LMO1-202ENST00000428101 PZPP20742 1482 aa42.63■■■■■ 4.42
LMO1-202ENST00000428101 ABCC5O15440 1437 aa42.61■■■■■ 4.41
LMO1-202ENST00000428101 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
LMO1-202ENST00000428101 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.59■■■■■ 4.41
LMO1-202ENST00000428101 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.59■■■■■ 4.41
LMO1-202ENST00000428101 PLA2R1Q13018 1463 aa42.58■■■■■ 4.41
LMO1-202ENST00000428101 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.57■■■■■ 4.41
LMO1-202ENST00000428101 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.57■■■■■ 4.41
LMO1-202ENST00000428101 TNRQ92752 1358 aa42.56■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.55■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.55■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.52■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 ABCC3O15438 1527 aa42.51■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 PKD2Q13563 968 aa42.51■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 DAPK1P53355 1430 aa42.51■■■■■ 4.4
LMO1-202ENST00000428101 KIF15Q9NS87 1388 aa42.49■■■■■ 4.39
LMO1-202ENST00000428101 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.49■■■■■ 4.39
LMO1-202ENST00000428101 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
LMO1-202ENST00000428101 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.46■■■■■ 4.39
LMO1-202ENST00000428101 ERBINQ96RT1 1412 aa42.39■■■■■ 4.38
LMO1-202ENST00000428101 CEP152O94986 1710 aa42.39■■■■■ 4.38
LMO1-202ENST00000428101 NLRP1Q9C000 1473 aa42.37■■■■■ 4.37
LMO1-202ENST00000428101 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.35■■■■■ 4.37
LMO1-202ENST00000428101 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.34■■■■■ 4.37
LMO1-202ENST00000428101 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
LMO1-202ENST00000428101 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
LMO1-202ENST00000428101 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 ERVK-7P63135 1459 aa42.3■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.3■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.29■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.27■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 DEPDC5O75140 1603 aa42.27■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.27■■■■■ 4.36
LMO1-202ENST00000428101 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.25■■■■■ 4.35
LMO1-202ENST00000428101 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
LMO1-202ENST00000428101 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.22■■■■■ 4.35
LMO1-202ENST00000428101 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.21■■■■■ 4.35
LMO1-202ENST00000428101 ADGRL2O95490 1459 aa42.21■■■■■ 4.35
LMO1-202ENST00000428101 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.2■■■■■ 4.35
LMO1-202ENST00000428101 KANK1Q14678 1352 aa42.13■■■■■ 4.33
LMO1-202ENST00000428101 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.12■■■■■ 4.33
LMO1-202ENST00000428101 MED14O60244 1454 aa42.11■■■■■ 4.33
LMO1-202ENST00000428101 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.09■■■■■ 4.33
LMO1-202ENST00000428101 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.09■■■■■ 4.33
LMO1-202ENST00000428101 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
LMO1-202ENST00000428101 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.01■■■■■ 4.32
LMO1-202ENST00000428101 IQGAP1P46940 1657 aa42■■■■■ 4.31
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LMO1-202ENST00000428101 CPS1P31327 1500 aa41.95■■■■■ 4.31
LMO1-202ENST00000428101 PIK3C2BO00750 1634 aa41.94■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.94■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.92■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 SLIT1O75093 1534 aa41.92■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.92■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 LTKP29376 864 aa41.89■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 SYNMO15061 1565 aa41.88■■■■■ 4.3
LMO1-202ENST00000428101 NOS1P29475 1434 aa41.88■■■■■ 4.3
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LMO1-202ENST00000428101 ROCK1Q13464 1354 aa41.87■■■■■ 4.29
LMO1-202ENST00000428101 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.85■■■■■ 4.29
LMO1-202ENST00000428101 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
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LMO1-202ENST00000428101 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.8■■■■■ 4.28
LMO1-202ENST00000428101 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.8■■■■■ 4.28
LMO1-202ENST00000428101 UNC13BO14795 1591 aa41.8■■■■■ 4.28
LMO1-202ENST00000428101 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
LMO1-202ENST00000428101 TET3O43151 1660 aa41.77■■■■■ 4.28
LMO1-202ENST00000428101 EID1Q9Y6B2 187 aa41.77■■■■■ 4.28
LMO1-202ENST00000428101 ITGAEP38570 1179 aa41.75■■■■■ 4.27
LMO1-202ENST00000428101 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.73■■■■■ 4.27
LMO1-202ENST00000428101 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.71■■■■■ 4.27
LMO1-202ENST00000428101 ADGRB3O60242 1522 aa41.69■■■■■ 4.27
LMO1-202ENST00000428101 TOM1O60784 492 aa41.67■■■■■ 4.26
LMO1-202ENST00000428101 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.67■■■■■ 4.26
LMO1-202ENST00000428101 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.63■■■■■ 4.26
LMO1-202ENST00000428101 E9PCH4 1651 aa41.61■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 ALKQ9UM73 1620 aa41.61■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 PIP4K2BP78356 416 aa41.6■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.58■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 NUP155O75694 1391 aa41.57■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.57■■■■■ 4.25
LMO1-202ENST00000428101 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.53■■■■■ 4.24
LMO1-202ENST00000428101 ZFYVE9O95405 1425 aa41.5■■■■■ 4.23
LMO1-202ENST00000428101 HSPA1LP34931 641 aa41.49■■■■■ 4.23
LMO1-202ENST00000428101 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.48■■■■■ 4.23
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